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docs/菌群知识库/categories/技术/1001_可用于分析微生物与代谢产物之间相互作用的人工神经网络.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["81"]
 date: "2026-11-18"
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 scraped: "2026-08-10T08:00:33.484Z"
 ---
 
@@ -23,7 +23,7 @@ representations of microbe–metabolite
 
 Interactions（可用于分析微生物与代谢产物之间相互作用的人工神经网络）”，此项研究恢复微生物与代谢物之间关系的能力，并证明了该方法如何发现微生物产生的代谢产物与炎症性肠病之间的关系。
 
-![](../images/1001_2.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1001_2.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2019/11/1-1024x589.png)
 
@@ -39,9 +39,9 @@ Interactions（可用于分析微生物与代谢产物之间相互作用的人
 
 1.使用模拟囊性纤维化生物膜的数据集，将mmvec与Pearson’s、Spearman’s、SPIEC-EASI、SparCC和proportionality方法进行基准比较。证明了**mmvec****优于所有旨在推断成对微生物-代谢物丰度数据集之间相互作用的现有工具。**
 
-![](../images/1001_4.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1001_4.jpg)
 
-![](../images/1001_5.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1001_5.jpg)
 
 图a.两个微生物和多个分子之间的相互作用被模拟成单分子动力学和扩散过程，（发酵剂由θf表示，铜绿假单胞菌由θp表示）从推导的微分方程模拟的微生物和代谢物的绝对丰度，图b.
 为图a.中绝对丰度的比例。这里模拟了五种代谢物，即糖(SG)、抑制剂(I)、酸(F)、铵(P)和氨基酸(SA)
@@ -53,7 +53,7 @@ F1 score、precision（精确率）和recall curves（召回率）比较了mmvec
 
 2.沙漠土壤生物润湿事件，测试mmvec是否可以解决微生物-代谢物相互作用中无法解释的差异。结果是**mmvec解决了阴道分枝杆菌释放的体外验证代谢物与环境样品的测序和质谱分析之间的冲突发现。**
 
-![](../images/1001_6.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1001_6.jpg)
 
 图a. 阴道分枝杆菌-代谢物相互作用的比较，根据Spearman‘s和mmvec估计(n = 19个样品)。由阴道分枝杆菌释放的所有经实验验证的代谢物都被标记。所有与生物润湿实验结果和体外实验结果相矛盾的代谢物都用红色突出显示。Spearman‘s标记的13个标签中有7个具有负相关性，表明这些分子被阴道分枝杆菌消耗而不是释放。
 
@@ -65,7 +65,7 @@ MMVEC和Spearman‘s之间的冲突结果可以用生物润湿后微生物生物
 
 3. 囊性纤维化患者的肺粘液微生物组研究，进一步验证mmvec是否可以检测已知的微生物-代谢物相互作用。结果表明**mmvec可以可靠地识别由铜绿假单胞菌产生的所有经实验验证的感兴趣的分子**
 
-![](../images/1001_7.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1001_7.jpg)
 
 图a.依据mmvec在囊性纤维化数据集中估计的条件概率做的双标图。箭头代表微生物，圆点代表代谢物。x轴和y轴表示由mmvec (n = 138个样本)估计的微生物代谢产物的条件概率的奇异值分解(SVD)的主成分(PCs)。点之间的距离量化了代谢物之间的共现强度，较小的距离表明代谢物有很高的共现概率。箭头尖端之间的距离可以量化微生物之间的共现强度。箭头的方向性可以用来确定哪些微生物可以解释代谢产物的共现模式。绿色箭头表示推测的囊性纤维化病原体，黄色箭头表示已知的厌氧菌。只有铜绿假单胞菌产生的已知分子被标记。mmvec清楚地分离了厌氧菌和病原体，左侧是已知的厌氧微生物，右侧是显著的病原体。
 
@@ -79,7 +79,7 @@ ratio t test = 6.51, P = 4.4 × 10−8, n = 49 个样本)。这提供了证据
 
 图e. 与铜绿假单胞菌和链球菌共生的前100个代谢物分子的热图。图中表示仅是预测铜绿假单胞菌代谢物谱就可以解释这些样品中10%的代谢物变异(r = 0.319, P = 1.18×10−11,n = 442个分子)。
 
-![](../images/1001_8.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1001_8.jpg)
 
 4. 胆汁酸研究。证明**mmvec能够在复杂的生物系统中进行探索性分析，并简化特定代谢物的微生物来源的发现**
 
@@ -89,9 +89,9 @@ ratio t test = 6.51, P = 4.4 × 10−8, n = 49 个样本)。这提供了证据
 
 5.炎症性肠病中微生物-代谢产物的相互作用。结果表示**mmvec能够确定IBD研究中对代谢物丰度最强的微生物贡献，并发现了在最初的研究中被遗漏的一种微生物（Propionibacterium）**
 
-![](../images/1001_9.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1001_9.jpg)
 
-![](../images/1001_10.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1001_10.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2019/11/7-1024x548.png)
 

docs/菌群知识库/categories/技术/14156_高通量测序是什么技术,通俗易懂点.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
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 tags: ["dna", "g99", "sanger", "1932", "1936", "1938", "1935", "ngs", "1937", "1929"]
 date: "2026-12-22"
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 scraped: "2026-08-10T07:26:03.081Z"
 ---
 
@@ -17,9 +17,9 @@ scraped: "2026-08-10T07:26:03.081Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/14156_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14156_2.png)
 
-![](../images/14156_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14156_3.png)
 
 **DNA 测序**是测量**各种生命形式**主要特性的**基础。**自20世纪50年代发现DNA双螺旋结构后，全世界科学家们就开始致力于**确定不同物种基因组的原始序列**。这一任务被称为**基因组测序，**旨在揭示不同生物的基因组组成和基因的排列顺序。
 
@@ -56,7 +56,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:26:03.081Z"
 
 人类DNA包含约**30亿个碱基对**，组成大约**2万到2万5千个基因**，这些基因分布在23对染色体上。人类DNA中的遗传信息决定了我们的**外貌、生理功能和健康状况。**人类的遗传多样性虽然存在，但所有人类的DNA序列**大致相似**，约有99.9%的相似度。个体基因组有 **3-400 万个碱基对位置存在差异**。这些变异可在**单核苷酸多态性(SNP)**中捕获 ，但也存在一些称为结构变异(SV) 的较大变异。
 
-![](../images/14156_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14156_4.png)
 
 大多数病毒基因组有 10000 个 bp；某些植物的基因组长达数**千亿个碱基对**。细菌，通常**具有较小的基因组**，可以从几**百万到几千万碱基**对不等。细菌的DNA通常是**单个环状染色体，而不是多条线性染色体**。此外，许多细菌还含有**质粒**，这些是小型的DNA分子，可以在**细菌之间进行转移**，**促进基因的水平传播**，这是细菌适应环境和抗药性发展的重要机制。
 
@@ -74,7 +74,7 @@ DNA 是双链的，并以**双螺旋**形式构建，其中核苷酸对作为螺
 
 DNA的结构如下所示：
 
-![](../images/14156_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14156_5.png)
 
 图源：medlineplus
 
@@ -86,7 +86,7 @@ DNA序列通常以**5’端（头部）到3’端（尾部）的方向
 
 **DNA 补体**
 
-![](../images/14156_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14156_6.png)
 
 **DNA复制**
 
@@ -94,7 +94,7 @@ DNA序列通常以**5’端（头部）到3’端（尾部）的方向
 
 **有丝分裂的图**
 
-![](../images/14156_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14156_7.png)
 
 图源：wikipedia
 
@@ -106,7 +106,7 @@ DNA序列通常以**5’端（头部）到3’端（尾部）的方向
 
 **DNA 复制**是这张图中最重要的部分；这是用来**进行测序**的基础过程。DNA复制如下图所示：
 
-![](../images/14156_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14156_8.png)
 
 在 DNA 复制过程中，**两条 DNA 链首先被解压缩**，**产生两条单链**，**每条链都充当复制的模板**。然后将短 RNA 引物附着到** DNA 上的特定位点**；引物中的碱基与位点中的碱基互补。**酶促进（或“催化”）化学反应，**而**DNA 聚合酶**是催化新核苷酸与延伸结合引物的模板 DNA 互补配对的酶。
 
@@ -114,7 +114,7 @@ DNA 聚合酶用来**延伸链的核苷酸称为dNTP**（脱氧核苷酸三磷
 
 获取DNA序列主要**依赖于测序技术**。常用的测序技术有**桑格测序法**和**下一代测序法。**下一章节会详细介绍。
 
-![](../images/14156_9.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14156_9.png)
 
 图源：praxilabs
 
@@ -138,7 +138,7 @@ DNA 聚合酶用来**延伸链的核苷酸称为dNTP**（脱氧核苷酸三磷
 
 这种高通量配置用于**第一个人类基因组的测序**，该测序于 2003 年通过人类基因组计划完成，该计划历时 13 年。
 
-![](../images/14156_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14156_10.png)
 
 由于方法的**改进和自动化**，2008 年，另一个人类基因组在 **5 个月的时间内完成了测序**。第一份人类基因组草图的完成**只是现代 DNA 测序时代的开始**，它带来了更多的发明和新的、先进的高通量 DNA 测序策略，即所谓的下一代测序 (NGS)。
 
@@ -150,19 +150,19 @@ Fred Sanger 及其同事开发了一种基于放射性标记部分消化片段
 
 **著名的桑格测序起源于 20 世纪 70 年代末，**当时桑格开发了一种基于凝胶的方法，将 **DNA 聚合酶与标准核苷酸和链终止核苷酸 (ddNTP) **的混合物结合起来。将 dNTPS 与 ddNTP 混合会导致 PCR 期间测序反应随机提前终止。四个反应并行进行，每个反应包含一种版本的链终止核苷酸。使用凝胶电泳可视化该过程使得能够逐个碱基读取序列。在当时，这项技术是**革命性**的。**它能够对 500-1,000bp 片段进行测序。**
 
-![](../images/14156_11.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14156_11.png)
 
 图源：praxilabs
 
 桑格方法的一种变体——加减法，由桑格和艾伦·科尔森开发，于1977年获得了**第一个DNA基因组序列，**即噬菌体φX174。
 
-![](../images/14156_12.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14156_12.png)
 
 图源：pixels
 
 两年后，艾伦·麦克萨姆和沃尔特·吉尔伯特发表了他们的化学裂解技术，该技术成为**第一个广泛采用的 DNA 测序方法。**
 
-![](../images/14156_13.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14156_13.png)
 
 到了 20 世纪 80 年代，桑格最初的方法已经自动化**（毛细管电泳）**。大块凝胶被更细的丙烯酸毛细管取代，结果可以在电泳图上查看。**这项技术对于 2003 年人类基因组计划的完成至关重要**。尽管如此，即使在人类基因组计划之后，毛细管电泳的成本仍然过高，**无法实现大规模测序项目。**
 
@@ -204,7 +204,7 @@ Fred Sanger 及其同事开发了一种基于放射性标记部分消化片段
 
 **Illumina测序平台因此成为了第一个实现商业化的高通量并行测序技术**。
 
-![](../images/14156_14.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14156_14.png)
 
 **其他**
 
@@ -213,7 +213,7 @@ Fred Sanger 及其同事开发了一种基于放射性标记部分消化片段
 - Ion Torrent，这种技术通过测量DNA聚合过程中的pH值变化来进行测序；
 - SOLiD技术，它采用的是连接测序的方法，这种方法不依赖于聚合酶催化的合成过程。
 
-![](../images/14156_15.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14156_15.png)
 
 图源：slideserve
 
@@ -236,7 +236,7 @@ Illumina 的**首个测序平台**是通过**收购Solexa公司**获得的，被
 
 目前，Illumina 提供了多种测序设备，**包括NextSeq 和 NovaSeq 系列，**以及适用于不同规模需求的台式测序仪，如**iSeq100**和** MiniSeq**。
 
-![](../images/14156_16.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14156_16.png)
 
 **NextSeq**
 
@@ -250,7 +250,7 @@ NovaSeq 6000于2017年发布。它能够运行**三种不同的芯片，并且
 
 本质上，该机器每次运行能够对**多达 48 个完整人类基因组进行测序**，这可能需要长达 44 小时。其他关键应用包括单细胞分析、转录组测序和宏基因组分析。
 
-![](../images/14156_17.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14156_17.png)
 
 **HiSeq X 系列**
 
@@ -266,7 +266,7 @@ HiSeq X Ten 测序仪是一种**高性能的测序系统**，它能够在单次
 
 DNBSEQ-T7于**2019年推出**，旨在支持**健康项目和临床研究的一系列大规模测序应用**。据报道，与百万基因组整体解决方案软件和硬件一起，DNBSEQ-T7 每年可以对多达 **800,000 个样本**进行测序。
 
-![](../images/14156_18.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14156_18.png)
 
 硬件解决方案包括自动化文库制备系统，这意味着测序机可以**24小时运行，无需人工干预**，每天可以完成60个人类全基因组测序。其商业化预计将把个人全基因组测序的成本降低至 500 美元以下，从而改变测序格局。
 
@@ -280,7 +280,7 @@ BGI的测序化学方法被称为**组合探针锚定**合成（cPAS）。它采
 
 DNBSEQ-G99（以下简称“G99”）基因测序仪采用的是基于**聚合酶链式反应（PCR）原理**的测序技术。测序过程中，首先使用特定的引物引导** DNA 序列进行体外扩增**，然后添加一种含有测序所需的四种不同颜色的 dNTP（脱氧核苷酸）和荧光标记物。当引物与待测序列结合后，聚合酶开始合成新的链，同时荧光标记物被激活并发出不同颜色的荧光。**通过记录这些荧光信号，并使用计算机进行数据分析和解码**，最终确定每个碱基的序列。
 
-![](../images/14156_19.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14156_19.png)
 
 G99**突破性**地实现了**12小时可完成PE150测序**，从用户需求出发，在提供高质量的测序数据的同时，做到**快速、简单、灵活**，能为测序工作带来更好的体验，应用场景大大扩展了。
 
@@ -296,7 +296,7 @@ G99**突破性**地实现了**12小时可完成PE150测序**，从用户需求
 
 **纳米孔测序**(**Nanopore**)：使用Oxford Nanopore Technologies（ONT）的纳米孔测序技术，通过将**DNA分子通过纳米孔，**测量通过**纳米孔的电流变化**来进行测序。
 
-![](../images/14156_20.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14156_20.png)
 
 **合成测序**：通过在反应体系中逐步合成DNA序列，并使用荧光标记的核苷酸来标记每个碱基。第三代测序技术通常具有较长的读取长度，可以读取数千到数百万个碱基。
 
@@ -316,7 +316,7 @@ G99**突破性**地实现了**12小时可完成PE150测序**，从用户需求
 
 测序将继续变得越来越高效和经济实惠，**彻底改变与基因组学**相关的多个领域。目前，所有高通量测序（NGS ）方法都需要**文库制备**。该方案发生在 DNA 片段化之后，其中接头连接到每个片段的末端。接下来通常是 DNA 扩增步骤，以产生一个文库，然后可以通过 NGS 平台进行测序。
 
-![](../images/14156_21.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14156_21.png)
 
 ➦1
 
@@ -424,7 +424,7 @@ PF数据的总量是衡量**测序深度和测序质量**的一个重要指标
 
 Q30是指在**测序过程**中，质量值（Quality Value，QV）大于或等于30的碱基。质量值是根据测序仪器对**每个碱基的测量结果和信号峰值计算**得出的，用来表示该碱基的质量好坏。**Q30值越高，**表示测序数据中**高质量的碱基比例越高。**
 
-![](../images/14156_22.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14156_22.png)
 
 by：Alexander William Eastman
 

docs/菌群知识库/categories/技术/14679_谷禾健康君验—肠道菌群（肠道微生物）宏基因组健康检测.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["215", "2157", "2159", "1362", "292", "441", "1226", "203", "2158", "2111"]
 date: "2026-06-12"
-images: ["../images/14679_1.jpg", "../images/14679_2.png", "../images/14679_3.png", "../images/14679_4.png", "../images/14679_5.png", "../images/14679_6.png", "../images/14679_7.png", "../images/14679_8.jpg", "../images/14679_9.png", "../images/14679_10.png", "../images/14679_11.png", "../images/14679_12.png", "../images/14679_13.png", "../images/14679_14.png", "../images/14679_15.png"]
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 scraped: "2026-08-10T07:21:05.801Z"
 ---
 
@@ -23,7 +23,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:21:05.801Z"
 
 对于一些特定需要深度检测的应用场景，如健康管理机构的差异化服务需求，或者临床应用需求，宏基因组精准健康检测提供了另一种专业的技术选择。
 
-![](../images/14679_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14679_2.png)
 
 # 谷禾整合多维数据库
 
@@ -41,7 +41,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:21:05.801Z"
 
 肠道基础功能：包括蛋白质发酵能⼒、消化吸收效率、肠道产气情况、肠道屏障完整性、肠道炎症状态等，在菌群整体评估指标中也增加了包括菌群恢复力、革兰氏阴性菌、好氧菌等指标。
 
-![](../images/14679_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14679_3.png)
 
 **功能基因分析**
 
@@ -49,7 +49,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:21:05.801Z"
 
 如次生代谢产物合成通路、维生素合成能力、碳水化合物利用能力等，为个性化营养和精准干预提供科学证据。
 
-![](../images/14679_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14679_4.png)
 
 **耐药基因**
 
@@ -57,7 +57,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:21:05.801Z"
 
 不局限于已知靶点，可鉴定出各种已知和新型耐药基因，全面评估耐药基因的种类和数量，例如，在人体肠道宏基因组中发现了大量β-内酰胺酶等耐药基因。
 
-![](../images/14679_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14679_5.png)
 
 – **追踪耐药基因的传播途径**
 
@@ -71,13 +71,13 @@ scraped: "2026-08-10T07:21:05.801Z"
 
 宏基因组检测技术在病原微生物毒力基因研究中具有独特优势，可在基因组水平系统分析其毒力基因组成及调控网络，加深对致病机理的理解。
 
-![](../images/14679_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14679_6.png)
 
 **免疫炎症分析**
 
 肠道菌群通过调控免疫平衡维持健康，⽽炎症标志物则作为评估机体炎症程度的关键指标。
 
-![](../images/14679_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14679_7.png)
 
 # 宏基因组测序技术挑战：数据量与成本的平衡
 
@@ -117,29 +117,29 @@ scraped: "2026-08-10T07:21:05.801Z"
 
 极力追求技术创新与商业价值的完美结合
 
-![](../images/14679_8.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14679_8.jpg)
 
 # 谷禾宏基因组主要报告内容
 
 宏基因组报告中的解读更详细，还整理了一些评估指标，检测指标的总结等。
 
-![](../images/14679_9.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14679_9.png)
 
-![](../images/14679_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14679_10.png)
 
 其他谷禾肠道菌群检测专业版的内容，宏基因组报告里面也都涵盖了，包括慢病风险、菌群代谢物及神经递质代谢、个性化营养等板块。
 
-![](../images/14679_11.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14679_11.png)
 
 …
 
-![](../images/14679_12.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14679_12.png)
 
 …
 
 个性化饮食板块也在谷禾16S版本的基础上进行了迭代升级。
 
-![](../images/14679_13.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14679_13.png)
 
 …
 
@@ -167,9 +167,9 @@ scraped: "2026-08-10T07:21:05.801Z"
 
 # 赋能前沿科研与产品研发
 
-![](../images/14679_14.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14679_14.png)
 
-![](../images/14679_15.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/14679_15.png)
 
 <来源：谷禾宏基因组精准检测报告>
 

docs/菌群知识库/categories/技术/15057_微生物测序报告中的多样性数据详细解读.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["adonis", "asv", "otu", "alpha-diversity", "beta-diversity", "gamma-diversity", "830", "2201", "shannonsimpson"]
 date: "2026-06-28"
-images: ["../images/15057_1.png", "../images/15057_2.png", "../images/15057_3.png", "../images/15057_4.png", "../images/15057_5.png", "../images/15057_6.png", "../images/15057_7.png", "../images/15057_8.png", "../images/15057_9.png", "../images/15057_10.png", "../images/15057_11.png", "../images/15057_12.png", "../images/15057_13.png", "../images/15057_14.png", "../images/15057_15.png", "../images/15057_16.png", "../images/15057_17.png", "../images/15057_18.png", "../images/15057_19.png", "../images/15057_20.png", "../images/15057_21.png", "../images/15057_22.png", "../images/15057_23.png", "../images/15057_24.png", "../images/15057_25.png", "../images/15057_26.png"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_1.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_2.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_3.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_4.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_5.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_6.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_7.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_8.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_9.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_10.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_11.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_12.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_13.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_14.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_15.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_16.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_17.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_18.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_19.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_20.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_21.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_22.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_23.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_24.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_25.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_26.png"]
 scraped: "2026-08-10T07:20:15.508Z"
 ---
 
@@ -17,7 +17,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:20:15.508Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/15057_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_2.png)
 
 随着技术的发展，**高通量测序技术**已成为**研究微生物群落**的重要工具。这种技术使得科学家们能够**解析巨量微生物DNA序列**，从而获得丰富的微生物组数据，包括**16S rRNA基因**、**ITS序列**和**宏基因组**。然而，这些数据只是迈向揭示微生物群落复杂性的第一步。
 
@@ -39,11 +39,11 @@ scraped: "2026-08-10T07:20:15.508Z"
 
 下图是实验上机测序流程，提取的样本总DNA经过**质检、PCR扩增**、**建库**等步骤进行高通量测序得到测序原始数据。
 
-![](../images/15057_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_3.png)
 
 原始数据经过**Reads拼接**、**tags过滤**、**去嵌合体**等步骤得到有效数据clean data。在特定的相似度下进行聚类得到OTU/ASV，报告中通过降噪方法得到ASV表，一切后续分析都围绕ASV表来进行。根据ASV表可以继续做**物种分类注释**、**丰度计算**、**多样性分析**、**差异分析**、**功能预测**等。所以**ASV特征表**是微生物多样性分析中关键数据结果。
 
-![](../images/15057_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_4.png)
 
 **OTU和ASV的区别**
 
@@ -67,7 +67,7 @@ ASV通常使用误差校正算法来排除测序错误，从而**提供更精确
 
 原始序列数据(raw tags)经过质控、过滤、去嵌合体，最终得到**有效数据**(effective tags)。再对有效数据进行**UNOISE降噪处理**，得到ASV特征表。数据处理过程中各步骤得到的序列进行途径统计，可以**直观的反映每个样本的数据量和物种丰度**。
 
-![](../images/15057_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_5.png)
 
 **文件目录：**
 
@@ -85,13 +85,13 @@ ASV通常使用误差校正算法来排除测序错误，从而**提供更精确
 
 若原始数据量低于1万条，尤其是少于3000条reads以下，则很有可能**受环境污染的杂带较多**，建议重新上机补测数据。ASVS列可以**反映每个样本的物种多样性**，一般一个ASVs就代表一个物种。因此可以用ASV数量来代表**物种****数量**。将每个样本的有效原始数量和ASVs数据可视化做成柱状图，可以**更直观的观察每个样本/分组数据量的变化**。
 
-![](../images/15057_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_6.png)
 
 每个样本/分组可能会有一些共有的和独有的ASV，通常用韦恩图或花瓣图表示（样本数/分组数<=5个样本用维恩图，数量大于5出花瓣图）。除了用Venn图将几个数据集之间的交集进行可视化，还可以使用upset图表示。
 
-![](../images/15057_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_7.png)
 
-![](../images/15057_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_8.png)
 
 韦恩图中不同颜色的圆圈代表**一个样本/分组**，圈之间的重迭区域表示**样本/分组间共有的ASVs**，每个区域的数字大小表示该区域对应的**ASVs数目**。
 
@@ -111,7 +111,7 @@ alpha多样性有三类相关指数，其中包括**菌群丰度指数**(Chao1
 
 **计算公式如下：**
 
-![](../images/15057_9.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_9.png)
 
 编辑​
 
@@ -129,11 +129,11 @@ n2＝只有两条序列的OTU数目（如“doubletons”）。
 
 **计算公式如下：**
 
-![](../images/15057_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_10.png)
 
 其中
 
-![](../images/15057_11.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_11.png)
 
 ni＝含有i条序列的ASV数目；
 
@@ -149,7 +149,7 @@ abund＝被视为“优势”的ASV的阈值，默认为10。
 
 **计算公式如下：**
 
-![](../images/15057_12.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_12.png)
 
 其中：
 
@@ -163,11 +163,11 @@ N＝所有的序列数。
 
 **计算公式一如下：**
 
-![](../images/15057_13.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_13.png)
 
 **计算公式二如下：**
 
-![](../images/15057_14.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_14.png)
 
 此时，Simpson**指数越大，说明群落多样性越大**。报告中用到的是计算公式二。
 
@@ -185,7 +185,7 @@ N＝所有的序列数。
 
 **计算公式如下：**
 
-![](../images/15057_15.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_15.png)
 
 其中：
 
@@ -195,7 +195,7 @@ N＝所有的序列数。
 
 **下表统计了每个样本的各项alpha多样性指标：**
 
-![](../images/15057_16.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_16.png)
 
 结果目录：
 
@@ -203,11 +203,11 @@ N＝所有的序列数。
 
 可以选择不同的**alpha多样性指数**进行**显著性差异比较**，一般常用**丰富度指数Chao1**，多样性指数Shannon、simpson，比较不同组间指数是否有显著差异。Alpha多样性分析将样本的菌群群整体研究并转换为具体的指数与p值，来**说明群落的变化与差异**。
 
-![](../images/15057_17.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_17.png)
 
-![](../images/15057_18.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_18.png)
 
-![](../images/15057_19.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_19.png)
 
 ## ▸ 物种多样性相关曲线
 
@@ -215,7 +215,7 @@ N＝所有的序列数。
 
 稀释曲线是从每个样本中随机抽取一定数量的序列，统计这些序列所代表的ASV数目，以随机抽取的序列数与ASV数量来构建曲线。可以用来**比较不同样本中的物种多样性**，也可以用来**说明样本出测序数据量是否足以反映环境中的物种多样性**。
 
-![](../images/15057_20.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_20.png)
 
 **•** **菌群多样性指数**(shannon和simpson) 
 
@@ -223,7 +223,7 @@ N＝所有的序列数。
 
 Rank-abundance曲线可用来解释多样性的两个方面，即**物种丰度**和**物种均匀度**。在水平方向，物种的丰度由曲线的宽度来反映，**物种的丰度越高，曲线在横轴上的范围越大**；曲线的形状（平滑程度）反映了样品中物种的均度，**曲线越平缓，物种分布越均匀**。
 
-![](../images/15057_21.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_21.png)
 
 # beta多样性分析—样本间菌群相似度
 
@@ -245,7 +245,7 @@ Bray-Curtis距离是生态学中用来**衡量不同样地物种组成差异**
 
 **计算公式为：**
 
-![](../images/15057_22.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_22.png)
 
 SA,i＝表示A样本中第i个OTU所含的序列数；
 
@@ -273,7 +273,7 @@ PCA图是基于ASV table的欧式距离，PCoA是基于两两样品之间的距
 
 Anosim分析是一种非参数检验，用来检验**组间差异是否显著大于组内差异**，从而判断分组是否有意义。对 Anosim 的分析结果，基于两两样本之间的距离值排序获得的秩(组间的为 between，组内的为 within)，这样任一两两组的比较可以获得三个分类的数据，并进行箱线图的展示(若两个箱的凹槽互不重迭，则表明它们的**中位数有显著差异**)。
 
-![](../images/15057_23.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_23.png)
 
 该方法主要有两个数值结果：R值，用于**比较不同组间是否存在差异**；P值，用于说明**是否有显著差异**。
 
@@ -289,7 +289,7 @@ PCA(Principal Components Analysis)即**主成分分析**，首先利用线性变
 
 这种降维的思想首先减少数据集的维数，同时还保持数据集的对方差贡献最大的特征，最终使数据直观**呈现在二维坐标系**。经过一系列的特征值和特征向量进行排序后，选取PCA分析得到的前三个主成分（PC1、PC2和PC3）中的任意两个数据作图。通过PCA 可以**观察个体或群体间的差异**。
 
-![](../images/15057_24.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_24.png)
 
 ## ▸ PCoA分析
 
@@ -299,7 +299,7 @@ PCA(Principal Components Analysis)即**主成分分析**，首先利用线性变
 
 该图是基于Bray-Curtis距离做的PCoA图，图中右下角的P值就是基于Adonis检验得到的结果：
 
-![](../images/15057_25.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_25.png)
 
 编辑​
 
@@ -309,7 +309,7 @@ PCA(Principal Components Analysis)即**主成分分析**，首先利用线性变
 
 与 PcoA 的区别是 NMDS 分析**不依赖于特征根和特征向量**的计算，而是通过对样本距离进行等级排序，使样本在低维空间中的排序尽可能符合彼此之间的距离远近关系（而非确切距离数值）。因此，**NMDS 分析不受样本距离的数值影响，对于结构复杂的数据排序结果可能更稳定**。
 
-![](../images/15057_26.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/15057_26.png)
 																	
 					
 			

docs/菌群知识库/categories/技术/16104_重新认识你的年龄——基于肠道菌群预测的生物年龄.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["2535", "2538", "2533", "496", "2536", "2534", "2537"]
 date: "2026-04-03"
-images: ["../images/16104_1.png", "../images/16104_2.png", "../images/16104_3.png", "../images/16104_4.png", "../images/16104_5.png", "../images/16104_6.png", "../images/16104_7.png", "../images/16104_8.png", "../images/16104_9.jpg", "../images/16104_10.png", "../images/16104_11.jpg", "../images/16104_12.png", "../images/16104_13.png"]
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 scraped: "2026-08-10T07:14:09.000Z"
 ---
 
@@ -17,7 +17,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:14:09.000Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/16104_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16104_2.png)
 
 近年来，**随着微生物组学研究**的深入，科学家们发现**肠道菌群与人体年龄**之间存在着**远比想象更密切**的关联。一系列突破性研究表明，肠道菌群**不仅**能够反映个体的**实际年龄**，更可能是**调控生物学年龄**的关键因素之一。这一发现正在改变我们对**发育、衰老和健康**的传统认知。
 
@@ -33,7 +33,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:14:09.000Z"
 
 通过**梳理最新研究进展**，我们将看到肠道菌群不仅是**年龄的被动标记物**，更可能是一个**可****调控的”生物时钟”**。这一认识正在**开启****精准医疗和个性化健康管理**的新篇章。
 
-![](../images/16104_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16104_3.png)
 
 doi: 10.14218/ERHM.2024.00008
 
@@ -47,7 +47,7 @@ doi: 10.14218/ERHM.2024.00008
 
 肠道微生物群的**发育受多种因素**影响，包括**喂养方式、出生方式、地理位置和环境暴露**等。研究发现，母乳喂养与*Bifidobacterium*的高水平密切相关，而**停止母乳喂养**则会**加速**肠道微生物群的**成熟**。此外，**出生方式**也显著影响微生物群的发育，如阴道分娩的婴儿肠道中*Bacteroides*的水平较高。**尽管**存在这些**普遍性特征**，但**个体间**的肠道微生物群**发育轨迹仍存在差异**，这与特定的生活方式和环境因素密切相关。
 
-![](../images/16104_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16104_4.png)
 
 doi: 10.3233/NHA-170030
 
@@ -97,7 +97,7 @@ doi: 10.3233/NHA-170030
 
 老年人肠道中产丁酸菌如真杆菌(*Eubacterium*)、瘤胃球菌等数量**减少**，这些菌群对维持肠道健康至关重要。它们的**减少**会影响营养物质的吸收和能量代谢，**同时**也会降低肠道屏障功能，增加肠道通透性。这种变化可能导致**营养吸收不良**，并**增加有害物质**进入**血液**的风险。
 
-![](../images/16104_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16104_5.png)
 
 **这三个特征之间相互关联，****共同构成了一个复杂的失衡网络**。例如，菌群多样性的下降会影响代谢功能，**促炎菌群**的增加又会进一步降低有益菌群的数量。这种**恶性循环**可能是老年人**更容易出现**各种健康问题的**重要原因之一**。了解这些特征对于开发针对性的干预策略，改善老年人健康状况具有重要意义。
 
@@ -109,7 +109,7 @@ doi: 10.3233/NHA-170030
 
 研究人员还观察到，在**虚弱评分较高**的老年人中，乳酸菌(*Lactobacilli)*、拟杆菌/普氏菌(*Bacteroides/Prevotella*)等有益菌群**显著减少**，而瘤胃球菌属(*Ruminococcus*)、*Atopobium*和肠杆菌科(*Enterobacteriaceae*)等菌群则**明显增加**。
 
-![](../images/16104_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16104_6.png)
 
 doi: 10.1016/j.advnut.2025.100376
 
@@ -169,13 +169,13 @@ doi: 10.1016/j.advnut.2025.100376
 
 2024年一项新研究开发出了基于肠道微生物组**多维数据**的生物学年龄预测模型(gAge)。该研究通过**创新的机器学习方法**，成功整合了微生物组的分类学和功能学特征，显著提高了年龄预测的准确性。研究团队识别出**164个标志物物种和35个关键代谢通路**与宿主年龄变化密切相关，并根据其对衰老的影响将其分类为促进和抑制两类。
 
-![](../images/16104_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16104_7.png)
 
 doi: 10.1080/19490976.2023.2297852
 
 研究验证显示，**gAge模型**及其预测残差与个体**健康状况和虚弱程度**高度相关。特别是在老年群体中，模型识别的年龄相关标志物与多种疾病和虚弱特征**显著重合**，为评估和预测衰老风险提供了新的工具。
 
-![](../images/16104_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16104_8.png)
 
 doi: 10.1080/19490976.2023.2297852
 
@@ -187,7 +187,7 @@ doi: 10.1080/19490976.2023.2297852
 
 这些进展表明，基于**肠道菌群的年龄预测模型**已经发展成为一个可靠的生物年龄评估工具。通过整合**多维度数据和先进的机器学习方法**，为干预衰老提供**新的靶点**。
 
-![](../images/16104_9.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16104_9.jpg)
 
 <来源：谷禾健康肠道菌群数据库>
 
@@ -207,11 +207,11 @@ doi: 10.1080/19490976.2023.2297852
 
 我们之前发表在《**Gut》**上的针对自闭症儿童菌群发育的研究显示，自闭症儿童的菌群发育要滞后于健康儿童。
 
-![](../images/16104_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16104_10.png)
 
 在菌群组成方面，**发育迟缓儿童表现出显著的特征性改变**。首先是有益菌群的明显减少，特别是**双歧杆菌和乳杆菌**的含量**显著低于**同龄健康儿童。这些菌群对维持肠道健康、促进营养物质吸收和调节免疫功能具有重要作用。同时，研究还发现这些儿童的肠道中**普氏菌**(*Prevotella*)和**粪杆菌**(*F. prausnitzii)*等核心菌菌含量也**明显降低**。
 
-![](../images/16104_11.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16104_11.jpg)
 
 doi.org/10.1136/gutjnl-2021-325115
 
@@ -231,7 +231,7 @@ doi.org/10.1136/gutjnl-2021-325115
 
 早衰综合征患者的肠道菌群呈现出显著的**“年龄加速”特征**，其菌群组成和功能状态明显超前于实际年龄水平。研究发现，这种菌群年龄加速现象与多种生理功能的提前衰退密切相关。
 
-![](../images/16104_12.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16104_12.png)
 
 doi: 10.2147/CIA.S414714
 
@@ -275,7 +275,7 @@ doi: 10.2147/CIA.S414714
 
 谷禾团队通过分析60万例不同年龄人群的6万个菌群特征，**这种基于海量数据的个体化健康监测方法，**为微生物组研究开辟了新的范式。通过持续监测个体肠道菌群的动态变化，有助于更早地发现健康隐患，实现疾病的早期预警和干预。
 
-![](../images/16104_13.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16104_13.png)
 
 <来源：谷禾健康肠道菌群检测数据库>
 

docs/菌群知识库/categories/技术/16202_如何判断和正确评价疾病模型预测的精准性？.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["2565", "2568", "2567", "2566", "2564", "ppv", "npv"]
 date: "2026-06-09"
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 scraped: "2026-08-10T07:13:45.723Z"
 ---
 
@@ -17,7 +17,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:13:45.723Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/16202_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16202_2.png)
 
 目前随着高通量测序，微生物以及代谢、蛋白组学和高精度影像学等快速的发展，有关**人体疾病**或**健康相关**的海量数据正在不断产生，依托各种算法尤其AI的算法等，涌现出很多优秀的“模型”用于**预测人体疾病**以及健康相关的**辅助诊断或筛查**。
 
@@ -111,7 +111,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:13:45.723Z"
 
 这里对于我们应用的启示：在**低发病率**的人群中，**高特异性**（低假阳性率）比**高敏感性**（高检出率）更重要。选择产品时，不仅要看检出率，还要关注假阳性率和阳性预测值。
 
-![](../images/16202_3.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16202_3.jpg)
 
 **发病率较高的阳性预测值(PPV)**
 
@@ -173,7 +173,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:13:45.723Z"
 
 可以发现随着**发病率的提高**，两个模型的阳性预测值都**大幅提升**。但是模型A仍然保持更高的PPV，**但优势不如低发病率时那么明显。**
 
-![](../images/16202_4.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16202_4.jpg)
 
 **★ 发病率越高，阳性预测值越高**
 
@@ -223,7 +223,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:13:45.723Z"
 
 **教育需求：**医生需帮助患者理解PPV与个人情况的关联。
 
-![](../images/16202_5.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16202_5.jpg)
 
 ➤  **产品评估的情境差异**
 
@@ -353,7 +353,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:13:45.723Z"
 
 当测试用于识别**严重但可治疗的疾病（例如宫颈癌）**时，高敏感性显然很重要。通过宫颈涂片检测筛查女性人群是一项敏感的检测。然而，**它不是很特异**，很大一部分宫颈涂片阳性的女性**继续进行阴道镜检查**，最终被发现没有潜在的病变。
 
-![](../images/16202_6.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16202_6.jpg)
 
 **特异性**
 
@@ -385,7 +385,7 @@ Specificity = TN/(TN + FP)
 
 特异性表明该检测能够**正确识别95%的健康者**，有5%的健康者**被误判**为患病。
 
-![](../images/16202_7.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16202_7.jpg)
 
 **TIPs:**
 
@@ -427,7 +427,7 @@ PPV的互补值是**错误发现率**（FDR），NPV的互补值是**错误遗
 
 例如：**谷禾结直肠癌模型**
 
-![](../images/16202_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16202_8.png)
 
 例如，通过将阳性结果的**临界值置于非常低的**水平，可以捕获**所有阳性样品**，因此测试**非常敏感**。但是，这可能意味着许多实际为阴性的样本可能被视为阳性，因此该测试将被视为**特异性较差**。找到**平衡点**对于有效和可用的测试至关重要。
 
@@ -441,7 +441,7 @@ ROC曲线是一种图形表示，显示测试的**敏感性和特异性如何相
 
 对于给定的截止值，将TPR（敏感性）与FPR（1-特异性）作图，得到类似于下图的曲线。理想情况下，**选择曲线肩部周围**的一个点，这既能限制假阳性，又能**最大限度地提高真阳性**。
 
-![](../images/16202_9.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16202_9.png)
 
 图片来源：Technology Networks
 

docs/菌群知识库/categories/技术/16676_谷禾健康君验—肠道菌群（肠道微生物）精准检测 – Plus版.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: []
 date: "2026-08-15"
-images: ["../images/16676_1.jpg", "../images/16676_2.png", "../images/16676_3.jpg", "../images/16676_4.png", "../images/16676_5.png", "../images/16676_6.png", "../images/16676_7.png", "../images/16676_8.jpg", "../images/16676_9.jpg", "../images/16676_10.jpg", "../images/16676_11.jpg", "../images/16676_12.jpg", "../images/16676_13.jpg", "../images/16676_14.jpg", "../images/16676_15.png", "../images/16676_16.png", "../images/16676_17.jpg"]
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 scraped: "2026-08-10T07:11:25.584Z"
 ---
 
@@ -17,11 +17,11 @@ scraped: "2026-08-10T07:11:25.584Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/16676_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16676_2.png)
 
 谷禾16S+tNGS技术结合了超多重PCR和高通量测序的优势，旨在提供比传统16S rRNA测序和宏基因组测序更优、更全面的病原体及耐药基因检测方案。
 
-![](../images/16676_3.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16676_3.jpg)
 
 **传统16S + 病原体精准分型 = 全新升级**
 
@@ -43,7 +43,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:11:25.584Z"
 
 这是一款突破传统16S检测瓶颈而生的产品
 
-![](../images/16676_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16676_4.png)
 
 # 谷禾16S+tNGS产品技术攻关
 
@@ -65,11 +65,11 @@ tNGS对血液和上呼吸道样本检测较简单，因其主要含病原体。
 
 实现靶向病原体精准检测
 
-![](../images/16676_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16676_5.png)
 
-![](../images/16676_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16676_6.png)
 
-![](../images/16676_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16676_7.png)
 
 # 谷禾16S+tNGS报告内容
 
@@ -79,43 +79,43 @@ tNGS对血液和上呼吸道样本检测较简单，因其主要含病原体。
 
 细菌病原体
 
-![](../images/16676_8.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16676_8.jpg)
 
 …
 
 病毒
 
-![](../images/16676_9.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16676_9.jpg)
 
 真菌、寄生虫、其他病原体
 
-![](../images/16676_10.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16676_10.jpg)
 
 …
 
 毒力基因
 
-![](../images/16676_11.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16676_11.jpg)
 
 …
 
 耐药基因
 
-![](../images/16676_12.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16676_12.jpg)
 
 …
 
-![](../images/16676_13.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16676_13.jpg)
 
 也包括相关病原微生物的解释
 
-![](../images/16676_14.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16676_14.jpg)
 
 …
 
 # 检测价值：从预警到精准用药
 
-![](../images/16676_15.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16676_15.png)
 
 例如，通过检测幽门螺杆菌毒力基因组合，可判断是否需立即治疗，避免对弱毒株患者的不必要抗生素使用。强毒株感染会损伤胃黏膜，增加胃炎和溃疡风险，早期预警能在胃黏膜不可逆损伤前提供治疗窗口期。
 
@@ -123,7 +123,7 @@ tNGS对血液和上呼吸道样本检测较简单，因其主要含病原体。
 
 # 技术优势
 
-![](../images/16676_16.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16676_16.png)
 
 # 适 用 场 景
 
@@ -134,7 +134,7 @@ tNGS对血液和上呼吸道样本检测较简单，因其主要含病原体。
 - 特殊病原体感染风险人群如幽门螺杆菌、艰难梭菌、大肠杆菌等特定病原体感染高风险人群。
 - 关注特定消化道病原体人群除了细菌之外，还关注其他消化道病原体包括真菌、病毒、寄生虫的人群。
 
-![](../images/16676_17.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16676_17.jpg)
 
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docs/菌群知识库/categories/技术/16702_谷禾健康君验—阴道菌群（阴道微生物）精准检测.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["2689", "2688", "2695", "2119", "cstcst", "2693", "2696", "2253", "1328"]
 date: "2026-08-15"
-images: ["../images/16702_1.jpg", "../images/16702_2.webp", "../images/16702_3.png", "../images/16702_4.png", "../images/16702_5.png", "../images/16702_6.png", "../images/16702_7.png", "../images/16702_8.png", "../images/16702_9.png", "../images/16702_10.png", "../images/16702_11.png"]
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 scraped: "2026-08-10T07:11:21.214Z"
 ---
 
@@ -17,19 +17,19 @@ scraped: "2026-08-10T07:11:21.214Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/16702_2.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16702_2.webp)
 
-![](../images/16702_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16702_3.png)
 
 # 高水平期刊引领妇科微生态
 
-![](../images/16702_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16702_4.png)
 
 在肠道菌群检测系列产品成熟之后，谷禾健康将深耕多年的微生物组学技术平台，延伸至关乎女性全生命周期健康的另一核心领域——阴道微生态。
 
-![](../images/16702_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16702_5.png)
 
-![](../images/16702_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16702_6.png)
 
 还包括子宫颈沙眼衣原体、HPV、HSV、EB病毒、巨细胞病毒等。
 
@@ -43,19 +43,19 @@ scraped: "2026-08-10T07:11:21.214Z"
 
 谷禾阴道菌群检测报告中包括阴道菌群总体评估、CST分型、致病菌表（细菌性阴道病，需氧菌性阴道炎，外阴念珠菌病等）、列出异常菌群及相关说明，菌群详细构成等（注：仅用于菌群科学研究和辅助参考，不直接用于临床诊断）。
 
-![](../images/16702_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16702_7.png)
 
 …
 
-![](../images/16702_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16702_8.png)
 
 …
 
-![](../images/16702_9.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16702_9.png)
 
 …
 
-![](../images/16702_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16702_10.png)
 
 …
 
@@ -63,7 +63,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:11:21.214Z"
 
 阴道菌群检测让我们能够更全面地了解阴道微生物组的组成及其变化，以及它是如何随着时间的推移或对各种因素(如环境、激素变化、性活动和抗生素使用等)的反应而变化的。
 
-![](../images/16702_11.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16702_11.png)
 
 # 适用场景
 

docs/菌群知识库/categories/技术/16710_谷禾健康君验—宠物肠道菌群（肠道微生物）精准检测.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["1271", "1270", "1630", "2697", "2698", "2699"]
 date: "2026-08-15"
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 scraped: "2026-08-10T07:11:15.724Z"
 ---
 
@@ -17,9 +17,9 @@ scraped: "2026-08-10T07:11:15.724Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/16710_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16710_2.png)
 
-![](../images/16710_3.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16710_3.jpg)
 
 随着“它经济”的蓬勃发展和“科学养宠”理念的深入人心，宠物已成为家庭的重要成员。然而，面对“毛孩子”们无法言说的病痛，如反复腹泻、顽固皮肤病、食欲不振、呕吐等，传统兽医诊断往往面临挑战。
 
@@ -27,7 +27,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:11:15.724Z"
 
 从宠物医院的实际经营来看，慢性疾病正成为他们面临的核心挑战。慢性肾病、老年痴呆、精神类疾病等病症不仅治疗费用昂贵，而且现有手段往往无法覆盖，特别是小型诊所更是心有余而力不足。
 
-![](../images/16710_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16710_4.png)
 
 在与许多B端合作伙伴的深度交流中我们发现
 
@@ -61,15 +61,15 @@ scraped: "2026-08-10T07:11:15.724Z"
 
 我们致力于解码宠物肠道微生态的奥秘，为兽医临床、宠物营养和家庭养护提供科学依据，开启宠物健康管理的精准化新时代。
 
-![](../images/16710_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16710_5.png)
 
 从人类微生态到宠物微生态，不是简单的复制，而是技术能力的升维应用。人类肠道微生态的复杂性研究为我们提供了强大的算法基础和数据分析能力，以及多年来在宠物菌群科研中的持续投入，这些经验在宠物领域的应用中展现出了独特的技术优势。
 
 研究表明，宠物肠道菌群不仅影响消化吸收功能，更与免疫调节、神经系统、皮肤健康等多个生理系统密切相关，成为宠物整体健康状况的重要晴雨表。
 
-![](../images/16710_6.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16710_6.jpg)
 
-![](../images/16710_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16710_7.png)
 
 谷禾正有序推进构建涵盖不同品种、年龄、健康状况犬猫的肠道菌群数据库，结合最新的机器学习算法，实现对宠物肠道微生态健康状况和营养进行精准评估（注：仅用于菌群科学研究和辅助参考，不直接用于临床诊断 ）。
 
@@ -79,23 +79,23 @@ scraped: "2026-08-10T07:11:15.724Z"
 
 谷禾宠物菌群检测报告中包括菌群评估（整体指标）、肠道基础功能评估（屏障功能、炎症水平、代谢状态）、菌群代谢物评估（短链脂肪酸等）、炎症免疫评估（促炎、抗炎等指标）、营养饮食评估（维生素、微量元素）等。
 
-![](../images/16710_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16710_8.png)
 
 …
 
-![](../images/16710_9.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16710_9.png)
 
 …
 
 症状相关菌群分析，包括腹泻、呕吐、过敏等。
 
-![](../images/16710_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16710_10.png)
 
 …
 
 菌群代谢物评估（短链脂肪酸等）。
 
-![](../images/16710_11.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16710_11.png)
 
 …
 
@@ -103,7 +103,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:11:15.724Z"
 
 从多维度全面评估宠物肠道健康状况，为宠物主人提供科学的健康管理依据和个性化调理建议。
 
-![](../images/16710_12.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16710_12.jpg)
 
 # 适用场景
 

docs/菌群知识库/categories/技术/16721_谷禾健康君验—肠道菌群（肠道微生物）临床版.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["2700", "1226", "203", "2701"]
 date: "2026-08-15"
-images: ["../images/16721_1.jpg", "../images/16721_2.png", "../images/16721_3.png", "../images/16721_4.png"]
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 scraped: "2026-08-10T07:11:08.752Z"
 ---
 
@@ -19,7 +19,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:11:08.752Z"
 
 肠道菌群检测临床版（16S rRNA测序），作为谷禾健康最早推向市场、历经十余年打磨的经典产品，凭借其成本效益、高效性与成熟度，为临床端肠道微生态评估以及诸多科研项目基线建立，提供了坚实、可靠且极具价值的数据基础（注：仅用于菌群科学研究和辅助参考，不直接用于临床诊断 ）。 
 
-![](../images/16721_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16721_2.png)
 
 临床版对报告版式进行简化，以更符合临床检验的形式呈现分析结果，便于临床医生快速查看和判断异常。
 
@@ -29,9 +29,9 @@ scraped: "2026-08-10T07:11:08.752Z"
 
 报告内容截图：
 
-![](../images/16721_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16721_3.png)
 
-![](../images/16721_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16721_4.png)
 																	
 					
 			

docs/菌群知识库/categories/技术/16916_肠道菌群报告更新说明20250825.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["2824", "2261"]
 date: "2026-09-05"
-images: ["../images/16916_1.jpg", "../images/16916_2.png", "../images/16916_3.jpg", "../images/16916_4.png", "../images/16916_5.jpg", "../images/16916_6.png", "../images/16916_7.jpg", "../images/16916_8.png", "../images/16916_9.jpg", "../images/16916_10.png", "../images/16916_11.jpg", "../images/16916_12.png"]
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 scraped: "2026-08-10T07:07:48.346Z"
 ---
 
@@ -23,51 +23,51 @@ scraped: "2026-08-10T07:07:48.346Z"
 
 II型糖尿病：
 
-![](../images/16916_1.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16916_1.jpg)
 
 更新后：
 
-![](../images/16916_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16916_2.png)
 
 胆病：
 
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+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16916_3.jpg)
 
 更新后：
 
-![](../images/16916_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16916_4.png)
 
 胃病：
 
-![](../images/16916_5.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16916_5.jpg)
 
 更新后
 
-![](../images/16916_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16916_6.png)
 
 肝病：
 
-![](../images/16916_7.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16916_7.jpg)
 
 更新后：
 
-![](../images/16916_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16916_8.png)
 
 肺部疾病：
 
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+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16916_9.jpg)
 
 更新后：
 
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+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16916_10.png)
 
 甲状腺疾病：
 
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+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16916_11.jpg)
 
 更新后：
 
-![](../images/16916_12.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16916_12.png)
 
 杭州谷禾信息技术有限公司
 

docs/菌群知识库/categories/技术/17239_annoSnake：一款用于宏基因组和MAGs的模块化、一站式自动化注释管道.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["annosnake", "mags", "215", "2157", "3077"]
 date: "2026-12-31"
-images: ["../images/17239_1.jpg", "../images/17239_2.jpg", "../images/17239_3.jpg", "../images/17239_4.jpg", "../images/17239_5.jpg", "../images/17239_6.jpg"]
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 scraped: "2026-08-10T07:05:19.923Z"
 ---
 
@@ -27,7 +27,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:05:19.923Z"
 
 ## 01annoSnake 的工作流程
 
-![](../images/17239_2.jpg)doi.org/10.1101/2025.11.03.686227.
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17239_2.jpg)doi.org/10.1101/2025.11.03.686227.
 
 annoSnake以“**自动化+模块化**”为核心：**输入clean reads → 组装 → 注释 → 分箱 → 结果汇总**与可视化。
 
@@ -49,7 +49,7 @@ annoSnake以“**自动化+模块化**”为核心：**输入clean reads → 组
 
 首次分析，annotSnake会自动下载并设置GTDB、[dbCAN](https://zhida.zhihu.com/search?content_id=266663136&content_type=Article&match_order=1&q=dbCAN&zhida_source=entity)、[Pfam](https://zhida.zhihu.com/search?content_id=266663136&content_type=Article&match_order=1&q=Pfam&zhida_source=entity)、[KEGG](https://zhida.zhihu.com/search?content_id=266663136&content_type=Article&match_order=1&q=KEGG&zhida_source=entity)等数据库，总量约100GB。
 
-![](../images/17239_3.jpg)doi.org/10.1101/2025.11.03.686227.
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17239_3.jpg)doi.org/10.1101/2025.11.03.686227.
 
 **开始分析**
 
@@ -97,13 +97,13 @@ annoSnake已经内置了“KEGG条目（KO编号）→**基因名称/通路名
 
 31个群体，Illumina NextSeq双端，平均每样本约700万条reads。尽管测序深度不高，但annoSnake仍**有效识别**了**主要的细菌谱系**，以及大量与木质纤维素消化相关的**代谢通路和基因**。
 
-![](../images/17239_4.jpg)doi.org/10.1101/2025.11.03.686227.
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17239_4.jpg)doi.org/10.1101/2025.11.03.686227.
 
 图中是annoSnake识别出的**主要菌群**，结果显示不同取食类型白蚁肠道的**优势类群模式**，这与已知发现相符，通常，食草和食木的白蚁其肠道群落以**螺旋体**为主，而食腐殖质和土壤的白蚁则富含梭菌（*clostridia*）。
 
 但也有与已知发现不符的结果，D. tamminensis物种的肠道群落以**梭菌**为主，几乎不见螺旋体或Fibrobacterota，部分D. gayi群体也表现出类似模式，这与“草/木料取食类型的白蚁常以螺旋体占优”的普遍模式不一致，作者解释这是**数据特性使然**，**低覆盖度数据只能恢复高丰度群落成员**，而非物种生态学的结论。
 
-![](../images/17239_5.jpg)doi.org/10.1101/2025.11.03.686227.
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17239_5.jpg)doi.org/10.1101/2025.11.03.686227.
 
 **▸ 识别出硫酸盐还原等重要通路的基因**
 
@@ -113,7 +113,7 @@ annoSnake已经内置了“KEGG条目（KO编号）→**基因名称/通路名
 
 识别出fdhF和acsABCDE等**基因预测还原性乙酸生成**的存在，这一点由分箱得到的15个Bacillota和6个螺旋体MAGs所支持，这两类群包含潜在的**乙酸生成菌**。这与其他白蚁和千足虫研究中已知的乙酸生成潜力一致。
 
-![](../images/17239_6.jpg)doi.org/10.1101/2025.11.03.686227.
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17239_6.jpg)doi.org/10.1101/2025.11.03.686227.
 
 **▸ 能够检测到大量碳水化合物活性酶**
 

docs/菌群知识库/categories/技术/17450_大语言模型在真实世界中的营养评估应用.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["ai", "3264", "3267", "2111", "3266"]
 date: "2026-04-30"
-images: ["../images/17450_1.jpg", "../images/17450_2.jpg", "../images/17450_3.webp", "../images/17450_4.webp", "../images/17450_5.png", "../images/17450_6.webp", "../images/17450_7.webp", "../images/17450_8.webp", "../images/17450_9.webp", "../images/17450_10.webp", "../images/17450_11.webp", "../images/17450_12.webp"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17450_1.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17450_2.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17450_3.webp","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17450_4.webp","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17450_5.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17450_6.webp","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17450_7.webp","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17450_8.webp","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17450_9.webp","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17450_10.webp","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17450_11.webp","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17450_12.webp"]
 scraped: "2026-08-10T07:03:15.802Z"
 ---
 
@@ -17,7 +17,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:03:15.802Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/17450_2.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17450_2.jpg)
 
 **准确的饮食评估**是营养流行病学、临床营养学及公共卫生计划的基石，对于减轻全球饮食相关慢性疾病（如肥胖、三高）**至关重要**。
 
@@ -27,7 +27,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:03:15.802Z"
 
 近年来，**人工智能**（AI），特别是**自然语言处理**（NLP）和**大型语言模型**（LLMs）的飞速发展，为**自动化营养评估**提供了新的契机。以**GPT**、**Claude**、**Gemini**为代表的先进模型，具备了处理复杂自由文本、进行高通量食品分类及提供个性化营养建议的**潜力**。
 
-![](../images/17450_3.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17450_3.webp)
 
 编辑​
 
@@ -37,7 +37,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:03:15.802Z"
 
 **饮食质量的评估**通常依赖于**互补的框架**：既要看**食品是如何加工的**（**NOVA**系统），又要看具体的**营养成分是否超标**（如糖、脂肪和钠），即参照世界卫生组织（**WHO**）的指南。
 
-![](../images/17450_4.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17450_4.webp)
 
 编辑​
 
@@ -45,7 +45,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:03:15.802Z"
 
 为了填补这一空白，来自波兰的华沙医科大学Aia等人的研究团队利用一份包含**1992种食品**的**波兰语****纵向数据集**，对目前市面上三款顶流AI模型——Claude Opus 4.5、Gemini 3 Pro 和 GPT-5.1-chat-latest，设了两场考试：一场是死磕标准的**硬核测试**（结合NOVA和WHO双重标准），一场是凭直觉的**快速测试**。
 
-![](../images/17450_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17450_5.png)
 
 编辑​
 
@@ -86,7 +86,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:03:15.802Z"
 
 统计分析以Pearson卡方检验（α=0.05）进行多组**两两比较**（模型-专家、模型间、提示策略间及“多模型共识”主导类别）。同时以**不健康**为**阳性**，基于混淆矩阵计算Accuracy、Precision、Recall、F1与Specificity，评估不同提示与模型的错误模式。
 
-![](../images/17450_6.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17450_6.webp)
 
 编辑​
 
@@ -104,7 +104,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:03:15.802Z"
 
 （占总样本1992的百分比）
 
-![](../images/17450_7.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17450_7.webp)
 
 编辑​
 
@@ -112,7 +112,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:03:15.802Z"
 
 （UNHEALTHY为阳性）
 
-![](../images/17450_8.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17450_8.webp)
 
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@@ -134,7 +134,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:03:15.802Z"
 
 （占总样本1992的百分比）
 
-![](../images/17450_9.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17450_9.webp)
 
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@@ -142,7 +142,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:03:15.802Z"
 
 （UNHEALTHY为阳性）
 
-![](../images/17450_10.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17450_10.webp)
 
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@@ -166,7 +166,7 @@ Recall略有回落但仍高（0.909–0.964），整体更均衡。
 
 χ2=1174.5 –1897.1，p < 0.001
 
-![](../images/17450_11.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17450_11.webp)
 
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@@ -179,7 +179,7 @@ Recall略有回落但仍高（0.909–0.964），整体更均衡。
 
 **各模型与专家总一致率（双步 vs 简化）**
 
-![](../images/17450_12.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/17450_12.webp)
 
 编辑​
 

docs/菌群知识库/categories/技术/223_谷禾肠道菌群取样储存盒.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["105"]
 date: "2026-05-03"
-images: ["../images/223_1.jpg", "../images/223_2.jpg", "../images/223_3.png", "../images/223_4.png", "../images/223_5.png", "../images/223_6.jpg"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/223_1.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/223_2.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/223_3.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/223_4.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/223_5.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/223_6.jpg"]
 scraped: "2026-08-10T08:02:24.564Z"
 ---
 
@@ -22,7 +22,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:02:24.564Z"
 
 下图是取样装置：
 
-![](../images/223_2.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/223_2.jpg)
 
 整个取样盒包括：棉签、取样管（内含裂解液和稳定液）、回寄袋
 
@@ -48,9 +48,9 @@ scraped: "2026-08-10T08:02:24.564Z"
 
 仅需使用棉签从厕纸上沾取粪便，然后洗脱到取样管的保存液中即可，使保存液可见粪便颜色即表示取样量足够。
 
-![](../images/223_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/223_3.png)
 
-![](../images/223_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/223_4.png)
 
 取样储存管性能
 
@@ -62,7 +62,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:02:24.564Z"
 
 下面来看一下取样管在不同条件下的保存效果，我们使用凝胶电泳来检测不同保存处理条件下提取菌群DNA的状态：
 
-![](../images/223_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/223_5.png)
 
 可以看到，使用谷禾保存管的DNA样品即便在存储至60天仍然没有出现明显的DNA降解情况。
 
@@ -80,7 +80,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:02:24.564Z"
 
 下图可以看到我们使用谷禾提取方法与MoBio试剂盒比较以及重复提取的菌群相关性。另外同时比较了使用谷禾取样管保存不同天数后的提取菌群结果。
 
-![](../images/223_6.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/223_6.jpg)
 
 																	
 					

docs/菌群知识库/categories/技术/237_菌群16s测序.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["109"]
 date: "2026-05-03"
-images: ["../images/237_1.jpg", "../images/237_2.jpg"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/237_1.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/237_2.jpg"]
 scraped: "2026-08-10T08:02:22.758Z"
 ---
 
@@ -32,7 +32,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:02:22.758Z"
 
 我们的测序平台使用二代高通量测序平台。
 
-![](../images/237_2.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/237_2.jpg)
 
 以下是谷禾测序检测的数据参数：
 

docs/菌群知识库/categories/技术/240_精准健康检测报告及解读.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["110"]
 date: "2026-05-03"
-images: ["../images/240_1.jpeg", "../images/240_2.jpg", "../images/240_3.png", "../images/240_4.png", "../images/240_5.png", "../images/240_6.png", "../images/240_7.png", "../images/240_8.png", "../images/240_9.png", "../images/240_10.png", "../images/240_11.png", "../images/240_12.png", "../images/240_13.png"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/240_1.jpeg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/240_2.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/240_3.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/240_4.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/240_5.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/240_6.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/240_7.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/240_8.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/240_9.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/240_10.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/240_11.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/240_12.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/240_13.png"]
 scraped: "2026-08-10T08:02:21.712Z"
 ---
 
@@ -46,7 +46,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:02:21.712Z"
 
 对每种疾病、营养指标都采用包括深度学习和基于决策树的人工智能模型进行预测和分析。
 
-![](../images/240_2.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/240_2.jpg)
 
 为了获得稳定可靠的预测效果，我们在模型构建和样本选择上经过多次迭代更新，针对肠道菌群数据开发了一系列优化方法，最终达到极高的准确度。
 
@@ -76,7 +76,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:02:21.712Z"
 
 <40:多项疾病高风险，菌群严重破坏
 
-![](../images/240_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/240_3.png)
 
 ## 肠道菌群构成
 
@@ -98,7 +98,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:02:21.712Z"
 
 下图给出了主要的菌群状况评估：
 
-![](../images/240_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/240_4.png)
 
 **说明：报告中的分值包括两种数值类型，一类是0~100的分值，另一类是0~1的分值。**
 
@@ -112,21 +112,21 @@ scraped: "2026-08-10T08:02:21.712Z"
 
 目前的有害菌包括致病菌和条件致病菌，以及属内主要菌种为致病菌的属。为便于统计，我们在计算的时候统一按照属层级进行计算比例。下表是我们归属于有害菌的属。
 
-![](../images/240_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/240_5.png)
 
 另外报告中还会给出详细的主要菌属的丰度和人群分布情况。更加详细的数据表可以点击
 
 下载完整菌群构成表
 
-## ![](../images/240_6.png)
+## ![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/240_6.png)
 
 此外报告专门将常见益生菌和有益菌列出：
 
-![](../images/240_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/240_7.png)
 
 根据我们大量人群样本数据的统计和分析，我们从菌的层面提取了和不同疾病相关的菌，并监测其是否超标，超标标准为超出99%的人群或低于1%人群。
 
-![](../images/240_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/240_8.png)
 
 ## 疾病风险评估
 
@@ -134,11 +134,11 @@ scraped: "2026-08-10T08:02:21.712Z"
 
 目前我们疾病风险检测部分包括16类主要疾病，根据疾病检测准确度和稳定性，我们将检测疾病的水平分为三个等级：诊断级、预防级和提示级。
 
-![](../images/240_9.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/240_9.png)
 
 最终报告中，疾病风险以0~1的分值出现，并根据分值分为不同的提示级别，见下图：
 
-![](../images/240_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/240_10.png)
 
 根据每种病的分值，0~0.3归为低风险，0.3~0.5评估为注意，0.5~0.7为中等风险，超过0.7为高风险。
 
@@ -154,7 +154,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:02:21.712Z"
 
 **注意：本检测目前尚不属于医疗诊断，疾病分值作为提示，低分值不代表完全没有疾病，只表示风险较低，也可能存在一定的未检出。高分值只表示存在很大疾病风险，疾病的确诊和精确诊断需要通过进一步的医疗检查确认。**
 
-![](../images/240_11.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/240_11.png)
 
 ## 营养饮食及个性化食物推荐
 
@@ -162,7 +162,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:02:21.712Z"
 
 报告中量化了包括主要饮食成分、主要氨基酸以及维生素和微量元素的水平。
 
-![](../images/240_12.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/240_12.png)
 
 其中的分值为在人群中的分布水平，代表的是您的单项营养水平位于人群中的位置，一般最佳的营养分值为70左右，过高或过低都可能不均衡。
 
@@ -178,7 +178,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:02:21.712Z"
 
 基于上述检测的营养饮食指标和疾病风险状况，我们结合不同食物的营养成分构成使用机器学习和统计方法计算了每种食物的推荐指数，从-100到+100。
 
-![](../images/240_13.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/240_13.png)
 
 注：低于2岁以下婴儿，本食物推荐表仅做参考，也可作为母乳喂养妈妈的饮食参考。
 

docs/菌群知识库/categories/技术/2524_微生物浅宏基因组科研测序服务.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["28"]
 date: "2026-08-27"
-images: ["../images/2524_2.png", "../images/2524_4.png", "../images/2524_6.png", "../images/2524_7.png"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2524_2.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2524_4.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2524_6.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2524_7.png"]
 scraped: "2026-08-10T07:54:27.030Z"
 ---
 
@@ -19,7 +19,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:54:27.030Z"
 
  宏基因组测序方案是针对16s分辨率和宏基因组高成本之间的一个**折中方案**，通过**降低测序深度**，每个样本**100万**reads左右，但是物种的分辨率并没有一般宏基因组（普遍5~10G数据量）差很多。  不通过拼接组装，直接基于kraken2等kmer，或MetaPhlAn2等标记基因的参考基因组方法进行种属丰度分类。结合其到菌株的物种分类和丰度数据可较16s方案下的PICRUST更加准确的预测基因构成。 
 
-![](../images/2524_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2524_2.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/08/9-1024x616.png)
 
@@ -45,7 +45,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:54:27.030Z"
 
 ## 报告内容
 
-![](../images/2524_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2524_4.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/08/浅宏基因组分析内容-467x1024.png)
 
@@ -53,9 +53,9 @@ scraped: "2026-08-10T07:54:27.030Z"
 
 当测序深度达到50万reads以上，浅宏基因组与深度测序宏基因组在主要物种构成的丰度已经基本一致。如下图所示：
 
-![](../images/2524_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2524_6.png)
 
-![](../images/2524_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2524_7.png)
 
 ## 谷禾优势
 

docs/菌群知识库/categories/技术/2687_宏观生态规律如何应用于描述微生物群落的多样性和变化.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["16"]
 date: "2026-09-28"
-images: ["../images/2687_2.jpg", "../images/2687_3.jpg", "../images/2687_4.jpg", "../images/2687_5.jpg", "../images/2687_6.jpg", "../images/2687_7.png", "../images/2687_9.jpg", "../images/2687_11.jpg"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2687_2.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2687_3.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2687_4.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2687_5.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2687_6.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2687_7.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2687_9.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2687_11.jpg"]
 scraped: "2026-08-10T07:53:47.248Z"
 ---
 
@@ -19,7 +19,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:53:47.248Z"
 
 宏观生态学中研究最多的模式是物种分度分布(SAD)，它被定义为具有给定丰度的物种的比例。研究中虽然对SAD进行了高度的研究和表征，但往往忽略了三个不同而独立的变异源对其的影响:采样噪声、个体物种丰度的波动和物种间丰度的变化。最近，发表在《Nature Communications》的一篇文章使用来自许多不同环境的微生物群落的纵向和横截面数据从宏观生态学的角度研究微生物群落中物种的存在、丰度和多样性的模式。确定了三条普遍的，基本的宏观生态规律，这些规律定量地表征了单个物种在空间和时间上的丰度变化，以及不同物种之间典型丰度的差异。这三条宏观生态规律适用于整个微生物群落，也适用于横断面和剖面数据，因为它们足以在不拟合任何附加参数的情况下预测多样性的尺度和其他普遍研究的宏观生态模式，如SAD。利用这三条规律，人们可以预测物种的存在与否、群落的多样性和普遍研究的宏观生态模式。
 
-![](../images/2687_2.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2687_2.jpg)
 
 **背景**
 
@@ -31,17 +31,17 @@ scraped: "2026-08-10T07:53:47.248Z"
 
 SLM模型
 
-![](../images/2687_3.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2687_3.jpg)
 
-![](../images/2687_4.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2687_4.jpg)
 
-![](../images/2687_5.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2687_5.jpg)
 
 **主要结果**
 
 1. 三个宏观生态学规律：丰度波动是伽马分布的；Taylor定律；平均丰度呈对数正态分布。
 
-![](../images/2687_6.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2687_6.jpg)
 
 丰度波动分布(AFD)，它被定义为物种丰度在群落之间的分布。这个数量受到抽样误差的强烈影响，特别是当一个物种因为波动而变得稀少的时候。对于最丰富的物种，这些抽样误差可以忽略不计。b图描述了物种丰度在群落间的分布。图例代表不同数据集。实心黑线为伽玛分布, 很好地描述了整个微生物群落中丰富物种的AFD。
 
@@ -49,7 +49,7 @@ SLM模型
 
 平均丰度分布(MAD)，描述了平均丰度是如何在物种间分布的。d图表示MAD呈对数正态分布。由于在有限数量的样本中，稀有物种可能永远不会被采样，因此实证的MAD显示出一个由抽样确定的较低的截止值。通过对无限次重复取平均值，会发现，在中性模型中，MAD则呈Delta分布。
 
-![](../images/2687_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2687_7.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/09/3-3.jpg)
 
@@ -59,7 +59,7 @@ Gamma AFD规律表示所有物种缺失的情况都应该归因于抽样误差
 
 了解了这三个定律及其参数，并假设物种丰度波动是独立的，就可以为任意水平的抽样生成合成群落。通过比较它们的统计特性，将人造合成的群落与实证的群落进行对比。图中从a-d列举了四种宏观生态模式研究，结果表明这些宏观生态模式的预测与数据准确吻合。
 
-![](../images/2687_9.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2687_9.jpg)
 
 a. 多样性(以物种数量衡量)与读取总reads数的比例
 
@@ -81,7 +81,7 @@ a-c.基于纵向时态数据的群落中物种间丰度变化。结果表明这
 
 研究人员认为SLM是用来描述物种种群动态的。SLM假设种群数量呈逻辑增长，增长速率随时间的变化而变化，其波动速度快于平均增长率(即，与增长率波动相关的时间尺度比种群动态的典型时间尺度短得多)。
 
-![](../images/2687_11.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2687_11.jpg)
 
 d-f. 随机Logistic模型(SLM)分别再现了三大宏观生态规律。灰色的圆圈是通过SLM得到的结果，黑色十字架是采用SLM和抽样得到的结果。
 

docs/菌群知识库/categories/技术/2924_人类微生物组测序数据的聚类：基于距离的无监督学习模型.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
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 tags: ["16s", "130", "128", "129"]
 date: "2026-11-02"
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 scraped: "2026-08-10T07:53:10.581Z"
 ---
 
@@ -17,7 +17,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:53:10.581Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/2924_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2924_2.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/11/1-1024x436.png)
 
@@ -25,7 +25,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:53:10.581Z"
 
 通常使用16S rRNA技术量化微生物群落的组成，但量化后的数据是偏斜的，带有过多的0。目前还缺乏对复杂的微生物群落测序数据的标准化的聚类分析方法。
 
-![](../images/2924_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2924_4.png)
 
 近日，加拿大多伦多大学研究人员在《Microorganisms》上发表的一篇研究，针对上述问题构建了一个参数化的混合模型用于计算聚类分析的距离度量，模型根据观察到的OTU计数和估计的混合权重产生sample-specific的分布。这个方法可以准确的估计真实的0比例，从而构建一个精确的beta多样性度量。
 
@@ -63,11 +63,11 @@ scraped: "2026-08-10T07:53:10.581Z"
 
 **4.  用于聚类的分区算法（PAM）**
 
-![](../images/2924_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2924_5.png)
 
 使用混合分布的聚类过程的详细步骤：
 
-![](../images/2924_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2924_6.png)
 
 # 模拟研究及其结果
 
@@ -81,21 +81,21 @@ Jaccard指数衡量聚类结果与原始聚类标签之间的相似性，原始
 
 下图展示了模拟数据的准确性。评估了三种不同的0的比例（ZP）情况，左中右分别为高ZP、中等ZP、低ZP。
 
-![](../images/2924_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2924_7.png)
 
 下图展示了模拟数据的Jaccard指数。同上图一样评估了三种不同的0的比例。
 
-![](../images/2924_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2924_8.png)
 
 以上两图显示了具有不同ZP和子类数量的不同场景下模拟数据集的聚类结果。通过准确率和Jaccard指数对基于距离的算法性能进行了评估。填充颜色为绿色的箱形图为研究人员建议使用的距离度量。所有的距离都是根据相对丰度计算的。
 
 Table1平均准确率（MA）和平均Jaccard指数（MJI）估计。粗体表示每个方案下的最佳情况。Log表示对输入的模拟数据进行了对数变换。
 
-![](../images/2924_9.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2924_9.png)
 
 Table2所有模拟场景的平均集群数。根据Dunn内部指数计算出每次重复的最优聚类数。
 
-![](../images/2924_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2924_10.png)
 
 Table1 的结果是通过对每个场景中的100个重复结果求平均值计算得出的。观察得到在聚类算法中实现的距离度量（即绿色标识的箱形图）的准确率和Jaccard指数都优于其他距离度量，特别是在数据集中包含大量0时（高ZP）。在MA和MJI方面，L2范数也显示了其优势，在基于100次重复计算的L2范数在两个子类场景下的；平均准确率约为0.6秒，在三个子类场景下的平均准确率为0.45。而广义Unifrac距离（gUniFrac）在准确性估计中有很大的波动变化。
 
@@ -103,13 +103,13 @@ Table1 的结果是通过对每个场景中的100个重复结果求平均值计
 
 数据集为197名PD患者和130名对照的粪便样本的16S rRNA测序数据。首先过滤掉在80%的OTU中相对丰度都为0的OTU，因此，此次分析中共使用280个OTUs。将基于相对丰度计算的L2范数与其他三个距离度量进行了比较，包括对数变换和不变换的比较。
 
-![](../images/2924_11.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2924_11.png)
 
 如Table3所示，距离度量采用各种内部验证指标（列名）进行灵敏度分析。对于Dunn和Xie-Beni指数，l2范数倾向于将数据聚类为两到三个亚群，而在有和没有对数变换的情况下，除了未变换的欧氏距离外，Manhattan、Euclidean和Bray-Curtis更倾向于聚类更多的亚群。（设置了最多聚类数目为10）
 
 接着选择L2-D PDF范数作为进一步分析的例子。
 
-![](../images/2924_12.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2924_12.png)
 
 结果在Table4中展示，对数据集中的两个集群之间的OTUs进行了探索，得到了聚类之间差异最大的前5个OTU。
 

docs/菌群知识库/categories/技术/2936_生物数据可视化着色的十个简单规则.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["126", "125", "143", "127"]
 date: "2026-11-02"
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 scraped: "2026-08-10T07:53:08.086Z"
 ---
 
@@ -23,7 +23,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:53:08.086Z"
 
 生物数据的可视化处理是计算机图形学，科学可视化和信息可视化在生命科学各个领域的应用。
 
-![](../images/2936_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2936_2.png)
 
 本文将介绍10条简单的规则来对生物数据进行可视化着色。
 
@@ -91,7 +91,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:53:08.086Z"
 
 表1 四个层次的测量
 
-![](../images/2936_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2936_3.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/11/1-3-1024x401.png)
 
@@ -113,7 +113,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:53:08.086Z"
 
 表2  常用色彩空间的优缺点
 
-![](../images/2936_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2936_5.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/11/2-2-1024x396.png)
 
@@ -167,7 +167,7 @@ LUV和LAB都追求**感知一致性**。虽然两者都已被CIE(国际照明委
 
 下图描绘了青色调中的三个调和示例。应该注意颜色的小点，以描绘出特定的色调排列(单色、相似和互补)。
 
-![](../images/2936_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2936_7.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/11/3-2-1024x399.png)
 
@@ -189,7 +189,7 @@ LUV和LAB都追求**感知一致性**。虽然两者都已被CIE(国际照明委
 
 下图展示出了每个数据类型的调色板的例子。
 
-![](../images/2936_9.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2936_9.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/11/4-2-1024x548.png)
 
@@ -221,7 +221,7 @@ LUV和LAB都追求**感知一致性**。虽然两者都已被CIE(国际照明委
 
 在下图中，我们展示了一个热图，描述了不同字符串之间的Jaccard索引和由分层聚类提供的背景信息。
 
-![](../images/2936_11.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2936_11.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/11/5-2-1024x391.png)
 
@@ -239,7 +239,7 @@ LUV和LAB都追求**感知一致性**。虽然两者都已被CIE(国际照明委
 
 下图显示了一个数据视觉的例子，其中白色可以与灰色背景区分开来，比如在你的电脑屏幕上。然而，同样的白线在白色背景下很难区分，也许当打印在白纸上时。当白线变成黄线时，情况就解决了。
 
-![](../images/2936_13.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2936_13.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/11/6-2-1024x802.png)
 
@@ -247,7 +247,7 @@ LUV和LAB都追求**感知一致性**。虽然两者都已被CIE(国际照明委
 
 在生物数据可视化中，通常会看到**红色/蓝色**的数据可视化。由于同时对比，对红/蓝颜色组合的偏好是可以解释的。下图就是这种情况。
 
-![](../images/2936_15.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2936_15.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/11/7（有两张重复的）-1-1024x454.png)
 
@@ -267,7 +267,7 @@ LUV和LAB都追求**感知一致性**。虽然两者都已被CIE(国际照明委
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/11/7（有两张重复的）-2-1024x454.png)
 
-![](../images/2936_18.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2936_18.png)
 
 在某些情况下，感知的一致性至关重要。一个简单的例子是，在不规则的颜色空间中，选择一种随机的颜色以便在黑暗的背景下可读，这是很困难的，因为**相同亮度或光度的颜色看起来非常不同**(蓝色和黄色在HSV中都有100%的亮度，但是蓝色比黄色暗得多)。
 
@@ -279,7 +279,7 @@ LUV和LAB都追求**感知一致性**。虽然两者都已被CIE(国际照明委
 
 下图描述了这些部分。
 
-![](../images/2936_19.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2936_19.png)
 
 虽然许多研究人员都在抱怨它的误导，但在实际许多应用中，基于彩虹的调色板仍然在被使用，并且有可能对解决任务的准确性有潜在的负面影响。
 
@@ -309,7 +309,7 @@ LUV和LAB都追求**感知一致性**。虽然两者都已被CIE(国际照明委
 
 基于包含3种最流行的抗生素对16种细菌的性能的数据，我们在下图中展示了青霉素与新霉素的有效性的2个实例数据。
 
-![](../images/2936_20.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2936_20.png)
 
 虽然选择蓝色/橙色的配色方案是为了为名义比较提供可感知的可分辨颜色（左），但采用革兰氏染色颜色惯例呈现出更适合具体问题的颜色用法（右）。
 
@@ -329,7 +329,7 @@ LUV和LAB都追求**感知一致性**。虽然两者都已被CIE(国际照明委
 
 另一个值得注意的工具是Viz调色板。它允许通过模拟选定的信息可视化示例来测试特定调色板的颜色缺陷。下图结合了3个工具，ColorBrewer, Viz Palette和 Coblis，提供了一个用例的例子。
 
-![](../images/2936_21.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2936_21.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/11/10-1-853x1024.png)
 
@@ -383,19 +383,19 @@ LUV和LAB都追求**感知一致性**。虽然两者都已被CIE(国际照明委
 
 着色并不容易。如果对颜色有需求，可以选择适合并使用**少量的颜色**，**避免饱和的颜色**，并且要符合阅读者的期望。
 
-![](../images/2936_23.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2936_23.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/11/11-1-1024x395.png)
 
-![](../images/2936_25.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2936_25.png)
 
-![](../images/2936_26.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2936_26.png)
 
 以上两图详细说明了根据示例任务的黑白数据可视化的变化。安全选择的一个例子是选择一种颜色和几种灰色阴影。
 
 最后，总结一下这十种规则。
 
-![](../images/2936_27.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2936_27.png)
 
 【参考文献】
 

docs/菌群知识库/categories/技术/3104_链读测序技术在宏基因组组装研究中的应用.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
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 tags: ["215", "217", "128", "216"]
 date: "2026-11-26"
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 scraped: "2026-08-10T07:52:18.623Z"
 ---
 
@@ -21,7 +21,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:52:18.623Z"
 
 近日，香港浸会大学研究人员发表文章 “通过链读测序对宏基因组组装全面研究”。
 
-![](../images/3104_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3104_2.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/11/19755286-df8149f277c91120-1024x567.png)
 
@@ -93,7 +93,7 @@ Kraken v0.10.6基于内置数据库MiniKrakenDB为bins做物种注释。每个bi
 
 来自人类肠道菌群和Illumina短序列链读序列二次抽样的组装效果统计
 
-![](../images/3104_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3104_4.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/11/19755286-498be6f9399a0cd7-1024x380.png)
 
@@ -103,7 +103,7 @@ SC-all，模拟菌群和人类肠道菌群总共的两个测序lane链读序列
 
 在链读测序中，有四个关键参数可能会影响宏基因组组装，如下图。
 
-![](../images/3104_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3104_6.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/11/19755286-8b040ef0df5cadc6-1024x693.png)
 

docs/菌群知识库/categories/技术/3147_宏基因组测序中短序列的注释.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["metagenehunt", "232", "234", "128", "233"]
 date: "2026-12-07"
-images: ["../images/3147_1.png", "../images/3147_2.png", "../images/3147_5.png", "../images/3147_7.png"]
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 scraped: "2026-08-10T07:52:08.842Z"
 ---
 
@@ -19,7 +19,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:52:08.842Z"
 
 宏基因组中**短序列的注释**是理解测序微生物群落潜在功能的**重要步骤之一**。单纯利用**局部匹配**的注释容易**混淆**那些蛋白同源性且局部序列非常相似的序列，进而不能真实准确**反映复杂蛋白质**家族中多变的结构和功能域。
 
-![](../images/3147_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3147_2.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/12/19755286-6366878d05adc04a-1-1024x436.png)
 
@@ -55,7 +55,7 @@ MetaGeneHunt的设计基于MG-RAST平台注释的数据集的。在使用GeneHun
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/12/19755286-3992146429698eff.png)
 
-![](../images/3147_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3147_5.png)
 
 a).横轴为目标区域的原始hit-count，纵轴为标准化后的hit-count，图中的颜色阶梯表示目标区域的长度。这种标准化主要影响长度短的域(例如，GH78、GH25)、小的亚域(例如，GH31N、GH36C)和目标区域的附属域(例如，CMB5_12)。
 
@@ -75,7 +75,7 @@ c).NMDS分析(2D stress=0.020)，展示了在样本聚类中都存在的这些
 
 微生物组中的结构-功能关系，**多样性仍然与潜在功能高度相关**。胃和盲肠的群落在结构和功能上是**最多样化**的。其次，**肠道中的群落组成和功能大多是保守的**，而与保守的微生物群落相关的大肠则显示出可变功能潜力。
 
-![](../images/3147_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3147_7.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/12/19755286-fd4ed608f008a001.png)
 

docs/菌群知识库/categories/技术/3346_以呼吸道微生物组研究为例：探索一步或两步PCR方案在16S V3V4与V4基因区域的偏差.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["16s", "pcr", "300", "296", "232", "299"]
 date: "2026-01-19"
-images: ["../images/3346_1.png", "../images/3346_2.png", "../images/3346_3.png", "../images/3346_4.png", "../images/3346_5.png", "../images/3346_6.png", "../images/3346_7.png", "../images/3346_8.png", "../images/3346_9.png"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3346_1.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3346_2.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3346_3.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3346_4.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3346_5.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3346_6.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3346_7.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3346_8.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3346_9.png"]
 scraped: "2026-08-10T07:51:26.649Z"
 ---
 
@@ -65,7 +65,7 @@ Setup3（一步PCR，V4区域）
 
 下图完整的展示了三个PCR设置下的使用呼吸道样本的生物信息学过滤步骤：
 
-![](../images/3346_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3346_2.png)
 
 最终：
 
@@ -81,17 +81,17 @@ Setup3（一步PCR，V4区域）
 
 在设置1中进行了四次测序，设置2和设置3分别进行了一次。
 
-![](../images/3346_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3346_3.png)
 
 与预期丰度（Expected）相比，柱状图中观察到三种PCR设置下的各菌属的相对丰度与预期丰度相差不大，表中数据显示，三种PCR设置都在**恢复高丰度物种方面具有最高的效率**，但**设置3**在回收低丰度物种时的效率**最低**。
 
-![](../images/3346_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3346_4.png)
 
 **2.  对阴性对照样品的分析**
 
-![](../images/3346_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3346_5.png)
 
-![](../images/3346_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3346_6.png)
 
 从上至下分别为设置123测序后，在NCS样品中观察到的**20**种最丰富的ASV。通过R包Decontam去除污染物，在设置23之间差异最大的是属于肠杆菌科的ASV，与后续的对水样品进行设置23下的测序分析结果相比较，发现大肠杆菌ASV就是在建库步骤中使用设置3的试剂时引入的污染物。
 
@@ -99,15 +99,15 @@ Setup3（一步PCR，V4区域）
 
 在去除污染物前后，代表为呼吸道菌群的链球菌，普雷伏氏菌，Veillonella和Rothia属的相对丰度变化不大，而去除污染物后，预测作为污染物代表的数量较少的物种被滤出。基于主坐标分析，发现高细菌载量的OW样品聚集在一起，低细菌载量PBAL，PSB一句设置23分离开。
 
-![](../images/3346_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3346_7.png)
 
 去除污染物之前的三种类型样品的三种PCR设置下的物种分类
 
-![](../images/3346_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3346_8.png)
 
 去除污染物后的
 
-![](../images/3346_9.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3346_9.png)
 
 从左至右分别为去除污染物前后的未加权UniFrac距离的主坐标分析
 

docs/菌群知识库/categories/技术/3369_MetaGEM：直接从宏基因组重建基因组规模的代谢模型.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["metagem", "305", "308", "215", "307"]
 date: "2026-01-27"
-images: ["../images/3369_2.png", "../images/3369_3.png", "../images/3369_4.png", "../images/3369_5.png", "../images/3369_6.png", "../images/3369_7.png", "../images/3369_8.png", "../images/3369_9.png", "../images/3369_10.png"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3369_2.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3369_3.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3369_4.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3369_5.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3369_6.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3369_7.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3369_8.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3369_9.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3369_10.png"]
 scraped: "2026-08-10T07:51:19.968Z"
 ---
 
@@ -41,7 +41,7 @@ MetaGEM**可以不依赖参考基因组**，直接从**短读**的宏基因组
 
 二是一个来自宏基因组生物群落的14,000多个MAGs，包括3750份高质量的MAGs，以及来自人类肠道微生物组研究和全球微生物组项目的相应的随时可用的GEMs。
 
-![](../images/3369_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3369_2.png)
 
 整个流程使用Snakemake实现，从原始的宏基因组的fastq文件开始，质控、组装、估计contig覆盖率、binning、Bin的改进和重组、MAG丰度定量和物种分类、CarveMe进行基因组规模代谢模型重建及质量报告，Smetana模拟重建的基因组规模代谢模型的肠道微生物群落。
 
@@ -69,25 +69,25 @@ MetaGEM模型与EMBL、AGORA、KBase和Bigg模型相比较
 
 利用基于定位的方法(方法)生成的丰度估计值与基于标记基因的丰度估计值**完全相关**；
 
-![](../images/3369_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3369_3.png)
 
 MetaGEM和其他模型都具有类似数量的反应和代谢物，但基因数量相比较少；
 
-![](../images/3369_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3369_4.png)
 
 通过计算模型之间成对的代谢之间的距离，发现MetaGEM具有相似的酶**多样性分布**；
 
-![](../images/3369_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3369_5.png)
 
 可以捕捉到种水平物种间的**显著的代谢差异**。高达60%的代谢多样性存在于物种泛基因组中，metaGEM模型捕获的物种内代谢变异程度显著
 
-![](../images/3369_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3369_6.png)
 
 与基于参考基因组的肠道物种代谢模型AGORA比较，发现基于参考的模型引入的代谢反应不一定存在于每个宏基因组环境中，而MetaGEM模型是完全基于**实际的宏基因组在特定环境下重建的代谢模型**。
 
 AGORA和MetaGEM模型的EC数的交集在48.9%到69%之间，其中53.9%的情况下MetaGEM模型比相应的AGORA模型包含更多的EC数。
 
-![](../images/3369_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3369_7.png)
 
 研究健康和代谢受损的2型糖尿病患者肠道微生物群落中潜在的微生物代谢相互作用。
 
@@ -97,9 +97,9 @@ AGORA和MetaGEM模型的EC数的交集在48.9%到69%之间，其中53.9%的情
 
 不同的2型糖尿病疾病组(NGT、IGT、T2D)相对应的肠道代谢基因组产生具有不同代谢结构的群落。
 
-![](../images/3369_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3369_8.png)
 
-![](../images/3369_9.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3369_9.png)
 
 # 结 语  
 
@@ -111,7 +111,7 @@ MetaGEM具有完善的流程，搭载的工具也是生物信息分析中常用
 
 关于文中MetaGEM流程搭建所应用到的宏基因组分析软件，这其中也有我们常用的软件，比如fastp、MEGAHIT、bwa、SAMtools、metaWRAP，它们在处理数据时非常的方便也易于上手。
 
-![](../images/3369_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3369_10.png)
 
 参考文献：
 

docs/菌群知识库/categories/技术/3420_肠道菌群取样方法.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["327", "326", "203"]
 date: "2026-03-02"
-images: ["../images/3420_1.jpg", "../images/3420_2.png", "../images/3420_3.png", "../images/3420_4.png", "../images/3420_5.gif", "../images/3420_6.jpg", "../images/3420_7.jpg", "../images/3420_8.jpg", "../images/3420_9.png"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3420_1.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3420_2.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3420_3.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3420_4.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3420_5.gif","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3420_6.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3420_7.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3420_8.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3420_9.png"]
 scraped: "2026-08-10T07:50:56.313Z"
 ---
 
@@ -25,7 +25,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:50:56.313Z"
 
 # 取 样 装 置
 
-![](../images/3420_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3420_2.png)
 
 **整个取样盒包括：**
 
@@ -57,7 +57,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:50:56.313Z"
 
 仅需使用棉签从厕纸上沾取粪便，然后洗脱到取样管的保存液中即可，使保存液可见粪便颜色即表示取样量足够。
 
-![](../images/3420_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3420_3.png)
 
 # 稳定的取样储存管性能  
 
@@ -71,7 +71,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:50:56.313Z"
 
 下面来看一下取样管在不同条件下的保存效果，我们使用凝胶电泳来检测不同保存处理条件下提取菌群DNA的状态：
 
-![](../images/3420_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3420_4.png)
 
 可以看到，使用谷禾保存管的DNA样品即便在存储至60天仍然没有出现明显的DNA降解情况。
 
@@ -93,15 +93,15 @@ scraped: "2026-08-10T07:50:56.313Z"
 
 现有样本处理量450例/天
 
-![](../images/3420_5.gif)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3420_5.gif)
 
 下图可以看到我们使用谷禾提取方法与MoBio试剂盒比较以及重复提取的菌群相关性。另外同时比较了使用谷禾取样管保存不同天数后的提取菌群结果。
 
-![](../images/3420_6.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3420_6.jpg)
 
 # 专业的实验环境
 
-![](../images/3420_7.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3420_7.jpg)
 
 专业的实验环境
 
@@ -111,11 +111,11 @@ scraped: "2026-08-10T07:50:56.313Z"
 
 二级生物安全实验室
 
-![](../images/3420_8.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3420_8.jpg)
 
 注：生物安全实验室的分级
 
-![](../images/3420_9.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3420_9.png)
 
 生物安全实验室一般实施两级隔离。一级隔离通过生物安全柜、负压隔离器、正压防护服、手套、眼罩等实现；二级隔离通过实验室的建筑、空调净化和电气控制系统来实现。
 

docs/菌群知识库/categories/技术/349_君验精准健康检测报告更新日志.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["95"]
 date: "2026-07-25"
-images: ["../images/349_1.jpeg"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/349_1.jpeg"]
 scraped: "2026-08-10T08:02:01.251Z"
 ---
 

docs/菌群知识库/categories/技术/3607_谷禾健康肠道菌群健康检测介绍.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["382", "381", "383", "380"]
 date: "2026-03-23"
-images: []
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/"]
 scraped: "2026-08-10T07:40:43.244Z"
 ---
 

docs/菌群知识库/categories/技术/3654_谷禾16s微生物多样性测序分析报告解读 （上）.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["16s", "16s--"]
 date: "2026-03-29"
-images: []
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/"]
 scraped: "2026-08-10T07:50:01.250Z"
 ---
 

docs/菌群知识库/categories/技术/3660_谷禾16s微生物多样性测序分析报告解读 （下）.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["16s--"]
 date: "2026-03-29"
-images: []
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/"]
 scraped: "2026-08-10T07:50:02.226Z"
 ---
 

docs/菌群知识库/categories/技术/3771_ResistoXplorer——基于Web的耐药基因组数据可视化，统计和探索新分析工具.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["resistoxplorer", "web", "442", "215", "343", "441"]
 date: "2026-04-13"
-images: ["../images/3771_1.png", "../images/3771_3.png", "../images/3771_4.png", "../images/3771_5.png", "../images/3771_6.png", "../images/3771_7.jpeg", "../images/3771_8.png", "../images/3771_11.png", "../images/3771_13.png", "../images/3771_14.png", "../images/3771_15.png", "../images/3771_16.png", "../images/3771_17.png"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3771_1.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3771_3.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3771_4.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3771_5.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3771_6.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3771_7.jpeg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3771_8.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3771_11.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3771_13.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3771_14.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3771_15.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3771_16.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3771_17.png"]
 scraped: "2026-08-10T07:49:18.217Z"
 ---
 
@@ -41,7 +41,7 @@ ResistoXplorer的主要功能包括：
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2021/04/1-4-1024x361.png)
 
-![](../images/3771_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3771_3.png)
 
 由三个主要分析模块组成(上图红色箭头所指框内)：
 
@@ -61,11 +61,11 @@ ResistoXplorer的主要功能包括：
 
 Manuals是使用手册，对用户进行操作指导，建议仔细阅读。
 
-![](../images/3771_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3771_4.png)
 
 Downloads，提供了示例上传文件和单个数据库的下载
 
-![](../images/3771_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3771_5.png)
 
 ** 分析流程 **
 
@@ -75,7 +75,7 @@ ResistoXplorer的功能注释使用的参考数据库来自9个通用的AMR数
 
 此外，研究人员还从BacMet数据库和抗菌肽(AMP)耐药基因数据集中手动构建了功能注释信息，使用户能够对抗菌药物/金属和AMP抗性基因进行功能分析和下游分析。
 
-![](../images/3771_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3771_6.png)
 
 **数据处理、分析及结果**
 
@@ -89,9 +89,9 @@ ResistoXplorer的功能注释使用的参考数据库来自9个通用的AMR数
 
 **成分分析**
 
-![](../images/3771_7.jpeg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3771_7.jpeg)
 
-![](../images/3771_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3771_8.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2021/04/5-1-1024x653.jpeg)
 
@@ -127,13 +127,13 @@ C）随机森林
 
 D）展示了SVM在特征(变量)数量减少的情况下的分类性能
 
-![](../images/3771_11.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3771_11.png)
 
 **其他的一些可视化分析**
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2021/04/8-3-1024x936.png)
 
-![](../images/3771_13.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3771_13.png)
 
 用户可以根据样本的丰度和流行程度，执行核心抗性分析来检测样本或样本组中存在的核心特征集，以热图的形式展现；以及关联分析和层次聚类，使用热图或者树状图可视化。
 
@@ -145,7 +145,7 @@ D）展示了SVM在特征(变量)数量减少的情况下的分类性能
 
 用两种基于多变量相关性的方法来确定微生物组和AMR数据集之间的总体相似性，分别为普鲁克分析（PA）和协惯量分析（CIA），在各种功能和分类级别上执行分析。相似系数和P值用于评估两个数据集之间的关联的强度和显著性，相似性系数在0到1之间，0表示两个数据集之间的完全相似，而1表示两个数据集之间的完全不相似。可视化结果用2D和3D排序图表示，如下图
 
-![](../images/3771_14.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3771_14.png)
 
 A) 来自普鲁克分析的3D NMDS图，包含与数据集相关的样本、形状和颜色。
 
@@ -155,7 +155,7 @@ B) 来自协惯量分析的3D PCoA图，其中连接两点的线的长度表示
 
 基于多变量投影的探索性方法，如正则化典型相关分析(RCCA)和稀疏偏最小二乘法(SPLS)，用于微生物组和AMR数据的集成。这些方法旨在突出高维“组学”数据集之间的相关性。
 
-![](../images/3771_15.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3771_15.png)
 
 A 门水平微生物群落与ARGs(组水平)之间的聚类图像热图
 
@@ -165,7 +165,7 @@ B 显示存在于两个数据集中的特征(分类群/参数)的相关结构的
 
 使用单变量相关分析来确定单个菌群和ARGs(耐药基因组)之间是否存在强相关。使用Spearman、Pearson、CCLasso和最大信息系数（Maximal Information Coefficient）四种方法。用户可以使用绝对相关系数和调整p值的组合来选择强且显著的成对相关性。结果如下图，每个节点表示一个菌或ARG。用户可以双击一个节点，以突出显示网络中相应的相关节点。边缘的宽度和颜色表示两个节点之间相关性的强度和方向。
 
-![](../images/3771_16.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3771_16.png)
 
 **探索ARGs-微生物宿主网络**
 
@@ -177,7 +177,7 @@ B 显示存在于两个数据集中的特征(分类群/参数)的相关结构的
 
 顶部的水平工具栏显示了操纵网络的基本功能。第一个是颜色选择器，能够为下一次选择选择高亮颜色。还可以使用工具栏中的虚线方形图标选择并拖动多个节点。对当前网络中存在的ARGs进行功能富集分析，使用超几何测试方法，这种方法与网络可视化系统相结合，在解释AMR耐药机制和提供ARGs的可能传播路径信息可能会有更好的效果。
 
-![](../images/3771_17.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3771_17.png)
 
 文章中为了展示该工具的可用性，在已发表的一些研究中，选择了1个研究进行抗性分析，“利用商业饲养牛检验图拉霉素（抗菌药物）对肠道微生物组和耐药性的影响”，分析的内容就如同上面展示的那样，这里就不多加赘述。
 

docs/菌群知识库/categories/技术/4930_微生物组和组学成分数据分析之ALR对数转换.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["additive-log-ratio", "alr", "centered-log-ratio", "pca", "824", "820", "819", "825", "826"]
 date: "2026-11-20"
-images: ["../images/4930_1.png", "../images/4930_2.png", "../images/4930_3.png", "../images/4930_4.png", "../images/4930_5.png", "../images/4930_6.png", "../images/4930_8.png", "../images/4930_10.png", "../images/4930_11.png", "../images/4930_12.png", "../images/4930_13.png", "../images/4930_15.png", "../images/4930_17.png"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4930_1.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4930_2.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4930_3.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4930_4.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4930_5.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4930_6.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4930_8.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4930_10.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4930_11.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4930_12.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4930_13.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4930_15.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4930_17.png"]
 scraped: "2026-08-10T07:43:51.837Z"
 ---
 
@@ -17,7 +17,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:43:51.837Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/4930_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4930_2.png)
 
 编辑​
 
@@ -49,19 +49,19 @@ scraped: "2026-08-10T07:43:51.837Z"
 
 图一为所有3937个特征的Procrstes相关性直方图。为了直观地显示ALR变量接近**等距的程度**。
 
-![](../images/4930_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4930_3.png)
 
 图一
 
 图二显示了在ALR上计算的**所有样本间距离**，基于所有成对对数的对数距离或同等情况下的所有CLR绘制相应的精确对数距离。
 
-![](../images/4930_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4930_4.png)
 
 图二
 
 图三为对于数据集的89个样本，参考基因编号856的计数与计数总和之间成正比。
 
-![](../images/4930_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4930_5.png)
 
 图三
 
@@ -69,13 +69,13 @@ scraped: "2026-08-10T07:43:51.837Z"
 
 而图五中展示了具有参考基因856的ALR的对应**PCA**。主成分分析与参考成分微生物基因编号为856时，其几何形状实际上与确切的直线**几何形状相同**(Procrstes相关=0.9991)。字母S和F代表进行测序的**两个实验室，显示出明显的分离**。
 
-![](../images/4930_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4930_6.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2021/11/4-3-1024x897.png)
 
 图四
 
-![](../images/4930_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4930_8.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2021/11/5-3-1024x885.png)
 
@@ -87,11 +87,11 @@ scraped: "2026-08-10T07:43:51.837Z"
 
 总对数方差 0.2099，Procrustes相关系数最高为0.9977，对应转录本编号1318，其中转录本编号1179的Procrustes相关系数也与其相似。
 
-![](../images/4930_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4930_10.png)
 
 图六
 
-![](../images/4930_11.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4930_11.png)
 
 图七
 
@@ -101,11 +101,11 @@ scraped: "2026-08-10T07:43:51.837Z"
 
 图八展示**完整数据集的LRA**，图九展示了参考转录本编号1179的ALR的PCA。它们实际上是相同的，只是有很小的差异，而在这之前的**Procrstes相关系数**结果就已经指示出了。标签代表两种不同的处理(L和M)和7种不同的时间(0、1、2、4、6、9和12h)。
 
-![](../images/4930_12.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4930_12.png)
 
 图八
 
-![](../images/4930_13.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4930_13.png)
 
 图九
 
@@ -115,13 +115,13 @@ scraped: "2026-08-10T07:43:51.837Z"
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2021/11/10-4-908x1024.png)
 
-![](../images/4930_15.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4930_15.png)
 
 图十
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2021/11/11-1-913x1024.png)
 
-![](../images/4930_17.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4930_17.png)
 
 图十一
 

docs/菌群知识库/categories/技术/4963_人类微生物组研究报告——规范流程.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["832", "834", "835", "836", "833"]
 date: "2026-11-26"
-images: ["../images/4963_1.png", "../images/4963_2.png", "../images/4963_3.png"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4963_1.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4963_2.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4963_3.png"]
 scraped: "2026-08-10T07:43:41.978Z"
 ---
 
@@ -17,7 +17,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:43:41.978Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/4963_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4963_2.png)
 
 **人类微生物组的变化与许多疾病和健康状况有关**。然而，**看懂**人类微生物组研究结果的**报告具有挑战性**，因为它通常**涉及微生物学、基因组学、生物医学、生物信息学、统计学、流行病学**等领域的方法。
 
@@ -43,7 +43,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:43:41.978Z"
 
 **建议使用流程图**来显示参与者被排除在研究之外的时间和原因。例如如下流程说明。
 
-![](../images/4963_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4963_3.png)
 
 Mirzayi C,* et al., Nat Med.* 2021
 

docs/菌群知识库/categories/技术/4969_新方法工具 _ 标准化注释细菌基因组.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["bakta", "cds", "sqlite", "840", "843", "838", "837"]
 date: "2026-11-29"
-images: ["../images/4969_1.png", "../images/4969_2.png", "../images/4969_3.png", "../images/4969_4.png", "../images/4969_5.png", "../images/4969_7.png", "../images/4969_9.png", "../images/4969_11.png", "../images/4969_13.jpg"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4969_1.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4969_2.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4969_3.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4969_4.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4969_5.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4969_7.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4969_9.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4969_11.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4969_13.jpg"]
 scraped: "2026-08-10T07:43:39.920Z"
 ---
 
@@ -17,7 +17,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:43:39.920Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/4969_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4969_2.png)
 
 在细菌全基因组测序数据分析中，**区域**(regional)和**功能注释**已经成为常规操作。一个**完整的基因组注释**是下游分析的基础，而注释的**准确性和全面性**往往影响研究结果。
 
@@ -25,7 +25,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:43:39.920Z"
 
 最近来自德国一个生物信息学团队们开发了**Bakta**，一款新的命令行工具，**用于自动化和标准化的细菌基因组注释**。该文章最近在《MICROBIAL GENOMICS》公开发表。
 
-![](../images/4969_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4969_3.png)
 
 作者认为现有的各种注释软件工具都在以下问题留下了改进的空间：
 
@@ -45,7 +45,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:43:39.920Z"
 
 软件工作流程如下图。
 
-![](../images/4969_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4969_4.png)
 
 输入文件为fasta格式的基因组组装序列。
 
@@ -63,13 +63,13 @@ HMMER和AntiFam分别过滤假阳性序列和重复的sORF。为了加快对CDS
 
 首先是**注释**得到的特征结果之间的比较。作者选择*E. coli *O26 : H11 strain 11368菌株的基因组，分别使用Prokka、DFAST、PGAP与Bakta比较，如下表。对于CDS，PGAP和Bakta预测到更多的基因。在CDS序列的**功能注释**方面，**PGAP和Bakta表现最好**，且Bakta是**唯一**一个分配到GO术语的工具。
 
-![](../images/4969_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4969_5.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2021/11/3-6.png)
 
 其次是**功能注释的性能基准测试**。选择来自RefSeq的35个不同分类的细菌基因组进行注释。统计其假设蛋白占总CDS的比例，如小提琴图。
 
-![](../images/4969_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4969_7.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2021/11/4-5-1024x806.png)
 
@@ -77,7 +77,7 @@ HMMER和AntiFam分别过滤假阳性序列和重复的sORF。为了加快对CDS
 
 由此得出，AFSI对RefSeq中检测到的小蛋白的功能注释贡献很**小**。表格中展示了Bakta检测到的小蛋白参与的一系列**与致病性高度相关**的重要过程，以及更一般的细胞内务管理过程。
 
-![](../images/4969_9.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4969_9.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2021/11/5-5-1024x698.png)
 
@@ -85,11 +85,11 @@ HMMER和AntiFam分别过滤假阳性序列和重复的sORF。为了加快对CDS
 
 结果如下图和表格。Bakta虽然运行时间时**最慢**的，但它所包含的**数据库内容是最多**的，其**分析深度**也有**很大提高**。对比没有使用AFSI的Bakta，在同等条件下，**使用AFSI大大提高了序列注释的速度**。
 
-![](../images/4969_11.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4969_11.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2021/11/6-5-1024x801.png)
 
-![](../images/4969_13.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4969_13.jpg)
 
 # 其它优势
 

docs/菌群知识库/categories/技术/5028_RESCRIPt：序列分类参考数据库管理工具.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["get-silva-data", "python3", "qiime-2", "rescript", "852", "853"]
 date: "2026-12-01"
-images: ["../images/5028_1.png", "../images/5028_2.png", "../images/5028_3.png", "../images/5028_4.png", "../images/5028_5.png", "../images/5028_6.png", "../images/5028_7.png", "../images/5028_8.png", "../images/5028_9.png", "../images/5028_10.png", "../images/5028_11.png", "../images/5028_12.png", "../images/5028_13.png", "../images/5028_14.png", "../images/5028_15.png"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_1.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_2.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_3.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_4.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_5.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_6.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_7.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_8.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_9.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_10.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_11.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_12.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_13.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_14.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_15.png"]
 scraped: "2026-08-10T07:43:19.213Z"
 ---
 
@@ -17,7 +17,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:43:19.213Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/5028_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_2.png)
 
 分类分析的研究，依赖于高质量的序列分类参考数据库，然而，目前已有记录公共序列数据库中出现错误，这些错误可能导致下游结果出错。**不同的参考数据库**对生物数据的分类结果**差别很大**，但**缺乏客观评价**单个数据库质量的**标准**。
 
@@ -25,7 +25,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:43:19.213Z"
 
 **为了满足可重复的生物信息学工作流程，以简化数据库生成和管理**，来自阿肯色大学的Michael等人开发了一款新的工具——**RESCRIPt**. 该文章最近发表在《PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY》上。
 
-![](../images/5028_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_3.png)
 
 RESCRIPt是一个独立的python3软件包，也是QIIME 2插件。**用于参考序列分类数据库的****可重复构建和管理**，主要功能是格式化主流的公共数据库内序列**用以自建分类数据库**，由于处理步骤是透明化的，所以用户可以为不同的研究应用创建参考材料。
 
@@ -37,7 +37,7 @@ RESCRIPt是一个独立的python3软件包，也是QIIME 2插件。**用于参
 
 **RESCRIPt处理和管理参考数据库的工作流程**
 
-![](../images/5028_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_4.png)
 
 实线箭头表示建议的流程。虚线的箭头和边框表示自定义工作流程时的可选步骤。
 
@@ -67,7 +67,7 @@ RESCRIPt可以**有效和透明的构建**任何存在源数据的扩增子的**
 
 **各数据库的序列信息**
 
-![](../images/5028_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_5.png)
 
 图A. 序列长度分布(去除异常值后）；
 
@@ -77,7 +77,7 @@ RESCRIPt可以**有效和透明的构建**任何存在源数据的扩增子的**
 
 **各数据库的分类信息和模拟分类的准确率比较**
 
-![](../images/5028_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_6.png)
 
 图A.唯一分类标签的数量。 图B.分类熵。
 
@@ -87,7 +87,7 @@ RESCRIPt可以**有效和透明的构建**任何存在源数据的扩增子的**
 
 **各数据库的分类覆盖率比较**
 
-![](../images/5028_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_7.png)
 
 每张子图表示该数据库与其他数据库在每个分类水平上共享的分类群比例。图例指出了要相互比较的数据库。
 
@@ -97,7 +97,7 @@ RESCRIPt使用**get-silva-data命令**获取SILVA序列和分类文件。“get-
 
 **对16S rRNA基因SILVA数据库中每个连续序列使用****不同RESCRIPt的质量过滤步骤后的序列信息比较**
 
-![](../images/5028_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_8.png)
 
 图A.序列长度分布。图B.唯一序列的数量。
 
@@ -115,7 +115,7 @@ RESCRIPt使用**get-silva-data命令**获取SILVA序列和分类文件。“get-
 
 **各过滤步骤下序列分类信息和模拟分类准确率的比较**
 
-![](../images/5028_9.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_9.png)
 
 图A. 唯一分类标签的数量。图B.分类熵。
 
@@ -131,7 +131,7 @@ RESCRIPt使用**get-silva-data命令**获取SILVA序列和分类文件。“get-
 
 这表明，即使选择了认为合适的相似度阈值也可能对数据库的信息内容和分类准确率产生负面影响。但作者还是**建议不要**在任何标记基因序列数据库中使用**相似度<99%的OTU聚类**。
 
-![](../images/5028_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_10.png)
 
 图A. 唯一分类标签的数量。 图B.分类熵。
 
@@ -151,7 +151,7 @@ RESCRIPt使用**get-silva-data命令**获取SILVA序列和分类文件。“get-
 
 **对UNIT ITS数据库的三种类型UNIT_97，UNIT_99，UNIT_dynamic数据库分别进行划分**
 
-![](../images/5028_11.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_11.png)
 
 Euks表示含所有真核生物序列，Fungi表示只含真菌序列，Fungi Order表示只含目水平或更低级别分类水平的真菌序列。
 
@@ -169,11 +169,11 @@ Euks表示含所有真核生物序列，Fungi表示只含真菌序列，Fungi Or
 
 结果表示聚类序列**大大减少**了未修剪和引物修剪的BOLD COI数据集中**唯一序列****的数量**，经引物修剪也会降低唯一序列的数量。且**在种水平**上表现**最明显**。聚类和引物修剪也**降低**了分类**准确性**。数据表明OTU聚类**不利于**COI基因分类。
 
-![](../images/5028_12.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_12.png)
 
 图例中Full表示未修剪的全长序列，ANML表示经引物修剪后的序列，后边接的数字表示相似性聚类阈值。Arthropod指节肢动物，chordate指脊索动物。图A.唯一分类标签的数量。图B.不同kmer长度的分类熵。横轴表示不同数据库。
 
-![](../images/5028_13.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_13.png)
 
 图A.唯一分类标签的数量。图B.分类熵。
 
@@ -187,11 +187,11 @@ Euks表示含所有真核生物序列，Fungi表示只含真菌序列，Fungi Or
 
 数据表明，**整体**看NCBI的**唯一序列**较**少**，但局部看，NCBI在**属水平**和**种水平**上有**更多唯一序列**。从分类**准确率**看，**NCBI**相对于BOLD，从科到种水平都有**提高**。
 
-![](../images/5028_14.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_14.png)
 
 数据集分别为boldANML（BOLD COL基因数据库）、ncbiAll（ncbiNB与ncbiOB的集合）、ncbiNB（不含BOLD COL基因序列的NCBI GenBank COL基因数据库）、ncbiOB（含BOLD COL基因序列的NCBI GenBank COL基因数据库）。图A.唯一分类标签的数量。图B.不同kmer长度的分类熵。横轴表示不同数据库。
 
-![](../images/5028_15.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5028_15.png)
 
 图A. 唯一分类标签的数量。 图B. 分类熵。
 

docs/菌群知识库/categories/技术/5240_GT-Pro——快速准确地对人体肠道微生物组进行宏基因组分型.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["gt-pro", "snp", "215"]
 date: "2026-01-17"
-images: ["../images/5240_1.png", "../images/5240_2.png", "../images/5240_3.jpg", "../images/5240_4.jpg", "../images/5240_5.jpg", "../images/5240_6.jpg", "../images/5240_7.jpg", "../images/5240_8.jpg", "../images/5240_9.jpg", "../images/5240_10.jpg", "../images/5240_11.jpg", "../images/5240_12.jpg"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5240_1.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5240_2.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5240_3.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5240_4.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5240_5.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5240_6.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5240_7.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5240_8.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5240_9.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5240_10.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5240_11.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5240_12.jpg"]
 scraped: "2026-08-10T07:42:14.014Z"
 ---
 
@@ -17,7 +17,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:42:14.014Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/5240_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5240_2.png)
 
 微生物物种的**遗传变异**研究通常包括单核苷酸多态性(**SNPs**)、结构变异（structural variants ，**SV**）和可移动遗传元件（mobile genetic elements，**MGEs**）。
 
@@ -27,11 +27,11 @@ scraped: "2026-08-10T07:42:14.014Z"
 
 该方法与使用读长对齐的方法**相比**，GT-Pro **更准确，速度快**两个数量级，作者构建了一个GT-Pro数据库，基于大约25,000个宏基因组样本，并展示了GT-Pro如何用于数千种菌群的菌株水平探索，可以**实现在个人电脑上快速高效地对数百万个SNP进行宏基因组分型。**
 
-![](../images/5240_3.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5240_3.jpg)
 
 # GT-Pro宏基因组SNP分型的计算框架
 
-![](../images/5240_4.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5240_4.jpg)
 
 如图，按箭头方向所示。
 
@@ -57,7 +57,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:42:14.014Z"
 
 **1.从模拟宏基因组中准确识别SNP**
 
-![](../images/5240_5.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5240_5.jpg)
 
 **比较GT-Pro、MIDAS和metaSNV**宏基因分型的准确性，使用232个未用于开发这些方法的人类肠道分离株的模拟宏基因组(大约2600万次reads)。
 
@@ -81,7 +81,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:42:14.014Z"
 
 **2.从模拟宏基因组中准确识别SNP**
 
-![](../images/5240_6.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5240_6.jpg)
 
 使用GT-Pro对**肠道微生物组样本进行宏基因组分型**，结果与基于比对的MIDAS宏基因组分型比较。
 
@@ -97,7 +97,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:42:14.014Z"
 
 **1.使用GT-Pro的SNP估算结构变异**
 
-![](../images/5240_7.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5240_7.jpg)
 
 **研究人员试图使用GT-Pro的SNP推断附近基因或操纵子的存在，从而作为结构变异的生物标志物。**
 
@@ -113,9 +113,9 @@ scraped: "2026-08-10T07:42:14.014Z"
 
 **2. 使用 GT-Pro 捕获新的种内遗传结构**
 
-![](../images/5240_8.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5240_8.jpg)
 
-![](../images/5240_9.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5240_9.jpg)
 
 **GT-Pro 可以对从参考基因组中鉴定的已知 SNP 进行宏基因组分型分析**。但研究人员认为GT-Pro还有**更广阔的发展**，假设GT-Pro可以基于 SNP 等位基因的不同组合检测新的菌株变异。
 
@@ -127,9 +127,9 @@ scraped: "2026-08-10T07:42:14.014Z"
 
 **3. GT-Pro 探索全球人类肠道微生物组遗传变异**
 
-![](../images/5240_10.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5240_10.jpg)
 
-![](../images/5240_11.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5240_11.jpg)
 
 来自六大洲 31 个地点的 7,459 个肠道样本中发现的 881 个物种的 5180 万个 SNP的多个物种的种内**遗传变异荟萃分析**。
 
@@ -147,7 +147,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:42:14.014Z"
 
 # GT-Pro的计算性能评估
 
-![](../images/5240_12.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5240_12.jpg)
 
 图a评估GT-Pro在笔记本电脑（左）和服务器环境（右）中的计算性能，以bits为单位。颜色表示处理速度，圆圈大小为RAM使用峰值。黑色方框表示最优状况。
 

docs/菌群知识库/categories/技术/5466_宏基因组组装质量评估新方法-MAGISTA.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["magista", "215", "986", "130", "988"]
 date: "2026-03-22"
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+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5466_1.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5466_2.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5466_3.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5466_4.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5466_5.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5466_6.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5466_7.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5466_8.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5466_9.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5466_10.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5466_11.png"]
 scraped: "2026-08-10T07:40:56.395Z"
 ---
 
@@ -17,7 +17,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:40:56.395Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/5466_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5466_2.png)
 
 尽管地球上微生物类群的繁多，但**只有一小部分**得到了**培养和有效命名**。因为大多数菌无法在非常特定的条件下**培养分离鉴定**。
 
@@ -29,7 +29,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:40:56.395Z"
 
 MAGISTA是基于宏基因组**bins内**的**contig片段**之间的无对齐距离分布，而不是一组参考基因。该方法利用了来自整个 bin 的信息。为了正确评估此方法，并说明基于参考的工具的缺点，最近，比利时研究人员构建了一个高度复杂的** DNA 模拟群落**，由 227 个细菌菌株组成，并且具有不同程度的相似性。
 
-![](../images/5466_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5466_3.png)
 
 **方 法**
 
@@ -37,7 +37,7 @@ MAGISTA是基于宏基因组**bins内**的**contig片段**之间的无对齐距
 
 **Complexity列指示菌株数**；Assembly tool列表示所使用的用于组装的软件；Binning method列表示所使用的用于分箱的工具；Binning parameters列表示所使用的用于**评估分箱质量**的指标，comp为**完整度**，cov为**覆盖率**。
 
-![](../images/5466_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5466_4.png)
 
 MAGISTA计算步骤：
 
@@ -55,7 +55,7 @@ MAGISTA计算步骤：
 
 对于每组五个基因组，混合所有片段并根据它们的特征进行主成分分析（PCA），然后进行**二次判别**分析，用于生成分类器，旨在区分每组中重叠最多的两个基因组。对该分类器的**准确度取平均值**，结果用于选择方法和片段长度的最终组合。
 
-![](../images/5466_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5466_5.png)
 
 -●-
 
@@ -79,7 +79,7 @@ MAGISTA计算步骤：
 
 由来自 227 个细菌菌株的基因组 DNA 组成，这些菌株属于8 个门(*Actinobacteria*, *Bacteroidetes*,*Deinococcus-Thermus*,* Firmicutes*,*Fusobacteria*,*Planctomycetes*,* Proteobacteria*和*Verrucomicrobia*)，18 类，47目，85科，175属，197种。
 
-![](../images/5466_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5466_6.png)
 
 编辑
 
@@ -87,7 +87,7 @@ MAGISTA计算步骤：
 
 上图为模拟群落中的细菌菌株的基因组大小和GC含量（从26.3%到73.4%）散点图；
 
-![](../images/5466_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5466_7.png)
 
 编辑
 
@@ -97,23 +97,23 @@ MAGISTA计算步骤：
 
 CheckM中基于单拷贝标记基因(SCMG)来评估 bin 质量的存在的缺陷
 
-![](../images/5466_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5466_8.png)
 
 图a和b分别为从CheckM中输出的完整性指标和污染度。使用R^2y∼x（解释方差的百分比），RMSE（相对于实际值的均方根误差）两个参数评估结果。结果表示CheckM高估了bin的质量。许多受污染的bins被预测为接近未受污染。
 
 使用MAGISTA分析模拟群落中的bins
 
-![](../images/5466_9.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5466_9.png)
 
 首先选择最佳片段大小用于计算距离分布，如上图所示，考虑了 1、5、10、20、30、40、50、75 和 100 kb 的片段，最终选择了粗体所示的片段大小。
 
-![](../images/5466_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5466_10.png)
 
 图为concont、MetaBAT和MaxBin产生的bins的完整性和污染度信息。
 
 由于通过模拟生成这样的数据集并不能准确地表示真实的结果，所以使用了**binning软件**的结果，提供了一组**不同质量的真实的bins**。训练数据集的完整性和未污染度均在90%以上。
 
-![](../images/5466_11.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5466_11.png)
 
 ​
 

docs/菌群知识库/categories/技术/5841_介绍一款_用于多组学整合和网络可视化分析的在线平台.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["metscape", "omicsnet", "263", "1083"]
 date: "2026-06-10"
-images: ["../images/5841_1.png", "../images/5841_2.png", "../images/5841_3.png", "../images/5841_5.jpeg", "../images/5841_6.png"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5841_1.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5841_2.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5841_3.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5841_5.jpeg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5841_6.png"]
 scraped: "2026-08-10T07:39:07.322Z"
 ---
 
@@ -17,7 +17,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:39:07.322Z"
 
 谷禾健康
 
-![](../images/5841_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5841_2.png)
 
 为了使研究更系统更全面，越来越多的研究人员追求在**多组学背景**下解释分子数据。
 
@@ -39,7 +39,7 @@ OmicsNet 2.0在原有基础上进行了升级，主要改进了三个方面：
 
 **OmicsNet 2.0工作流程**
 
-![](../images/5841_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5841_3.png)
 
 ![](https://img1p.dxycdn.com/2022/0610/190/4003591952299273553-115.png%21q70?Expires=1654834760&OSSAccessKeyId=LTAI5tDtkySWTaqxo1HUAPte&Signature=TBkbV3px%2B8RNg9VSjwFaLYoY%2FBY%3D)
 
@@ -82,7 +82,7 @@ OmicsNet 2.0在原有基础上进行了升级，主要改进了三个方面：
 
 **使用OmicsNet 2.0进行的IBD多组学研究**
 
-![](../images/5841_5.jpeg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5841_5.jpeg)
 
 图A为2D视图，图B为3D视图
 
@@ -110,7 +110,7 @@ OmicsNet 2.0在原有基础上进行了升级，主要改进了三个方面：
 
 如下表，**比较**OmicsNet 2.0与其他基于web的多组学集成工具的**关键特性**。
 
-![](../images/5841_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5841_6.png)
 
 ‘√’表示支持，‘-’ 表示缺失，“+”表示定量评估(“+”越多表示更好的支持)
 

docs/菌群知识库/categories/技术/6065_一套用于建立和管理微生物相互作用数据库的体系.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["fair", "globi", "1163", "853"]
 date: "2026-09-07"
-images: ["../images/6065_1.png", "../images/6065_2.png", "../images/6065_3.png", "../images/6065_4.png", "../images/6065_5.png", "../images/6065_6.png", "../images/6065_7.png", "../images/6065_8.png", "../images/6065_9.png", "../images/6065_10.png", "../images/6065_11.png", "../images/6065_12.png"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6065_1.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6065_2.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6065_3.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6065_4.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6065_5.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6065_6.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6065_7.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6065_8.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6065_9.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6065_10.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6065_11.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6065_12.png"]
 scraped: "2026-08-10T07:37:52.436Z"
 ---
 
@@ -17,7 +17,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:37:52.436Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/6065_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6065_2.png)
 
 在过去的几十年里，生物技术和计算技术的巨大进步彻底改变了我们对微生物群落的理解。特别是，基于**16S rRNA**和**宏基因组测序**的研究进一步验证了一个事实，即微生物群不是静态的实体，而是**动态的生态系统**，身在其中的组成成员之间，以及成员与环境之间，都在以各种方式进行**相互作用**。
 
@@ -33,7 +33,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:37:52.436Z"
 
 关于数据获取，文中列出了一些资源，都是目前广泛使用或者比较独特的，如下表：
 
-![](../images/6065_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6065_3.png)
 
 # FAIR体系之interoperable和reusable
 
@@ -48,41 +48,41 @@ scraped: "2026-08-10T07:37:52.436Z"
 
 应提供参与相互作用的每种微生物的**物种**（和菌株，如果相关）**名称**。
 
-![](../images/6065_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6065_4.png)
 
 示例：
 
-![](../images/6065_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6065_5.png)
 
 2. 相互作用的推理方法
 
 使用不同的方法来指示**高度**相关的元数据。
 
-![](../images/6065_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6065_6.png)
 
 示例：
 
-![](../images/6065_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6065_7.png)
 
 3. 相互作用的上下文语境
 
 一些环境背景，如生物群落（例如，宿主相关的、合成的）。
 
-![](../images/6065_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6065_8.png)
 
 示例：
 
-![](../images/6065_9.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6065_9.png)
 
 4. 属性，用于定义互作关系的类型
 
 如合作、对抗、关联、成对或高阶等。
 
-![](../images/6065_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6065_10.png)
 
 示例：
 
-![](../images/6065_11.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6065_11.png)
 
 # 利用FAIR体系进行研究的思路
 
@@ -90,7 +90,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:37:52.436Z"
 
 如下图，通过研究微生物相互作用和相关性(A部分)而产生的**多种类型的元数据**(B部分)，这些元数据(DT)，例如真菌细菌或噬菌体细菌的培养实验数据(DT1)，扩增子序列或OTU计数的相关性(DT2)，两个或两个以上物种基因组尺度代谢网络的**通量平衡模型**(DT3)，直接比对到特定数据库(DT4)。
 
-![](../images/6065_12.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6065_12.png)
 
 遵循FAIR里的**四个原则**来**解析微生物互作**内容(C部分)，解析结果如**D部分**，得到一个可能的相互作用网络关系图谱。
 

docs/菌群知识库/categories/技术/6123_自学 R 语言的十条干货技巧分享.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["r"]
 date: "2026-09-14"
-images: ["../images/6123_1.png", "../images/6123_2.png", "../images/6123_3.png", "../images/6123_5.png", "../images/6123_7.png", "../images/6123_9.png", "../images/6123_11.png", "../images/6123_13.png", "../images/6123_15.png", "../images/6123_16.png", "../images/6123_17.png", "../images/6123_18.png", "../images/6123_19.png", "../images/6123_20.png", "../images/6123_21.png"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_1.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_2.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_3.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_5.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_7.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_9.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_11.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_13.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_15.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_16.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_17.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_18.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_19.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_20.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_21.png"]
 scraped: "2026-08-10T07:37:35.974Z"
 ---
 
@@ -17,13 +17,13 @@ scraped: "2026-08-10T07:37:35.974Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/6123_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_2.png)
 
 统计和科学编程已迅速成为科学中的一项必要技能，而这一般都需要用到——**R语言**。
 
 R语言以其**简单易学、免费开源**的特性，正在各个领域发挥着越来越重要的作用。
 
-![](../images/6123_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_3.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2022/09/1-6-1024x304.png)
 
@@ -37,7 +37,7 @@ R语言以其**简单易学、免费开源**的特性，正在各个领域发挥
 - ……
 - 最重要的是它免费！
 
-![](../images/6123_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_5.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2022/09/2-6-1024x182.png)
 
@@ -53,7 +53,7 @@ R语言以其**简单易学、免费开源**的特性，正在各个领域发挥
 
 可以这样说，学习 R 语言很困难，因为它涉及经常报错，所以这个学习的过程要做好准备，**识别这些错误**，并最终**学习如何修复**。
 
-![](../images/6123_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_7.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2022/09/3-5-1024x193.png)
 
@@ -157,7 +157,7 @@ RStudio 网站
 
 尝试使用**ggplot**形状和美学来复制你最喜爱的艺术作品（参见Twitter上的#RecreationThurday）。
 
-![](../images/6123_9.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_9.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2022/09/4-6.png)
 
@@ -193,7 +193,7 @@ RStudio 网站
 
 在这两种情况下，**对代码进行注释是很重要的**，确保将来能够理解当前的想法。
 
-![](../images/6123_11.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_11.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2022/09/5-4-1024x236.png)
 
@@ -205,7 +205,7 @@ RStudio 网站
 
 **3 种代码样式的示例**
 
-![](../images/6123_13.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_13.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2022/09/6-3-1024x182.png)
 
@@ -217,7 +217,7 @@ RStudio 网站
 
 在大多数情况下，只要适合你的，什么样式都可以。
 
-![](../images/6123_15.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_15.png)
 
 当然，匹配协作者中**最常见的代码风格**或规程中的**标准，**对阅读、共享和排除代码故障很有帮助。
 
@@ -237,7 +237,7 @@ R的大多数功能都**捆绑在****特定于任务的包**中，但**很难知
 
 在R中，用户开发包的主要存储库是**CRAN**，即the Comprehensive R Archive Network，综合R存档网络。
 
-![](../images/6123_16.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_16.png)
 
 虽然软件包也可以来自其他来源，但CRAN软件包具有通过R’s install.packages功能**轻松访问**，确保软件包已在**多个平台上测试**的优势。
 
@@ -251,7 +251,7 @@ R的大多数功能都**捆绑在****特定于任务的包**中，但**很难知
 
 自学R时，你可能会遇到自己还**不知道如何解决的问题**。
 
-![](../images/6123_17.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_17.png)
 
 在这些情况下，**寻求帮助**可能会为你**节省大量时间，**缓解头痛。
 
@@ -297,7 +297,7 @@ R通常在Twitter上与#RStats标签讨论如下图。
 
 **一些常见科学编程语言的Twitter讨论流行度**
 
-![](../images/6123_18.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_18.png)
 
 社区的一个很好的切入点可能是以下帐户：
 
@@ -311,7 +311,7 @@ R通常在Twitter上与#RStats标签讨论如下图。
 
 最重要的是，**保持积极性**，继续编写代码。
 
-![](../images/6123_19.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_19.png)
 
 # 09阅读别人的代码，分享你的代码
 
@@ -353,7 +353,7 @@ R是一个非常棒的工具，可以用于**统计、数据操作、可视化**
 
 当你继续将编程技能应用于更广泛的任务时，你可能会发现对于某些任务，**不同的工具**会更**有效**或更合适。
 
-![](../images/6123_20.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_20.png)
 
 在这些情况下，你在学习R时**建立的信心和技能**可能是下一次编程努力的**有用跳板**。
 
@@ -363,7 +363,7 @@ R是一个非常棒的工具，可以用于**统计、数据操作、可视化**
 
 学习R语言，可能是一个充满挫折、自我怀疑和缺乏继续动力的过程。在这里列出的10条是帮助你克服挑战、掌握新技术的最佳策略，甚至可能在这一过程中获得一些乐趣。
 
-![](../images/6123_21.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6123_21.png)
 
 也希望可以帮助初学者，无论是研究生、业余爱好者还是渴望学习新工具的研究人员。
 

docs/菌群知识库/categories/技术/624_分享_破解菌群检测应用于多疾病临床辅助诊断应用的难题.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["89"]
 date: "2026-08-12"
-images: ["../images/624_1.png", "../images/624_2.webp", "../images/624_3.jpg", "../images/624_4.jpg", "../images/624_5.jpg", "../images/624_6.jpg", "../images/624_7.jpg", "../images/624_8.jpg", "../images/624_9.jpg", "../images/624_10.jpg", "../images/624_11.jpg", "../images/624_12.jpg", "../images/624_13.jpg", "../images/624_14.jpg", "../images/624_15.jpg", "../images/624_16.jpg", "../images/624_17.jpg", "../images/624_18.jpg", "../images/624_19.jpg", "../images/624_20.jpg"]
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 scraped: "2026-08-10T08:01:42.669Z"
 ---
 
@@ -35,11 +35,11 @@ scraped: "2026-08-10T08:01:42.669Z"
 
 以下是分享原文。 
 
-![](../images/624_2.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/624_2.webp)
 
  非常高兴有机会在这里跟大家分享我们这几年在肠道菌群检测应用于临床和健康管理方面的尝试,以及我们的一些经验｡ 
 
-![](../images/624_3.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/624_3.jpg)
 
 谷禾成立于 2012年，是最早从事肠道菌群健康事业的公司，技术骨干源自浙大。建立了完整的pcr分子实验室｡
 
@@ -47,7 +47,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:01:42.669Z"
 
 而且这些临床样本相对来说,对于我们后续将肠道菌群检测应用于临床辅助诊断当中有很大的帮助。
 
-![](../images/624_4.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/624_4.jpg)
 
 我们其实不只是检测一下肠道菌群的构成,以及哪些菌有异常,我们是希望将肠道菌群检测直接做成一个临床辅助诊断的产品｡
 
@@ -91,7 +91,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:01:42.669Z"
 
 也就是说成本必须要得到控制,几千块钱的项目可能能做,但是它无法做到普及,也无法在临床当中被大量的应用,所以如何控制成本也是个巨大的一个问题｡
 
-![](../images/624_5.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/624_5.jpg)
 
  
 
@@ -107,7 +107,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:01:42.669Z"
 
 **还有重要的一点是如何使用人工智能的高可用性的模型**,从这么大的数据当中精细化的提高检出率的同时,又能够保证它的特异性和敏感度,这是个巨大的一个挑战,这个我后面也会讲到｡
 
-![](../images/624_6.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/624_6.jpg)
 
 第一个方面,可能我们现在采用的这个取样方式,应该相对来说最简便和最小的一个取样方式,我们直接可以用棉签从厕纸上蘸取,直接洗脱在取样管当中｡
 
@@ -117,7 +117,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:01:42.669Z"
 
 有了这个取样管之后,实际上从临床和门诊当中可以快速的拿到大量的方便的样品,因为不需要采用非常复杂的取样和储存的方案｡
 
-![](../images/624_7.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/624_7.jpg)
 
  我们讲第二个方面,刚才提到菌群的构成特点是很多样性的，而且跟很多因素包括取样时间有关,比如说早上取、晚上取,取的粪便的部位以及取样的量的多少,可能出来的菌群构成都会有一些区别｡ 
 
@@ -143,7 +143,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:01:42.669Z"
 
 那我们尝试的更多的是从第二个维度开始,就菌群的构成,菌群的结构以及高维的菌群特征这个角度,因为它的稳定性更好｡我们通过不断的去加入各种各样的临床病例的数据的方式来提取这些菌群的附加信息｡
 
-![](../images/624_8.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/624_8.jpg)
 
 这就涉及到第二个问题,我们要把这更多维度的信息量能够提出来的话,你就必须要有涉及到非常大规模的样本人群，包括疾病状态、年龄、社会生活区域、饮食方式等各种因素的情况｡
 
@@ -153,7 +153,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:01:42.669Z"
 
 我们自己改进之后的方法，稳定性和可靠性也是相当高的,这样是极大地降低了我们的整个实验处理过程当中的成本,同时又能够有效地**保证**这个检测结果的**可靠性**。我们的方法已经有文章发表｡
 
-![](../images/624_9.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/624_9.jpg)
 
 **那么当有了大量的样本之后,第二个问题就是**
 
@@ -167,7 +167,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:01:42.669Z"
 
 我们目前总的样本量已经接近快20万了,估计今年应该会超过20万例｡
 
-![](../images/624_10.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/624_10.jpg)
 
 ** 多种相关疾病互相存在干扰 **
 
@@ -191,7 +191,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:01:42.669Z"
 
 这也就是另外一个因素,就是我们在构建人群队列的时候,务必不能以一个相对干净的样本集去做｡对于研究来说,它可能是很好的一个方式,你可以做前瞻性来寻找这是否可能以及效果｡但是实际临床过程当中,你需要纳入大量的,可能影响你这个菌群,或者跟这个疾病有相互干扰和影响的相应的疾病来作为控制集,才能够提高它的可靠性和准确度｡
 
-![](../images/624_11.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/624_11.jpg)
 
 图解
 
@@ -201,7 +201,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:01:42.669Z"
 
 右边这里是一个疾病的构成,其中有很多病跟菌群的关系目前甚至都没有发表过论文,就是说并不知道肠道菌群跟它有关｡我们实际通过大规模的临床样本的实际筛查和模型构建之后,发现有很多病,通过肠道菌群可以做到非常精准｡
 
-![](../images/624_12.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/624_12.jpg)
 
 **另外一个问题就是，我们对于一个病的预测也好,或者进行辅助诊断也好,基于肠道菌群**
 
@@ -221,7 +221,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:01:42.669Z"
 
 如果想要得到稳定可靠的检测结果,而且因为不是所有的病，菌群都是在其中起到绝对性的作用,有些是属于间接的,那么你希望菌群本身的检测,它需要有一个贡献度的上限，也就是说,菌群本身与这个疾病的参与度和关联性的上限｡那么要达到这个上限,我们认为差不多要**3000例**的临床的阳性样本,就是病例患者的样本,可以达到上限的结果｡
 
-![](../images/624_13.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/624_13.jpg)
 
 再下来,就是我们需要构建可靠的模型。
 
@@ -251,7 +251,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:01:42.669Z"
 
 通过多个模型之后,我们可以极大地提高菌群检测的稳定性,以及这个疾病当中的特异性程度｡
 
-![](../images/624_14.jpg) 
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/624_14.jpg) 
 
 图解
 
@@ -267,23 +267,23 @@ scraped: "2026-08-10T08:01:42.669Z"
 
 但是你可以看到,它的解释并不是指这个菌群直接的特征变化。我们通过菌群解析,像艾滋病,我们有免疫组化的数据解读了之后,我可以明确告诉你,CD4和CD8的比值会有特征性的差异｡但它本身的菌群特征上并没有直接体现出这个东西,是**通过生理生化指标的转换**之后,我就可以告诉你,菌群特征的变化在具体哪些生理生化方面产生一些影响｡
 
-![](../images/624_15.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/624_15.jpg)
 
 这个是我们现在提供给包括临床和健康检测的一些基本的内容。
 
 可以提供菌群的**总体状况**,以及**致病菌**的情况,**益生菌**的情况｡因为本身测的就是菌群,所以它直接就能提供这些最基本的一些信息。当然正常范围都是我们基于将近上万人的健康人群来做的正常范围的评估｡
 
-![](../images/624_16.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/624_16.jpg)
 
 这个是除了来自文献之外,我们自己通过算法提取到的相关的菌，每一种菌在这个疾病内的**相关性**情况,以及它在正常人群的基本的**正常范围**是多少｡然后我们通过检测这个是否异常,在临床当中给医生来做快速判断的一个内容和信息｡
 
-![](../images/624_17.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/624_17.jpg)
 
 再有一个我们现在给一个疾病的辅助诊断,这些部分它可以相对有效的提供整个维度的不只是一个专科的信息，可以给到包括我们前面讲到**七个系统的相关疾病**的一个提示｡
 
 这些提示可以帮助我们来做一些专科性的疾病辅助诊断,能排除一些其他科室可能漏掉的一些疾病症状。另外包括消化道症状的解读,我们也会有一个菌群异常的评估提示｡
 
-![](../images/624_18.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/624_18.jpg)
 
 包括营养的部分,我们也单独加入******营养摄入水平,维生素摄入水平,氨基酸摄入水平**。
 
@@ -291,7 +291,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:01:42.669Z"
 
 那另外也包括**微量元素**,现在重金属的部分我们已经完成了,也很快会加入包括饮食特点、盐摄入、精制糖摄入对应的信息,还有短链脂肪酸的这些指标｡
 
-![](../images/624_19.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/624_19.jpg)
 
 另外这里还有包括有心脑血管、神经系统的疾病的风险评估,包括过敏的一些问题。
 
@@ -309,7 +309,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:01:42.669Z"
 
 所以我们通过整个菌群结构的特征变化,能够只检测细菌,也仍然能够发现病毒性的这种变化｡
 
-![](../images/624_20.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/624_20.jpg)
 
 最后我说一下挑战。
 

docs/菌群知识库/categories/技术/6465_TaxiBGC ——分类学指导下的生物合成基因簇鉴定流程.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["taxibgc", "1292", "-bgc"]
 date: "2026-12-05"
-images: ["../images/6465_1.png", "../images/6465_2.png", "../images/6465_3.png", "../images/6465_4.png", "../images/6465_5.png"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6465_1.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6465_2.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6465_3.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6465_4.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6465_5.png"]
 scraped: "2026-08-10T07:35:56.391Z"
 ---
 
@@ -29,7 +29,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:35:56.391Z"
 
 《TaxiBGC: a Taxonomy-Guided Approach for Profiling Experimentally Characterized Microbial Biosynthetic Gene Clusters and Secondary Metabolite Production Potential in Metagenomes》
 
-![](../images/6465_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6465_2.png)
 
 介绍了他们的研发成果，他们开发了生物合成基因簇（TaxiBGC）的**分类指导识别**，这是一种命令行工具，用于通过首先**精确定位**可能存在合成基因簇的微生物物种来**预测**宏基因组中实验特征化的合成基因簇（并推断其已知的次级代谢物）。
 
@@ -57,7 +57,7 @@ TaxiBGC计算流程主要有**三个步骤**，如下图。
 
 第三步使用BBMap基于序列比对来对初步预测的结果**进一步确认**。
 
-![](../images/6465_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6465_3.png)
 
 # TaxiBGC参考数据库内容
 
@@ -67,7 +67,7 @@ TaxiBGC参考数据库提供了实验表征的**生物合成基因簇**、相应
 
 BGC中的基因数量也有很大差异，953个BGCs中的大多数只有不到25个生物合成基因(图C)，但大多数BGCs只产生1种SM(图E)。
 
-![](../images/6465_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6465_4.png)
 
 # TaxiBGC预测BGCs的性能
 
@@ -78,7 +78,7 @@ BGC中的基因数量也有很大差异，953个BGCs中的大多数只有不到2
 
 为了确定这两个阈值，研究人员在125个模拟宏基因组上测试了400对BGC基因存在的阈值(以5%的增量，5%~100%区间)和BGC覆盖率(以5%的增量，5%~100%区间)。将预测的BGCs与实际BGCs进行比较，计算出F1分值。
 
-![](../images/6465_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6465_5.png)
 
 如图A，当BGC基因存在阈值为5%且BGC覆盖阈值为10%时，TaxiBGC在所有模拟宏基因组中预测BGC的**性能最佳**(mean F1 score=0.56)。
 

docs/菌群知识库/categories/技术/6483_用于CAZyme研究领域的数据库——dbCAN-seq数据库更新.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["cazymes", "cgcs", "dbcan-seq", "1304"]
 date: "2026-12-09"
-images: ["../images/6483_1.png", "../images/6483_2.png", "../images/6483_4.png", "../images/6483_5.png", "../images/6483_7.png", "../images/6483_8.png"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6483_1.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6483_2.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6483_4.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6483_5.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6483_7.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6483_8.png"]
 scraped: "2026-08-10T07:35:49.830Z"
 ---
 
@@ -39,7 +39,7 @@ CAZymes对**人类健康**、**营养**、**肠道微生物组**、生物能源
 
 最近在内布拉斯加大学的团队在Nucleic Acids Research发表的题为：“dbCAN-seq update: CAZyme gene clusters and substrates in microbiomes”的文章，更新了**dbCAN-seq数据库** ( https://bcb.unl.edu/dbCAN_seq）
 
-![](../images/6483_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6483_2.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2022/12/1-2-1024x605.png)
 
@@ -79,7 +79,7 @@ PUL指多糖利用位点，是一个更流行的术语，描述利用复杂碳
 
 人类肠道MAG中CGCs的CAZymes**比例最高**(55.87%)，而牛瘤胃中CGCs的CAZymes**比例最低**(45.45%)。
 
-![](../images/6483_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6483_4.png)
 
 ## 2预测CGCs的碳水化合物底物
 
@@ -93,13 +93,13 @@ PUL指多糖利用位点，是一个更流行的术语，描述利用复杂碳
 
 使用eCAMI工具对CAZyme亚家族进行注释(图D)，确定了CAZyme蛋白的eCAMI亚家族和EC数量后，根据eCAMI亚家族和EC编号建立的CAZyme亚家族→EC→底物的映射文件(表S2)，使用简单的多数投票规则来推断CGC中的底物分配。
 
-![](../images/6483_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6483_5.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2022/12/3-2-829x1024.png)
 
 通过以上两种方法，目前dbCAN-seq数据库中新增的预测底物的CGC计数如下图：
 
-![](../images/6483_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6483_7.png)
 
 图A为用dbCAN-PUL方法和eCAMI亚族方法注释CGCs的韦恩图。
 
@@ -111,7 +111,7 @@ PUL指多糖利用位点，是一个更流行的术语，描述利用复杂碳
 
 如下图，网站也新增了版块：
 
-![](../images/6483_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6483_8.png)
 
 图A可选五个数据集。
 

docs/菌群知识库/categories/技术/7051_微生物常见统计检验方法比较及选择.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["lefse", "otu-asv", "1531", "1533", "1528", "1532", "1530", "1536", "1534"]
 date: "2026-04-19"
-images: ["../images/7051_1.png", "../images/7051_2.png", "../images/7051_4.jpg", "../images/7051_6.png", "../images/7051_8.png", "../images/7051_10.png", "../images/7051_12.png", "../images/7051_14.png", "../images/7051_16.png", "../images/7051_18.png", "../images/7051_20.jpg", "../images/7051_22.jpg", "../images/7051_24.jpg", "../images/7051_26.png", "../images/7051_28.png", "../images/7051_30.png", "../images/7051_32.png", "../images/7051_33.png"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_1.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_2.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_4.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_6.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_8.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_10.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_12.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_14.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_16.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_18.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_20.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_22.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_24.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_26.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_28.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_30.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_32.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_33.png"]
 scraped: "2026-08-10T07:32:22.275Z"
 ---
 
@@ -47,7 +47,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:32:22.275Z"
 
 在统计学上，假设检验方法可分为两大类，**参数检验**和**非参数检验**。
 
-![](../images/7051_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_2.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2023/04/1-2-1024x590.png)
 
@@ -71,7 +71,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:32:22.275Z"
 
 **参数检验与非参数检验的一些区别**
 
-![](../images/7051_4.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_4.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2023/04/2-1.jpg)
 
@@ -203,7 +203,7 @@ Adonis又称置换多因素方差分析（permutationalMANOSVA）或非参数多
 
 **图表解释**
 
-![](../images/7051_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_6.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2023/04/3-2.png)
 
@@ -235,7 +235,7 @@ B）找出与丰度有显著性差异的物种后进一步使用Wilcoxon 秩和
 
 C）最后Lefse采用线性判别分析（LDA）估计**每个分组的差异特征对差异效果的影响大小**（即LDA score值）。
 
-![](../images/7051_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_8.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2023/04/4-1.png)
 
@@ -247,7 +247,7 @@ LDA值分布柱状图中展示了LDA Score**大于设定值**（默认设置为2
 
 展示了**不同组中丰度差异显著的物种**，柱状图的**颜色代表各自的组别**，柱状图的长度代表差异物种的**影响大小**（即为 LDA Score），即不同组间显著差异物种的影响程度。
 
-![](../images/7051_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_10.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2023/04/5-1.png)
 
@@ -259,7 +259,7 @@ LDA值分布柱状图中展示了LDA Score**大于设定值**（默认设置为2
 
 注：图中英文字母表示的物种名称在右侧图例中进行展示。（为了美观，右侧默认只显示门到科的差异物种）。
 
-![](../images/7051_12.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_12.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2023/04/6-1.png)
 
@@ -275,7 +275,7 @@ LDA值分布柱状图中展示了LDA Score**大于设定值**（默认设置为2
 
 第五列：P值，若不是Biomarker用“-”表示。
 
-![](../images/7051_14.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_14.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2023/04/7.png)
 
@@ -295,7 +295,7 @@ LDA值分布柱状图中展示了LDA Score**大于设定值**（默认设置为2
 
 随机森林可以对样本进行**分类和预测**。16S测序数据通过RandomForest随机森林可以找出与**分组有关的关键物种/功能**。
 
-![](../images/7051_16.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_16.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2023/04/8-1.png)
 
@@ -307,7 +307,7 @@ LDA值分布柱状图中展示了LDA Score**大于设定值**（默认设置为2
 
 根据随机森林方法筛选出的最佳模型，绘制ROC曲线，ROC是一种常用的统计学分析方法，在医学研究中主要用于**评价诊断试验的效能**，**用来评****判分类、检测结果的好坏**。
 
-![](../images/7051_18.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_18.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2023/04/9-1024x504.png)
 
@@ -333,7 +333,7 @@ AUC在0.5~0.7时有较低准确性，AUC在0.7~0.9时有一定准确性，AUC
 
 箱型图可以**直观的识别出异常数据**，判断数据的侧重方法，方便**多组间比较形态比较**。其他类似变形的还有柱状图，小提琴图等就不做详细赘述。
 
-![](../images/7051_20.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_20.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2023/04/10-2-1024x968.jpg)
 
@@ -341,7 +341,7 @@ AUC在0.5~0.7时有较低准确性，AUC在0.7~0.9时有一定准确性，AUC
 
 散点图（Scatter plot）是数据点在直角坐标系平面上的分布图，散点图表示**因变量随自变量而变化的大致趋势**，据此可以选择合适的函数对数据点进行拟合。比如PCA、PCoA、NMDS、回归分析、火山图等。
 
-![](../images/7051_22.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_22.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2023/04/11-1-1024x968.jpg)
 
@@ -367,7 +367,7 @@ Spearman相关系数是**排序相关性**（ranked values)的**非参数度量*
 
 使用单调函数描述两个变量之间的关系的程度。Spearman相关性可以评估**两个变量之间的单调关系**。
 
-![](../images/7051_24.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_24.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2023/04/12-1-1024x968.jpg)
 
@@ -437,7 +437,7 @@ Pearson 处理变量的数据原始值，而Spearman处理**数据排序值**（
 
 例如该图是**属水平**多组间非参数检验的差异结果：
 
-![](../images/7051_26.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_26.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2023/04/13.png)
 
@@ -455,13 +455,13 @@ Groups\diff_analysis\UnivarTestGenus\figure\single_plot
 
 图上方的P值0.006是多组间非参数检验的P值，图中展示的是任意两组间差异显著的结果，例如P=0.017是M组和CA组之间的结果。P=0.017是CA组和N组之间的P值。**如果任意两组间有差异，则在图中显示对应P值**。
 
-![](../images/7051_28.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_28.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2023/04/14.png)
 
 PCoa基于Bray距离的Adonis检验得到的P值=0.001右下角，也是**多组间统计检验的结果**。
 
-![](../images/7051_30.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_30.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2023/04/15.png)
 
@@ -471,7 +471,7 @@ Groups\betadiv\pcoa_bray_analysis\ PERMANOVA_paired_result.csv
 
 表中展示了任意两组间Adonis检验的**P值和R值**。
 
-![](../images/7051_32.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_32.png)
 
 编辑​
 
@@ -485,7 +485,7 @@ Groups\betadiv\pcoa_bray_analysis\ PERMANOVA_paired_result.csv
 
 热图是一种常用的展示方法，可以将微生物组数据转化为颜色矩阵，从而**直观地显示不同样本或物种之间的相似性和差异性**。可以使用热图来展示微生物组数据的OTU/ASV表、物种丰度表等。
 
-![](../images/7051_33.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7051_33.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2023/04/16.png)
 

docs/菌群知识库/categories/技术/7238_一种新的算法模型，填补微生物组纵向研究数据中的缺失值.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["deepmicrogen", "-gan", "1595", "1592", "1596", "1591"]
 date: "2026-05-23"
-images: ["../images/7238_1.png", "../images/7238_2.png", "../images/7238_4.png", "../images/7238_5.png", "../images/7238_6.png", "../images/7238_7.png", "../images/7238_10.jpg", "../images/7238_12.png", "../images/7238_13.png", "../images/7238_14.jpg", "../images/7238_15.jpg", "../images/7238_16.jpg", "../images/7238_17.png"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7238_1.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7238_2.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7238_4.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7238_5.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7238_6.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7238_7.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7238_10.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7238_12.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7238_13.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7238_14.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7238_15.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7238_16.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7238_17.png"]
 scraped: "2026-08-10T07:31:35.222Z"
 ---
 
@@ -17,7 +17,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:31:35.222Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/7238_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7238_2.png)
 
 **微生物组的纵向研究**是一种长期跟踪**微生物组变化**的研究方法。在这类研究中，样本从同一人群或个人中多次采集，通过检测样本中**微生物群落丰度****的变化**（如不同菌群的比例和种类），来了解微生物组**随时间的变化**趋势和特征。
 
@@ -51,19 +51,19 @@ scraped: "2026-08-10T07:31:35.222Z"
 
 先判断每个时间点上是否存在该物种，**0表示数据缺失**，**1表示数据存在**。
 
-![](../images/7238_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7238_4.png)
 
 然后计算出**时间差**δf，一个向量，用于表示前一个观测值与当前时间点之间的时间差。δb，与δf定义类似，但**计算方向相反**，这反映了下一个观测值的时间与当前时间点之间的差异。
 
 这些变量的计算有助于**更准确地捕捉时间序列数据中的时间相关性**。
 
-![](../images/7238_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7238_5.png)
 
 接着将x(观测值)、e、δf和δb变量值输入至DeepMicroGen模型的生成器中，使用CNN模块提取捕捉系统发育关系的特征。
 
 计算门水平的OTUs之间的Spearman相关性，得到**相关性系数矩阵**(一个p×p矩阵，其中p个OTUs在一个聚类中)，利用下面的公式将矩阵中的每一行简化为相关系数的几何平均值，其中ρOTUjp是OTUj和OTUp之间的Spearman相关性。
 
-![](../images/7238_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7238_6.png)
 
 然后OTUs按照几何平均值**从大到小进行排序**，进一步强化门水平OTU之间的关联。之后，将CNN模块分别应用于每个聚类并提取特征，该模块由两个1D-CNN层组成，卷积核大小为3，分别具有16和8个滤波器，每个滤波器后接一个Leaky ReLU激活函数和一个max-pooling层。
 
@@ -73,7 +73,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:31:35.222Z"
 
 RNN(循环神经网络)单元的定义如下：其中，Wh是**权重矩阵**，bh是bias，hi−1是前一个**时间点的隐藏状态**(hidden state)
 
-![](../images/7238_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7238_7.png)
 
 在biRNN 模块中的生成器应用中，前向（forward）和反向（backward）RNN单元都会产生一个生成的输出，分别用 x˜f和x˜b指示。
 
@@ -95,7 +95,7 @@ RNN(循环神经网络)单元的定义如下：其中，Wh是**权重矩阵**，
 
 lossG表示生成器的损失函数（Generator Loss），表示生成器在生成伪造数据过程中的**误差**；lossR表示真实数据损失函数（Real Data Loss），表示判别器对**真实数据分类的误差**；lossC表示伪造数据损失函数（Fake Data Loss），表示判别器对**伪造数据分类的误差**。
 
-![](../images/7238_10.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7238_10.jpg)
 
 最终，通过相互对抗和共同优化，判别器和生成器可以**同时得到优化**，并且生成器可以生成具有真实样本类似但又与数据集不完全相同的新数据。
 
@@ -127,17 +127,17 @@ DIABIMMUNE数据集内含从三个国家(芬兰、爱沙尼亚和俄罗斯)招
 
 DeepMicroGen模型在模拟数据集上的MAE为1.866，**优于其他方法**，其中MICE的表现次之，为1.942。其他方法的MAE分别为:三次曲线拟合(1.943)、线性曲线拟合(1.990)、Median(2.277)、Mean(2.298)、Moving window(2.452)、LOCF(2.698)。DeepMicroGen在真实数据集上也取得了最好的成绩，MAE分别为**1.609**和**0.486**。
 
-![](../images/7238_12.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7238_12.png)
 
 DeepMicroGen模型利用GAN与CNN结合提取OTU特征来推算微生物组数据。研究人员为了观察不同组件对imputation性能的影响，通过移除或改变模型中的组件设计了四种变体DeepMicroGen模型。然后分别使用DIABIMMUNE数据集进行10倍交叉验证，并计算MAE进行性能评估。
 
 如下图所示，与所有四种变体模型相比，DeepMicroGen表现出**最佳性能**。
 
-![](../images/7238_13.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7238_13.png)
 
 评估DeepMicroGen模型在不同数据缺失率下的表现。随机(MAR)或非随机(MNAR)删除10%到80%的数据，使用DeepMicroGen模型进行缺失值填补，实验重复5次，计算MAE。结果表示除MNAR缺失率为40%外，DeepMicroGen模型在大多数情况下的MAE仍然是最低的。
 
-![](../images/7238_14.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7238_14.jpg)
 
 评估DeepMicroGen模型生成的插补值是否能够与**原始数据保持相似性**。研究人员随机丢弃10%-80%的数据，并使用DeepMicroGen和其他方法进行填补。
 
@@ -151,11 +151,11 @@ MW和LOCF方法进行插补得到的数据，其alpha多样性与真实数据较
 
 而通过DeepMicroGen模型得到的插补值，其alpha多样性与真实数据相似，并且相关性最高。在比较beta多样性时，还可以看到DeepMicroGen模型生成的**插补值与真实数据之间有重叠**，而其他方法却几乎没有重叠。
 
-![](../images/7238_15.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7238_15.jpg)
 
 此外，研究人员还测试了是否能够识别真实数据中相对丰度值(RA)为0的，并准确预测。准备了两个数据集合，分别是{true zero RAs}和{predicting zero RAs}，分别表示真实数据集中RA=0的OTU集合和生成插补值数据集中RA=0的OTU集合。依次比较这两个集合之间的对称差，**预测准确率和MAE值**。
 
-![](../images/7238_16.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7238_16.jpg)
 
 **★ 能够有效保留原始数据特征，利于下游分析**
 
@@ -165,7 +165,7 @@ MW和LOCF方法进行插补得到的数据，其alpha多样性与真实数据较
 
 研究人员利用LSTM神经网络分类器对蛋、牛奶和花生过敏等疾病进行了预测，使用clr转换后的相对丰度数据作为DeepMicroGen模型数据输入，比较经重复5次5-fold交叉验证计算 的平均AUC值，与其他插补值生成方法相比，DeepMicroGen模型在所有过敏疾病的预测表现中实现了**最高的改善效果**，其中花生过敏的**预测表现提高了19.5%**。
 
-![](../images/7238_17.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7238_17.png)
 
 编辑​
 

docs/菌群知识库/categories/技术/7281_肠道菌群检测在临床感染中的应用.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["th17-treg", "1609", "1605", "1607", "207", "1604", "333", "1606", "722"]
 date: "2026-06-08"
-images: ["../images/7281_1.png", "../images/7281_2.png", "../images/7281_3.png", "../images/7281_4.gif", "../images/7281_5.png", "../images/7281_6.png", "../images/7281_7.png", "../images/7281_8.png", "../images/7281_9.png", "../images/7281_10.png", "../images/7281_11.png", "../images/7281_12.png", "../images/7281_13.png"]
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 scraped: "2026-08-10T07:31:23.425Z"
 ---
 
@@ -17,7 +17,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:31:23.425Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/7281_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7281_2.png)
 
 **感染**是人类面临的健康威胁之一。各种病原体，如细菌、病毒、真菌、寄生虫等，存在于我们日常接触的环境、物品、食物等中。一些常见的感染病例包括**感冒、流感、腹泻、组织器官或血液感染**等，在全球范围内广泛传播。这些疾病的传播方式多样，可能通过空气、水源、接触和食物等途径传播。
 
@@ -177,7 +177,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:31:23.425Z"
 
 然而，也许你只是摔了一跤擦破了皮，也许只是水果刀不小心划伤了…皮肤作为免疫系统的**第一道防线破了**。
 
-![](../images/7281_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7281_3.png)
 
 这时候细菌就开始争先恐后**进入体内**，不断**繁殖**，增强武力值。
 
@@ -189,7 +189,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:31:23.425Z"
 
 巨噬细胞开始介入这场搏斗，它往往通过**吞噬**的方式以一敌百，不管三七二十一先吞下将其困在膜泡里，利用酶等物质**分解**杀敌，如果细菌还来不及生长繁殖就被吞完了，这场搏斗也就随之终止了。该过程可能引发**局部的炎症**，表现为红，肿，痛，热等。
 
-![](../images/7281_4.gif)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7281_4.gif)
 
 但如果一直持续下去，巨噬细胞也可能累了，它开始发出紧急信号，**召集后援团…**
 
@@ -197,7 +197,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:31:23.425Z"
 
 中性粒细胞出现了，它离开了原本在血液中巡逻的路线，第一时间冲过来加入，武力值开始飙升，健康细胞也会被它**误杀**，它也会给细菌设置障碍，从而**困住细菌**将其干掉。
 
-![](../images/7281_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7281_5.png)
 
 它们也会“适可而止、功成身退”，几天后**自杀**，不带来更多伤害。
 
@@ -215,7 +215,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:31:23.425Z"
 
 后天性免疫系统是一个成长、学习和经验的累积，学习和记忆着病原体的模式，进而**识别并产生特异性的免疫应答**。具有极强的打击和防守能力，可以持续有效地保护我们的身体。
 
-![](../images/7281_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7281_6.png)
 
 这时候，树突状细胞登场了。
 
@@ -281,7 +281,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:31:23.425Z"
 
 肠道上皮组织内的细胞将细菌代谢物**传递给免疫细胞**，从而在局部和全身范围内**促进炎症**。这种情况的持续存在可能导致**亚急性**或**慢性炎症**，随后可能会导致炎症性肠病、糖尿病或心血管疾病等疾病的发展。
 
-![](../images/7281_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7281_7.png)
 
 doi.org/10.3390/biomedicines11020294
 
@@ -313,7 +313,7 @@ C 反应蛋白 (CRP) 是一种**下游炎症标志物**，可以通过特定肠
 
 入ICU后，出现**腹胀**问题，且愈发严重 ⇊
 
-![](../images/7281_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7281_8.png)
 
 ## ► 入院后干预措施
 
@@ -324,7 +324,7 @@ C 反应蛋白 (CRP) 是一种**下游炎症标志物**，可以通过特定肠
 
 **1. 患儿肠道菌群严重失调**
 
-![](../images/7281_9.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7281_9.png)
 
 <来源：谷禾健康肠道菌群检测数据库>
 
@@ -334,7 +334,7 @@ C 反应蛋白 (CRP) 是一种**下游炎症标志物**，可以通过特定肠
 
 **2. 存在艰难梭菌携带超标、酵母菌感染、不动杆菌超标严重（感染）情况**
 
-![](../images/7281_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7281_10.png)
 
 <来源：谷禾健康肠道菌群检测数据库>
 
@@ -362,7 +362,7 @@ C 反应蛋白 (CRP) 是一种**下游炎症标志物**，可以通过特定肠
 
 真菌感染可能通过影响肠道微生物群和免疫反应，**促进病原体的定殖和发展**。
 
-![](../images/7281_11.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7281_11.png)
 
 <来源：谷禾健康肠道菌群检测数据库>
 
@@ -390,11 +390,11 @@ C 反应蛋白 (CRP) 是一种**下游炎症标志物**，可以通过特定肠
 
 用药两周后，患儿整体情况平稳，仍存在轻微腹胀⇊
 
-![](../images/7281_12.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7281_12.png)
 
 肠道菌群**复查提示****菌群结构基本恢复正常**。
 
-![](../images/7281_13.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7281_13.png)
 
 <来源：谷禾健康肠道菌群检测数据库>
 

docs/菌群知识库/categories/技术/7591_用MiCoNE工具对16S序列数据进行共现网络分析.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["16s", "micone", "resert-qiime2", "vsearch", "1696"]
 date: "2026-08-08"
-images: ["../images/7591_1.png", "../images/7591_2.png", "../images/7591_3.png", "../images/7591_4.png", "../images/7591_5.png", "../images/7591_6.png", "../images/7591_7.png", "../images/7591_8.png", "../images/7591_9.png", "../images/7591_10.png"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7591_1.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7591_2.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7591_3.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7591_4.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7591_5.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7591_6.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7591_7.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7591_8.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7591_9.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7591_10.png"]
 scraped: "2026-08-10T07:29:57.888Z"
 ---
 
@@ -17,7 +17,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:29:57.888Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/7591_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7591_2.png)
 
 微生物群通常由数百个物种组成的群落，这些物种之间存在复杂的相互作用。**绘制**微生物群落中不同物种之间的**相互关系**，对于**理解和控制其结构和功能**非常重要。
 
@@ -45,7 +45,7 @@ MiCoNE推理出的共现网络结果**可以导出**为json格式，也可以通
 
 每个模块下的**方框**都告知了该模块下包含的**进程**，以及执行该进程**可选的工具或方法**。
 
-![](../images/7591_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7591_3.png)
 
 在**SP模块**中主要执行对序列的**质检**和**修剪**，在MiCoNE中**提交单个或多个**样本混合的序列都可。
 
@@ -111,7 +111,7 @@ MiCoNE推理出的共现网络结果**可以导出**为json格式，也可以通
 
 去噪后，要对序列进行嵌合体检查，在MiCoNE中应用了两种检查方法，**uchime-Denovo**和**remove-bimera**，经测试这两种方法之间**没有显著差异**。
 
-![](../images/7591_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7591_4.png)
 
 **图AB**用于分析的数据来自FMT研究，**图CD**中用于分析的数据来自模拟数据的mock 4、mock 12和mock 16数据集。基于以上结果，**DC模块**中的**默认方法是**DADA2+remove-bimera。
 
@@ -131,7 +131,7 @@ MiCoNE使用的16S分类参考数据库分别是：
 
 结果如下图所示：
 
-![](../images/7591_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7591_5.png)
 
 **图A**展示了三个不同的参考数据库对前50个具有代表性的序列进行的**属水平的物种注释**，说明了相同的序列是如何被分配到不同数据库中的不同属中的。在**Greengenes**和**NCBI**数据库中，代表序列的很大一部分被归入一个“**unknown**”。
 
@@ -143,7 +143,7 @@ MiCoNE使用的16S分类参考数据库分别是：
 
 ## 3. 在NI模块中发现不同的网络推理方法生成的网络在边密度和连接性方面表现出显著差异
 
-![](../images/7591_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7591_6.png)
 
 如**图A**， 对来自FMT研究的健康人群数据**使用不同网络推断方法**生成了**九个**网络。每个网络的节点（代表物种）在圆形布局中排列，可以**直接可视化**和**比较**它们之间的连接**差异**。**绿色**的连线表示**正相关**，**橙色**的连线表示**负相关**。
 
@@ -166,7 +166,7 @@ MiCoNE使用的16S分类参考数据库分别是：
 
 它们将**基于相关性**和**直接关联方法**计算并过滤后的网络进行组合。**基准数据集是****计算机合成的相互作用数据**，用于**比较**基于MiCoNE流程中的每种关联方法生成的预测关联的**精确度和灵敏度**。结果如下图：
 
-![](../images/7591_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7591_7.png)
 
 **图AC**为**精确度**的结果，**图BD**为**灵敏度**的结果。总体而言，**θ=0.333**的SS方法表现**最佳**，灵敏度和精确度处在良好的平衡上，因此在MiCoNE工具中**默认使用SS方法**。
 
@@ -176,7 +176,7 @@ MiCoNE使用的16S分类参考数据库分别是：
 
 为了分析不同的处理方法对推理的共现网络的影响(在共识估计之前)，研究人员使用MiCoNE中所有的方法组合生成网络，并**量化**每种选择导致的**可变性**，结果如下图：
 
-![](../images/7591_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7591_8.png)
 
 **图A**为在**线性模型**上使用方差分析**(****ANOVA)计算**MiCoNE流程中的DC、CC、TA、OP和NI步骤所贡献的网络**方差百分比**(从FMT数据集生成)。
 
@@ -188,11 +188,11 @@ MiCoNE使用的16S分类参考数据库分别是：
 
 经过上面的测试和分析，研究人员发现**工具和参数的选择**对最终呈现的网络有**很大的影响**，因此**提供了一组默认设置**，如下表，灰色突出显示的工具是MiCoNE的默认工具，这些工具是**基于模拟和合成数据集**的基准测试推荐的。
 
-![](../images/7591_9.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7591_9.png)
 
 使用上面的默认工具和参数从FMT数据集中分别对**自闭症**人群(ASD)和**健康对照**(Healthy)生成的网络进行比较，结果如下图，**对照样本**的网络中有**22个**独有的连接，**自闭症样本**的网络中有**12个**独有的连接，两个网络之间有7个共同的边。
 
-![](../images/7591_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7591_10.png)
 
 研究人员认为尽管这些独有的关联并不意味着实际的相互作用，但它们仍然可以作为文献调查和进一步探索菌群失调机制的起点。
 

docs/菌群知识库/categories/技术/7755_什么是16S rRNA，rDNA， 菌群研究为什么用16S测序，细菌如何命名分类？.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术"
 categoryId: "10"
 tags: ["16s-rrna", "16s", "ijsem", "v4", "1782", "1779"]
 date: "2026-09-15"
-images: ["../images/7755_1.png", "../images/7755_2.png", "../images/7755_3.png", "../images/7755_4.png", "../images/7755_5.png", "../images/7755_6.png", "../images/7755_7.png"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7755_1.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7755_2.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7755_3.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7755_4.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7755_5.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7755_6.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7755_7.png"]
 scraped: "2026-08-10T07:29:00.992Z"
 ---
 
@@ -17,7 +17,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:29:00.992Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/7755_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7755_2.png)
 
 当谈到**肠道菌群研究**时，16S测序是一种**常用的方法**，它在了解**微生物组成和多样性方面**非常重要且实用。
 
@@ -45,7 +45,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:29:00.992Z"
 
 下图显示了16S rRNA（简称16S）如何参与原核核糖体。
 
-![](../images/7755_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7755_3.png)
 
 **•16S rRNA在原核生物中发挥重要功能**
 
@@ -85,7 +85,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:29:00.992Z"
 
 已知细菌16S之间的序列变异**分布不均匀**。在细菌中鉴定出9个高变区，**分别命名为V1至V9。**
 
-![](../images/7755_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7755_4.png)
 
 从长度来看，全长16S长度为**1.5kb左右**，单菌落的16S全长sanger一代测序仍然是**菌种鉴定**的主要手段，纳米孔和Pacbio的三代测序可以高通量的获得全长序列，对于希望**更****高分辨率的分析菌种**的研究有一定优势。
 
@@ -105,7 +105,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:29:00.992Z"
 
 传统的认知中，普遍认为测序片段越长，测到物种数据就越多，故倾向选择16S V3V4。然而16S V4（515-806）引物通用性相对是**所有可变区中最高的**。且在大规模**菌群调查研究**中，如人体菌群研究**HMP**，地球微生物计划**EMP**，欧洲的**FGFP**、美国**肠道计划AGP**以及**全球土壤菌群**调查，都**采用V4区作为检测区域**。16S V4目前仍然是国际研究中使用**最广泛和认可**的检测区域。
 
-![](../images/7755_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7755_5.png)
 
 # 04细菌名称的控制
 
@@ -121,7 +121,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:29:00.992Z"
 
 如下示例：
 
-![](../images/7755_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7755_6.png)
 
 该组合代表“物种名称”，并且在命名系统中应该是**唯一的。**所有分类群的学名必须被视为**拉丁文**；物种等级以上的属群名称是**单个词**。
 
@@ -163,7 +163,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:29:00.992Z"
 
 例如下面是**假单胞菌**菌名称和分类：
 
-![](../images/7755_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7755_7.png)
 
 这些名称是由**提出物种并将其分配给属的科学家**给出的。例如， Thermacanus属已被提出，但并未将其归属于已知科。在**NCBI分类学**中，它属于芽孢杆菌目的暂定科“ Bacillales Family X. Incertae Sedis ” 。
 

docs/菌群知识库/categories/技术服务/1815_宏基因组科研测序分析服务.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术服务"
 categoryId: "8"
 tags: ["50"]
 date: "2026-05-20"
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 scraped: "2026-08-10T07:56:53.788Z"
 ---
 
@@ -47,21 +47,21 @@ scraped: "2026-08-10T07:56:53.788Z"
 
 ## 报告内容（网页结题报告，在线交互）
 
-![](../images/1815_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1815_2.png)
 
 ## 报告示例图表
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2022/04/宏基因组-图表1-1024x505.jpg)
 
-![](../images/1815_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1815_4.png)
 
-![](../images/1815_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1815_5.png)
 
-![](../images/1815_6.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1815_6.jpg)
 
-![](../images/1815_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1815_7.png)
 
-![](../images/1815_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1815_8.png)
 
 ## 分析案例
 
@@ -71,11 +71,11 @@ scraped: "2026-08-10T07:56:53.788Z"
 
 研究纳入了61名严重肥胖的受试者，他们是可调节胃束带术（AGB，n = 20）或Roux-en-Y胃旁路术（RYGB，n = 41）的候选人。减肥手术后1、3和12个月随访24名受试者。使用宏基因组学测序和LC-MS分析肠道菌群和血清代谢组。另外纳入了10人和147人分别作为宏基因组和代谢检测的验证集。
 
-![](../images/1815_9.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1815_9.jpg)
 
 **研究思路**
 
-![](../images/1815_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1815_10.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/08/54-1024x375.png)
 
@@ -91,15 +91,15 @@ scraped: "2026-08-10T07:56:53.788Z"
 
 使用的统计检验方法是pearson和sperman相关和t-test以及Kruskal-Wallis检验。
 
-![](../images/1815_12.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1815_12.webp)
 
 下图是研究将MAGs与**各项生理和代谢值进行相关性分析后的热力图**。该研究由于测序较早，并未独立拼接，而是直接使用了之前一项人类肠道菌群研究获得组装基因组参考序列。
 
-![](../images/1815_13.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1815_13.webp)
 
 进一步研究分析了术后特定变化模式的MAGs以及它们与代谢生理指标的相关性，见下图：
 
-![](../images/1815_14.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1815_14.webp)
 
 上图的研究可以通过pattern search的方法寻找特定变化模式的菌种。
 
@@ -115,7 +115,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:56:53.788Z"
 
 第二项研究是Dan Knights实验室发表在Cell Host & Microbe,2019的一篇针对34个人17天每日饮食和菌群变化的相关研究，试图**揭示日常食物选择与人类肠道微生物组组成之间的精细关系**。
 
-![](../images/1815_15.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1815_15.webp)
 
 可以看到，研究同时记录了粪便样本的菌群宏基因组和每日的饮食记录。研究的核心在于**将每日饮食的食物通过营养构成进行量化，并构建类似物种进化树的食物物候树**。
 
@@ -123,7 +123,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:56:53.788Z"
 
 最后基于**菌群数据**和**前一日饮食**来构建模型**预测判断后一日的菌群状态**，帮助我们了解食物对于个体菌群的影响因素并实现**定量和预测**。
 
-![](../images/1815_16.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1815_16.webp)
 
 研究中对数据的处理过滤标准如下：删除所有具有低读取计数（每个样品<23,500个读取）的样品。物种级别的分类表仅限于研究对象中至少存在**25％**的研究日，且在10%的研究样本对象中发现的那些物种。
 
@@ -131,15 +131,15 @@ scraped: "2026-08-10T07:56:53.788Z"
 
 **菌群和饮食以及营养构成的堆叠图很好展现了变化和对应。**
 
-![](../images/1815_17.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1815_17.webp)
 
 下面这张图很好的显示了饮食食物的变化与菌群变化之间的时间变化关系：
 
-![](../images/1815_18.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1815_18.webp)
 
 下面这张图通过对每个人**单独**进行菌属与食物的Spearman相关，展现了**菌与食物之间的关联的个体化差异**，在特定菌属对应相同食物**不同人会出现完全不同方向的变化**，这也正是这项研究所揭示的，这种**关联关系的复杂性**。
 
-![](../images/1815_19.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1815_19.webp)
 
 ### Tips ：
 
@@ -159,7 +159,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:56:53.788Z"
 
 最后使用**bowtie2**将测序序列比对到注释后的unigene序列上获得基因丰度，经过KEGG注释得到代谢途径的丰度。研究的数据处理流程图如下：
 
-![](../images/1815_20.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1815_20.webp)
 
 在数据分析流程和方案选择上人体肠道菌群由于研究众多，以及有多个深度测序拼接完成的Binning参考基因组数据集，确实可以直接使用参考基因组直接比对。
 
@@ -169,13 +169,13 @@ scraped: "2026-08-10T07:56:53.788Z"
 
 对于**菌属的关联分析**，最终将显著性结果以火山图和GraPhlAn图的形式展现如下：
 
-![](../images/1815_21.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1815_21.webp)
 
 上面其中D图使用每个菌的丰度进行UMAP分析，并映射关联效应的展示比较有意思。
 
 不过在**基因层面**上并未找到相应的关联，可以看到下图UniRef90的NMDS分布图两组之间无法有效区分，多样性也没有显著差异。
 
-![](../images/1815_22.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1815_22.webp)
 
 ### Tips  ：
 
@@ -187,7 +187,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:56:53.788Z"
 
 通过宏基因组**denovo组装**和**分箱Binning**，最终获得了1529个永冻土菌群基因组。基于这些数据描绘了永冻土融化梯度下的**菌群构成特征**，如下图。
 
-![](../images/1815_23.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1815_23.webp)
 
 论文是2018年发表的，测序是在2011和12年测的，使用的是CLC Genomics Workbench 较早的4.4版分单样本组装，然后**使用MetaBAT进行分箱**，最后的标准是70%完成度和低于10%的污染。
 
@@ -195,23 +195,23 @@ scraped: "2026-08-10T07:56:53.788Z"
 
 研究还同时选择了部分样本进行了宏转录组和宏蛋白组的测序，对碳代谢同时结合转录组和蛋白组的数据，展现了**特定通路下不同永冻土的菌群构成和表达丰度差异**。
 
-![](../images/1815_24.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1815_24.webp)
 
 基因组拼接的**分布**情况，以及不同地域样本分布和菌属**丰度**情况如下：
 
-![](../images/1815_25.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1815_25.webp)
 
 木糖降解途径在每个样本中的分布和维恩图，另外详细的展现了主要门对每个代谢途径的贡献和基因**表达丰度**，如下图：
 
-![](../images/1815_26.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1815_26.webp)
 
 这张图分析了特定菌与地理位置和CO2以及甲烷的浓度的**关联性**，如下图：
 
-![](../images/1815_27.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1815_27.webp)
 
 对关键物种的CH 4 :CO2浓度比相关**代谢途径**的重建，以及相应基因的基因家族分析。
 
-![](../images/1815_28.webp)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1815_28.webp)
 
 ### Tips ：
 
@@ -225,13 +225,13 @@ scraped: "2026-08-10T07:56:53.788Z"
 
 ## PCR实验室
 
-![](../images/1815_29.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1815_29.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/05/微信图片_20200521100550-1-833x1024.jpg)
 
 ## 产权资质
 
-![](../images/1815_31.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1815_31.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/05/微信图片_20200521100923-971x1024.jpg)
 
@@ -261,7 +261,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:56:53.788Z"
 
 ## 投稿期刊
 
-![](../images/1815_33.webp)
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 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/08/79-1-681x1024.png)
 

docs/菌群知识库/categories/技术服务/2502_产品和服务.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术服务"
 categoryId: "8"
 tags: ["29"]
 date: "2026-08-27"
-images: ["../images/2502_1.png", "../images/2502_2.jpg", "../images/2502_3.jpg", "../images/2502_4.jpg", "../images/2502_5.jpg", "../images/2502_6.jpg", "../images/2502_7.png", "../images/2502_8.png", "../images/2502_9.png", "../images/2502_10.png"]
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 scraped: "2026-08-10T07:54:29.936Z"
 ---
 
@@ -17,43 +17,43 @@ scraped: "2026-08-10T07:54:29.936Z"
 
 #### 一 肠道菌群健康检测-专业版（16S）
 
-[![](../images/2502_1.png)](http://www.guhejk.com/wordpress/?p=219)
+[![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2502_1.png)](http://www.guhejk.com/wordpress/?p=219)
 
 #### 二 肠道菌群健康检测-宏基因组
 
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 #### 三 肠道菌群健康检测-Plus版(16S+tNGS)
 
-[![](../images/2502_3.jpg)](https://www.guhejk.com/wordpress/?p=16676)
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 #### 四 肠道菌群精准检测-临床版（16S）
 
-[![](../images/2502_4.jpg)](https://www.guhejk.com/wordpress/?p=16721)
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 #### 五 妇科菌群精准检测
 
-[![](../images/2502_5.jpg)](https://www.guhejk.com/wordpress/?p=16702)
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 #### 六 宠物肠道菌群精准检测
 
-[![](../images/2502_6.jpg)](https://www.guhejk.com/wordpress/?p=16710)
+[![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2502_6.jpg)](https://www.guhejk.com/wordpress/?p=16710)
 
 #### 七 16S/18S/ITS测序分析服务-科研项目
 
-[![](../images/2502_7.png)](http://www.guhejk.com/wordpress/?p=1780)
+[![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2502_7.png)](http://www.guhejk.com/wordpress/?p=1780)
 
 #### 八 宏基因组测序分析服务-科研项目
 
-[![](../images/2502_8.png)](http://www.guhejk.com/wordpress/?p=1815)
+[![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2502_8.png)](http://www.guhejk.com/wordpress/?p=1815)
 
 #### 九 浅宏基因组科研测序分析服务-科研项目
 
-[![](../images/2502_9.png)](http://www.guhejk.com/wordpress/?p=2524)
+[![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2502_9.png)](http://www.guhejk.com/wordpress/?p=2524)
 
 #### 十 肠道菌群精准检测-菌群版
 
-[![](../images/2502_10.png)](http://www.guhejk.com/wordpress/?p=298)
+[![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/2502_10.png)](http://www.guhejk.com/wordpress/?p=298)
 																	
 					
 			

docs/菌群知识库/categories/技术服务/283_科研16s_ITS测序分析服务.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术服务"
 categoryId: "8"
 tags: ["16s--"]
 date: "2026-05-03"
-images: ["../images/283_1.png", "../images/283_2.jpg", "../images/283_3.png", "../images/283_4.png", "../images/283_5.jpg", "../images/283_6.jpg", "../images/283_7.png", "../images/283_8.png", "../images/283_9.jpg", "../images/283_10.png", "../images/283_11.jpg", "../images/283_12.png", "../images/283_13.jpg", "../images/283_14.jpg", "../images/283_15.png", "../images/283_20.jpg", "../images/283_21.jpg", "../images/283_22.jpg", "../images/283_23.jpg", "../images/283_46.png", "../images/283_47.png", "../images/283_48.png", "../images/283_102.png", "../images/283_103.png", "../images/283_104.png", "../images/283_105.png", "../images/283_110.png"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_1.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_2.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_3.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_4.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_5.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_6.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_7.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_8.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_9.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_10.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_11.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_12.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_13.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_14.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_15.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_20.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_21.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_22.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_23.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_46.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_47.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_48.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_102.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_103.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_104.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_105.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_110.png"]
 scraped: "2026-08-10T08:02:19.451Z"
 ---
 
@@ -24,11 +24,11 @@ scraped: "2026-08-10T08:02:19.451Z"
 
 一 **水体样本**
 
-![](../images/283_2.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_2.jpg)
 
-![](../images/283_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_3.png)
 
-![](../images/283_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_4.png)
 
  **01**  研究背景
 
@@ -36,7 +36,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:02:19.451Z"
 
 **02**   主要图表  
 
-![](../images/283_5.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_5.jpg)
 
 **03** 主要结论 
 
@@ -44,11 +44,11 @@ scraped: "2026-08-10T08:02:19.451Z"
 
 **二 小鼠肠道样本**
 
-![](../images/283_6.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_6.jpg)
 
-![](../images/283_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_7.png)
 
-![](../images/283_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_8.png)
 
 **01** 研究背景 
 
@@ -56,7 +56,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:02:19.451Z"
 
 **02** 主要图表 
 
-![](../images/283_9.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_9.jpg)
 
 **03** 主要结论 
 
@@ -64,11 +64,11 @@ scraped: "2026-08-10T08:02:19.451Z"
 
 **三 土壤样本**
 
-![](../images/283_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_10.png)
 
-![](../images/283_11.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_11.jpg)
 
-![](../images/283_12.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_12.png)
 
 **01** 研究背景 
 
@@ -78,7 +78,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:02:19.451Z"
 
 **02**  主要图表 
 
-![](../images/283_13.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_13.jpg)
 
 **03** 主要结论 
 
@@ -88,9 +88,9 @@ scraped: "2026-08-10T08:02:19.451Z"
 
 合作服务整体流程如下：
 
-![](../images/283_14.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_14.jpg)
 
-![](../images/283_15.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_15.png)
 
 部分分析内容一览表 ：
 
@@ -112,7 +112,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:02:19.451Z"
 
 专门面向肠道菌群相关科研实验的完整肠道菌群检测方案
 
-![](../images/283_20.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_20.jpg)
 
 专注于解决肠道菌群实际研究中的各种问题并进行全方位针对性优化。
 
@@ -122,7 +122,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:02:19.451Z"
 
 **取样**：检测方案为客户提供肠道菌群专用取样盒，没有经过训练的普通人也可以完成稳定可靠的取样。稳定可靠的保存液可在室温下有效完整保存样品DNA至少60天。
 
-![](../images/283_21.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_21.jpg)
 
 [WPGP gif_id=”276″ width=”600″]
 
@@ -180,7 +180,7 @@ V3-V4区：
 
 **肠道菌群参考数据集**：近20万例肠道菌群样本数据针对性构建的肠道菌群参考数据库远超Greengene或SILVA的覆盖度，提供史无前例的分辨精度。 
 
-![](../images/283_22.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_22.jpg)
 
 **人工智能分析模型**：肠道菌群的复杂程度以及不同样品之间的巨大差异已无法使用简单的统计模型来解析，专业的人工智能专家对数万例样本和40多种疾病深度模型分析之后的结晶，精细化区分各种环境及影响因素的干扰，数量化评估每个特征的贡献。
 
@@ -202,7 +202,7 @@ V3-V4区：
 
 **一文扫除困惑**
 
-![](../images/283_23.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_23.jpg)
 
 **首先什么是16S rRNA？**
 
@@ -478,7 +478,7 @@ PCA分析是基于**原始的物种组成矩阵**所做的排序分析，而PCoA
 
 样本与物种的共线性关系circus 图是一种描述样本与物种之间对应关系的可视化圈图，该图不仅反映了每个样本的优势物种组成比例，同时也反映了各优势物种在不同样本之间的分布比例。
 
-![](../images/283_46.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_46.png)
 
 图解读：样本与物种的共线性关系图，左半边表示样本属物种丰度情况。右半边表示属水平在不同样本中的分布比例情况。在最内一圈：左边不同颜色代表不同物种，宽度表示物种丰度，圈外数值表示物种丰度刻度值。一端连接右边的样本，不同颜色代表不同样本，条带端点宽度表示该样本中对应物种的比例分布。最外两圈：左边不同颜色表示不同样本在某一物种的比例，右边不同颜色表示不同物种在某一样本中的比例。
 
@@ -486,7 +486,7 @@ PCA分析是基于**原始的物种组成矩阵**所做的排序分析，而PCoA
 
 三元相图是重心图的一种，它有三个变量，在一个等边三角形坐标系中，图中某一点的位置代表三个变量间的比例关系。这里表示三组样本之间优势物种的差异，通过三元图可以展示出不同物种在分组中的比重关系。
 
-![](../images/283_47.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_47.png)
 
 图解读：三角分别代表三个或三组样本，图中的圆分别代表排名最高哦的属水平的物种，三种颜色分别代表三组不同分组的优势物种，圆圈大小代表物种的相对丰度，圆圈理哪个顶点接近，表示此物种在这个分组中的含量较高。该分析仅限三个样本或三组样本之间分析比较。
 
@@ -494,7 +494,7 @@ PCA分析是基于**原始的物种组成矩阵**所做的排序分析，而PCoA
 
 通过R 软件的corrplot 包绘制spearman 相关性热图，并通过该热图可以发现优势物种/样本之间重要的模式与关系。
 
-![](../images/283_48.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_48.png)
 
 图解读：蓝色系的为正相关，红色系的为负相关，×表示检验水平下无意义。越靠近颜色条两头，相关系数越大。所以说，我们可以通过实心圆的颜色和大小判断相关的方向和相关系数的大小。
 
@@ -1098,11 +1098,11 @@ clean reads）和 v3v4(5万clean reads)测序数据比较:**
 
 V4
 
-![](../images/283_102.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_102.png)
 
 V3V4
 
-![](../images/283_103.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_103.png)
 
 以上两表是对原始序列数据进行统计，表中可以看出有效序列tags、高质量序列clean_tags、otus数量 
 V4区都远高于v3v4区。V4区测序获得下机数据在13万条左右，v4区测序获得的下机数据在5万条左右。
@@ -1111,11 +1111,11 @@ Alpha多样性指数比较：
 
 V4
 
-![](../images/283_104.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_104.png)
 
 V3V4
 
-![](../images/283_105.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_105.png)
 
 以上两个表分别是对Alpha多样性指数计算的结果比较
 
@@ -1159,7 +1159,7 @@ V3v4
 
 **项目系统**：检测方案将为每一位合作者建立项目系统，全程了解样品和项目情况，并可直接与相应人员沟通。
 
-![](../images/283_110.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/283_110.png)
 
 项目进度管理系统为项目提供从项目需求到样品接收以及实验过程和测序分析、售后全程管理和人员责任。 不用担心测完之后的售后问题，项目系统是永久登录的。售后**全部都是服务到发文章为止**~ 
 

docs/菌群知识库/categories/技术服务/298_君验肠道菌群精准检测.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "技术服务"
 categoryId: "8"
 tags: ["107"]
 date: "2026-05-04"
-images: ["../images/298_1.png", "../images/298_2.jpg"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/298_1.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/298_2.jpg"]
 scraped: "2026-08-10T08:02:03.749Z"
 ---
 
@@ -18,7 +18,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:02:03.749Z"
 使用新一代高通量基因测序技术，提供精确全面的肠道菌群构成分析。
 该版本为消费者提供了便捷精准的探索自身肠道菌群的方式，背后是谷禾多年技术研发和专业肠道菌群检测的支持。
 
-![](../images/298_2.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/298_2.jpg)
 
 ## 检测报告内容
 

docs/菌群知识库/categories/报告解读/15271_肠道菌群报告更新说明20240823.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "报告解读"
 categoryId: "9"
 tags: ["2261"]
 date: "2026-08-23"
-images: []
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/"]
 scraped: "2026-08-10T07:19:13.898Z"
 ---
 

docs/菌群知识库/categories/报告解读/6096_如何解读肠道菌群检测报告中维生素指标.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "报告解读"
 categoryId: "9"
 tags: ["b", "423", "521", "b1", "b12", "b2", "b3", "b5", "b6", "b7", "b9", "c", "1178", "12", "1177", "203"]
 date: "2026-09-09"
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 scraped: "2026-08-10T07:37:45.941Z"
 ---
 
@@ -21,7 +21,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:37:45.941Z"
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2022/09/1-5-1024x732.png)
 
-![](../images/6096_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6096_3.png)
 
 摄入水平建议保持在70-80分之间最佳，如果单项指标**低于5**表明摄入比例在人群中属于最低的5%，评估为**缺乏**，如上图中维生素B2；**低于15**评估为**偏低**，如上图中叶酸；**达到或超过95**则表明该项指标可能摄入比例**偏高**，可适当减少摄入；其余则为**正常**范围。 
 
@@ -47,9 +47,9 @@ scraped: "2026-08-10T07:37:45.941Z"
 
 在阅读本文之前，可以先了解一下各类常见的维生素功能，缺乏导致的症状。
 
-![](../images/6096_4.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6096_4.jpg)
 
-![](../images/6096_5.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6096_5.jpg)
 
 每个维生素的详细介绍可以**点开以下**查看（请在谷禾健康微信公众号找到这篇文章查看）。
 
@@ -124,7 +124,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:37:45.941Z"
 
 **可以合成 B 族维生素的细菌以及****B 族维生素缺乏对肠道健康的影响**
 
-![](../images/6096_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6096_6.png)
 
 doi.org/10.3390/microorganisms10061168
 
@@ -142,7 +142,7 @@ doi.org/10.3390/microorganisms10061168
 
 下表列出了参与合成B族维生素的肠道菌群，以及相应的代谢机制。
 
-![](../images/6096_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6096_7.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2022/09/5-3-398x1024.png)
 
@@ -158,7 +158,7 @@ doi.org/10.3390/microorganisms10061168
 
 **肠道微生物组和宿主之间的微量营养素交换**
 
-![](../images/6096_9.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6096_9.jpg)
 
 doi: 10.1002/biof.1835
 
@@ -172,7 +172,7 @@ doi: 10.1002/biof.1835
 
 **补充维生素对人体肠道菌群的影响**
 
-![](../images/6096_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6096_10.png)
 
 doi.org/10.3390/nu14163383
 
@@ -196,7 +196,7 @@ B族维生素与肠道菌群互作
 
 也有研究表明，维生素 C 服用4周导致 **α 多样性增加**，短链脂肪酸浓度增加。
 
-![](../images/6096_11.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6096_11.png)
 
 / **维生素D **/
 
@@ -220,13 +220,13 @@ B族维生素与肠道菌群互作
 
 **关于维生素对人体肠道微生物组直接影响的研究**
 
-![](../images/6096_12.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6096_12.jpg)
 
-![](../images/6096_13.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6096_13.jpg)
 
-![](../images/6096_14.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6096_14.jpg)
 
-![](../images/6096_15.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6096_15.jpg)
 
 doi.org/10.1016/j.nutres.2021.09.001
 
@@ -240,7 +240,7 @@ doi.org/10.1016/j.nutres.2021.09.001
 
 **地中海饮食是营养均衡饮食的典型代表**，其特点是大量且频繁地摄入重要的**纤维**来源（**谷物、蔬菜、豆类、水果和坚果**）和具有**抗氧化**特性的化学成分（**维生素**、类黄酮、植物甾醇、矿物质、萜烯和酚类）。
 
-![](../images/6096_16.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6096_16.jpg)
 
 同时地中海饮食还富含复杂和不溶性**纤维**含量。我们知道，大量摄入膳食纤维可促进肠道中有益菌群的生长，例如增加拟杆菌、普雷沃氏菌属、罗斯氏菌属、瘤胃球菌属、普拉梭菌等菌属的丰度，从而在肠道中产生**高水平的短链脂肪酸**，包括丁酸盐。
 
@@ -256,7 +256,7 @@ doi.org/10.1016/j.nutres.2021.09.001
 
 **维生素对宿主健康的影响**
 
-![](../images/6096_17.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6096_17.jpg)
 
 doi.org/10.1016/j.nutres.2021.09.001
 
@@ -320,7 +320,7 @@ doi.org/10.1016/j.nutres.2021.09.001
 
 全反式维甲酸 (AtRA) 可**降低** UC 和结直肠癌患者结肠黏膜分泌的 TNF-α 和一氧化氮合酶 2 (NOS2) 蛋白的表达。
 
-![](../images/6096_18.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6096_18.jpg)
 
 **维生素A保护肠黏膜屏障，其潜在机制是拮抗LPS的肠道破坏作用**
 
@@ -340,7 +340,7 @@ IBD 患者缺乏维生素 B12 和叶酸的原因有很多，包括**回肠和空
 
 **维生素 B12 缺乏**不会影响健康的肠道微生物群组成；然而，它会导致实验性结肠炎中肠道菌群失调，并**促进条件致病菌的生长**。出乎意料的是，维生素 B12 缺乏减少了结肠组织的损伤；这可能与抗炎细胞因子 IL-10 的增加有关。
 
-![](../images/6096_19.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6096_19.png)
 
 对甲基缺乏饮食 (MDD) 的潜在作用进行了一项研究，该饮食可**降低维生素 B12 和叶酸的血浆浓度**，并提高同型半胱氨酸水平，对 DSS 诱导的小鼠结肠炎的影响。喂食 MDD 的 DSS 治疗小鼠比其他治疗组**患有更严重的结肠炎**。
 
@@ -364,7 +364,7 @@ IBD 患者缺乏维生素 B12 和叶酸的原因有很多，包括**回肠和空
 
 1α，25-二羟基维生素 D3（骨化三醇）是维生素 D 的活性形式，可与 TGF-β 结合，**提高 IL-2** 水平，调节 T 细胞**抑制**炎性细胞因子的产生，**增强** Foxp3 + Treg 细胞的存活和功能。
 
-![](../images/6096_20.jpg)While taking a vitamin D supplement may help manage vitamin D levels, there are also whole foods that can provide more of this vitamin in your daily diet.
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6096_20.jpg)While taking a vitamin D supplement may help manage vitamin D levels, there are also whole foods that can provide more of this vitamin in your daily diet.
 
 **维生素D受体（VDR）是维生素D调节免疫和发挥抗炎作用的重要途径**
 
@@ -378,7 +378,7 @@ IBD 患者缺乏维生素 B12 和叶酸的原因有很多，包括**回肠和空
 
 关于肠道细菌在心理健康方面的作用的关键方面，是它们通过**犬尿氨酸通路**参与**调节色氨酸代谢**。微生物群能够合成犬尿氨酸途径 (KP) 的酶促辅助因子，如**维生素 B2 和 B6**。
 
-![](../images/6096_21.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6096_21.jpg)
 
 犬尿氨酸是主要的色氨酸代谢途径，其中 **95%** 的这种氨基酸被代谢为各种免疫和神经调节犬尿氨酸/色氨酸**分解代谢物** (TRYCAT)，在大脑中，犬尿氨酸途径主要在**神经胶质细胞**中分隔。
 
@@ -464,7 +464,7 @@ IBD 患者缺乏维生素 B12 和叶酸的原因有很多，包括**回肠和空
 
 脂溶性维生素包括：维生素 A、D、E 、K.
 
-![](../images/6096_22.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6096_22.jpg)
 
 doi: 10.7717/peerj.11940
 
@@ -478,7 +478,7 @@ doi: 10.7717/peerj.11940
 
 当我们看到维生素缺乏的时候，可能希望通过饮食来补充相应缺乏的维生素，下表列出了常见的维生素的食物来源，可供参考。
 
-![](../images/6096_23.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6096_23.jpg)
 
 此外，宿主饮食作为肠道中细菌的底物，其对肠道微生物分布的影响已被广泛研究。含有**益生元**和其他膳食营养素（如**微量营养素**和**多酚**）的饮食可以显着影响**有益细菌**的生长，包括维生素生产菌。
 
@@ -506,7 +506,7 @@ doi: 10.7717/peerj.11940
 
 **产维生素的益生菌在肠道疾病中的作用**
 
-![](../images/6096_24.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6096_24.jpg)
 
 doi.org/10.3390/nu14163383
 
@@ -584,7 +584,7 @@ doi.org/10.3390/nu14163383
 
 下表是维生素易缺乏的高风险人群：
 
-![](../images/6096_25.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6096_25.jpg)
 
 **▸可以长期服用维生素补充剂吗？补充过量会带来副作用吗？**
 
@@ -592,7 +592,7 @@ doi.org/10.3390/nu14163383
 
 对于服用复合维生素片，多余的维生素会被排出体外，因此不用过于担心会带来危害。但是如果**长期十倍以上****的用量**，对身体是有**危害**的。
 
-![](../images/6096_26.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6096_26.jpg)
 
 doi: 10.7717/peerj.11940
 
@@ -604,13 +604,13 @@ doi: 10.7717/peerj.11940
 
 如果维生素指标都**显示正常**没有缺乏（如下图），保持常规饮食**不需要刻意补充**。还想要更健康，指标更接近70的话，可以在数值略小的指标上，针对性地通过饮食进行补充调理。
 
-![](../images/6096_27.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6096_27.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2022/09/23-1024x664.png)
 
 如果维生素指标中出现**个别**指标**缺乏或偏低**（如下图），可以通过**饮食**针对性地进行改善调整，如果已经出现对应症状，例如缺乏维生素A，**同时出现**干眼症或者夜盲症等相应的**症状**，可以使用**相应的****维生素补充剂**进行干预，或者根据菌群代谢通路判别，通过**菌群调理**进行相应干预。
 
-![](../images/6096_29.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6096_29.png)
 
 如果维生素指标中出现缺乏或偏低的**指标****较多**，则需要选用**复合维生素**，各类维生素之间可能存在协作关系，同时配合饮食、菌群进行干预。
 

docs/菌群知识库/categories/报告解读/6291_如何理解有害菌，病原菌，致病菌？.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "报告解读"
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 date: "2026-10-19"
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 scraped: "2026-08-10T07:36:51.339Z"
 ---
 
@@ -17,13 +17,13 @@ scraped: "2026-08-10T07:36:51.339Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/6291_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6291_2.png)
 
 大多数细菌对我们的生活是有**帮助**和必要的，某些细菌可以帮助消化，为身体提供能量，分解毒素，保护肠道，增强免疫力等，从而**有益健康**；也有一些细菌会给我们的健康带来一些**危害**。
 
 然而有些菌并不是天生注定就是致病菌，也许正常状况下，它只是体内默默地存在着，但可能在某种特定条件下突然变身，彰显其**致病威力。**
 
-![](../images/6291_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6291_3.png)
 
 事实上，许多**严重的疾病**是由健康个体的皮肤、粘膜或肠道中**常见的细菌引起**的。在这些情况下，**致病菌根本不是专性病原体**，而是遵循新的生态轨迹的共生体，通常会迁移到与宿主不再和谐相处的侵入性生态位。
 
@@ -33,7 +33,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:36:51.339Z"
 
 在谷禾肠道菌群健康检测报告中，我们会看到关于有益菌，有害菌，致病菌的检测：
 
-![](../images/6291_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6291_4.png)
 
 有小伙伴有疑问，这里既显示有害菌又有致病菌，有害菌不是致病菌吗？
 
@@ -76,7 +76,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:36:51.339Z"
 - 肠道致病菌列出了最主要和常见的感染类肠道病原菌。注：在肠道环境中, 鼠伤寒沙门氏菌、霍乱弧菌、艰难梭菌、大肠杆菌等肠道致病菌感染宿主机体, 影响宿主机体的正常免疫代谢过程, 引发急性肠胃炎等疾病。
 - 病原菌中给出的包括几十种人体致病菌，不仅仅是肠道的，还有包括机会致病菌。如果没有检出就没有列出。
 
-![](../images/6291_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6291_5.png)
 
 ✦ +
 
@@ -116,7 +116,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:36:51.339Z"
 
 炭疽杆菌是一种人畜共患病的病原体，是一种专性病原体，因为细菌的繁殖周期只发生在合适的宿主中。
 
-![](../images/6291_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6291_6.png)
 
 编辑​
 
@@ -138,7 +138,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:36:51.339Z"
 
 鼠疫耶尔森菌是一种小型、非运动的**革兰氏阴性**细菌，属于肠杆菌科。鼠疫耶尔森氏菌是鼠疫的病原体，鼠疫是一种**罕见但高度致命**的人畜共患病。
 
-![](../images/6291_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6291_7.png)
 
 图源：onlinebiologynotes
 
@@ -166,7 +166,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:36:51.339Z"
 
 细菌进入体内后，在**局部繁殖**，引起**溃疡和坏死**，然后**侵入血液和淋巴管**，**扩散**至肝、脾、肺、肾、浆膜、骨髓等淋巴结和器官，引起多发性凝固性坏死灶。
 
-![](../images/6291_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6291_8.png)
 
 图源：DeviantArt
 
@@ -194,7 +194,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:36:51.339Z"
 
 它会引起一种**罕见但严重**的疾病。产生一种特殊类型的**外毒素**，通过抑制神经肌肉连接的活动来影响神经系统。因此，肉毒杆菌毒素表现为一种**神****经毒素**，它会**阻止神经递质的释放**。
 
-![](../images/6291_9.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6291_9.png)
 
 图源：Science Photo Library
 
@@ -440,7 +440,7 @@ BF毒素引起剧烈的炎症和“细胞间附着物的丧失”，从而引起
 
 可以在人体**肠道，污水和土壤**中正常发现。
 
-![](../images/6291_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6291_10.png)
 
 图源：Food Safety News
 
@@ -530,7 +530,7 @@ BF毒素引起剧烈的炎症和“细胞间附着物的丧失”，从而引起
 
 **荚膜多糖**的组成和数量在毒力中起**主要作用**。产生最大量多糖的菌株可能是最强毒的。
 
-![](../images/6291_11.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6291_11.png)
 
 图源：Science Photo Library
 
@@ -621,7 +621,7 @@ GBS阴道或直肠定植的母亲所生的婴儿中，有1％至2％的**婴儿
 
 较不常见的感染包括**心内膜炎**和**骨髓炎**。
 
-![](../images/6291_12.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6291_12.png)
 
 图源：ecdc.europa.eu
 
@@ -689,7 +689,7 @@ GBS阴道或直肠定植的母亲所生的婴儿中，有1％至2％的**婴儿
 
 通过抽吸或直接吸入到达肺部后，会**附着在呼吸道粘膜**上。
 
-![](../images/6291_13.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6291_13.png)
 
 图源：apotheekteirlinck.be
 
@@ -770,7 +770,7 @@ GBS阴道或直肠定植的母亲所生的婴儿中，有1％至2％的**婴儿
 
 随着时间的推移，如果没有采取相应的干预措施，有害菌变得过多，则可能会对身体方方面面产生影响：
 
-![](../images/6291_14.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6291_14.png)
 
 ## 心血管疾病
 
@@ -879,7 +879,7 @@ TMAO产生的增加也与**慢性肾脏**疾病有关。也会导致肾结石的
 
 与骨骼疾病相关的肠道菌群变化如下：
 
-![](../images/6291_16.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6291_16.png)
 
 编辑​
 
@@ -911,7 +911,7 @@ TMAO产生的增加也与**慢性肾脏**疾病有关。也会导致肾结石的
 
 **益生菌**抑制其他菌群的生长：
 
-![](../images/6291_17.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6291_17.png)
 
 编辑​
 
@@ -1019,9 +1019,9 @@ TMAO产生的增加也与**慢性肾脏**疾病有关。也会导致肾结石的
 
 **维生素E****对变形菌**有抑制作用，而维生素E（和纤维）的摄入量较低与Sutterella水平较高相关。
 
-![](../images/6291_18.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6291_18.png)
 
-![](../images/6291_19.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6291_19.png)
 
 详见维生素的文章：
 
@@ -1065,7 +1065,7 @@ TMAO产生的增加也与**慢性肾脏**疾病有关。也会导致肾结石的
 
 睡眠质量与肠道菌群组成之间存在双向关系。
 
-![](../images/6291_20.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6291_20.png)
 
 编辑​
 
@@ -1089,7 +1089,7 @@ TMAO产生的增加也与**慢性肾脏**疾病有关。也会导致肾结石的
 
 **抗生素使用对肠道菌群变化的不同影响**
 
-![](../images/6291_21.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/6291_21.png)
 
 Yang L*, et al., AMB Express.* 2021
 

docs/菌群知识库/categories/报告解读/7181_生物信息学——用好源代码的技巧与心法.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "报告解读"
 categoryId: "9"
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 date: "2026-05-16"
-images: ["../images/7181_1.png", "../images/7181_2.png", "../images/7181_3.png", "../images/7181_4.png", "../images/7181_5.png", "../images/7181_6.png", "../images/7181_7.png", "../images/7181_8.png", "../images/7181_9.png", "../images/7181_10.png", "../images/7181_11.png"]
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 scraped: "2026-08-10T07:31:49.137Z"
 ---
 
@@ -17,13 +17,13 @@ scraped: "2026-08-10T07:31:49.137Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/7181_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7181_2.png)
 
 如果你是一名科研人员，在研究的过程中需要用到代码，那么你可能不需要像专业码农那样从头到尾一句一句去写完整的，而是可以将网上的一段符合应用场景的现成代码拿过来直接用。
 
 这听起来是不是很简单？然而实际上…
 
-![](../images/7181_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7181_3.png)
 
 目前，虽然学术界有资源可以用来编写更好的代码，但很少关注使用他人的代码可能遇到的问题，比如：有时候看着别人的代码过于繁琐、晦涩难懂；又或者绕进去，反而忘了自己一开始要干什么；或者添油加醋最后一团乱麻；甚至即便是费了九牛二虎之力搞懂了，deadline却已经在眼前了…
 
@@ -33,7 +33,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:31:49.137Z"
 
 这10条规则可以分为计划、理解、更改和发布类别。
 
-![](../images/7181_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7181_4.png)
 
 doi.org/10.1371/journal.pcbi.1011031.g002
 
@@ -47,7 +47,7 @@ doi.org/10.1371/journal.pcbi.1011031.g002
 
 还是需要添加一些代码中当前不存在的功能？
 
-![](../images/7181_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7181_5.png)
 
 不同的目标需要对应不同的方法。
 
@@ -232,7 +232,7 @@ Conda和DockerHub都是**社区驱动的平台**，你也可以贡献自己的
 
 这不需要完美，可以简单地用纸笔或黑板**快速绘制草图**。你可能想可视化代码的结构、数据的传递方式、哪些函数调用其他函数等。只要把一些东西写在纸上就可以帮助**可视化**系统。
 
-![](../images/7181_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7181_6.png)
 
 doi.org/10.1371/journal.pcbi.1011031.g002
 
@@ -296,7 +296,7 @@ StackOverflow是一个有用的资源，经常出现在谷歌搜索结果中。
 
 根据你所在的机构，你可能会获得研究软件工程师团队的帮助。这可以是一般性建议或支持的形式，也可以是他们愿意承担与代码库相关的项目并跟你合作。
 
-![](../images/7181_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7181_7.png)
 
 # 08在改代码之前先思考
 
@@ -306,13 +306,13 @@ StackOverflow是一个有用的资源，经常出现在谷歌搜索结果中。
 
 其实，完成任务的**最有效方法是：****意识到你根本不需要去做它**。当然，有时候改变是必要的，但在动手之前，先花点时间思考一下。
 
-![](../images/7181_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7181_8.png)
 
 **改变代码可能会带来很多意想不到的麻烦**，特别是当你不太了解代码的运作方式或者理解不到位时，这种后果就更加可能发生。有些你看起来垃圾的代码可能是出于某种重要的原因而写成这样的。一旦你改变了代码，你就改变了代码的本质，不能确定它是按预期的，还是因为你的改变引起的。
 
 关于修改代码，有本书叫《代码修改的艺术(Working Effectively with Legacy Code)》
 
-![](../images/7181_9.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7181_9.png)
 
 改代码的目的**不是要破坏原有功能**，而是尽可能有效地完成改动。所以，我们需要明确改动的目的，**只做必要的改动**。
 
@@ -352,7 +352,7 @@ StackOverflow是一个有用的资源，经常出现在谷歌搜索结果中。
 
 Git还允许轻松对代码进行版本控制，便于你可以将代码库**回溯到特定版本或时间**，这对于研究的可重复性非常重要。
 
-![](../images/7181_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7181_10.png)
 
 # 10在网上发布代码及相关更改
 
@@ -384,7 +384,7 @@ Git还允许轻松对代码进行版本控制，便于你可以将代码库**回
 
 在他们发布了几年后有人联系他们合作一个类似的项目，这是一个很好的机会，但他们差点拒绝了——因为他们找不到代码，之前写在一台旧笔记本电脑上的，现在已经无法访问了。幸运的是，他们意识到当时已经在GitHub上发布了代码，因此才有可能达成合作。
 
-![](../images/7181_11.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7181_11.png)
 
 **GitHub是共享代码的标准平台**
 

docs/菌群知识库/categories/报告解读/7264_肠道健康从核心菌属开始：肠道菌群的关键.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "报告解读"
 categoryId: "9"
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 date: "2026-06-07"
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 scraped: "2026-08-10T07:31:29.750Z"
 ---
 
@@ -17,7 +17,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:31:29.750Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/7264_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7264_2.png)
 
 5月29日，是**世界肠道健康日**。肠道是人体最重要的消化系统之一，与人体健康紧密相关。而**肠道菌群**作为肠道重要组成部分，在肠道健康中发挥着重要的作用。
 
@@ -27,7 +27,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:31:29.750Z"
 
 然而在不同年龄段不同人群中，有一类菌群却普遍存在，它们在人体的健康和稳定性方面发挥着重要的作用，这就是“**肠道核心菌属**”。
 
-![](../images/7264_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7264_3.png)
 
 在这个世界肠道健康日，我们一起来聊聊关于“肠道核心菌属”。结合肠道菌群检测报告的部分案例，我们可以更深入直观地了解肠道核心菌属，这对于我们保持肠道健康和整体健康有重要意义。
 
@@ -63,7 +63,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:31:29.750Z"
 
 核心菌属**缺乏****就****给了病原菌**或非肠道菌群**生存空间**，导致肠道健康问题。
 
-![](../images/7264_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7264_4.png)
 
 <来源：谷禾肠道菌群检测数据库>
 
@@ -114,7 +114,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:31:29.750Z"
 
 下图其中**第4列**就给出了这个指标，意思是这个核心菌属现有丰度超过了人群中%的人。
 
-![](../images/7264_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7264_5.png)
 
 <来源：谷禾肠道菌群检测数据库>
 
@@ -235,7 +235,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:31:29.750Z"
 
 以下是与每种核心菌属相关的疾病数量：
 
-![](../images/7264_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7264_6.png)
 
 <来源：谷禾肠道菌群检测数据库>
 
@@ -256,13 +256,13 @@ scraped: "2026-08-10T07:31:29.750Z"
 
 该慢性腹泻患者的肠道菌群检测报告中，许多核心菌属均处于**低丰度**的情况。
 
-![](../images/7264_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7264_7.png)
 
 <来源：谷禾肠道菌群检测数据库>
 
 当多数核心菌属丰度较低处于劣势的情况下，**肠道有害菌**逐渐开始占上风：
 
-![](../images/7264_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7264_8.png)
 
 <来源：谷禾肠道菌群检测数据库>
 
@@ -296,11 +296,11 @@ scraped: "2026-08-10T07:31:29.750Z"
 
 **有害菌过多会影响肠道内环境**，如pH值，含氧量，肠道内毒素等，可能会导致出现一些机会感染和机会致病菌入侵，进而**诱发肠道炎症和相关疾病**。
 
-![](../images/7264_9.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7264_9.png)
 
 **➤➤ 便秘患者：**
 
-![](../images/7264_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7264_10.png)
 
 <来源：谷禾肠道菌群检测数据库>
 
@@ -310,7 +310,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:31:29.750Z"
 
 核心菌属丰度低，伴随着**部分有害菌的丰度大幅上升**，肠道菌群多样性下降。
 
-![](../images/7264_11.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7264_11.png)
 
 <来源：谷禾肠道菌群检测数据库>
 
@@ -320,7 +320,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:31:29.750Z"
 
 不动杆菌属对常见抗生素经常会产生**抗药性**。这里不动杆菌属丰度较高可能与**抗生素使用**较多相关。
 
-![](../images/7264_12.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7264_12.png)
 
 泛菌属Pantoea：57.592%
 
@@ -340,7 +340,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:31:29.750Z"
 
 **肠易激综合征、消化不良患者：**
 
-![](../images/7264_13.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7264_13.png)
 
 <来源：谷禾肠道菌群检测数据库>
 
@@ -360,11 +360,11 @@ scraped: "2026-08-10T07:31:29.750Z"
 
 注：在谷禾肠道菌群检测报告评分机制中，超过80分已经算很健康的状态。
 
-![](../images/7264_14.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7264_14.png)
 
 其核心菌属丰度如下：
 
-![](../images/7264_15.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7264_15.png)
 
 <来源：谷禾肠道菌群检测数据库>
 

docs/菌群知识库/categories/未分类/14752_谷禾报告重要菌的相关知识说明.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "未分类"
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 tags: []
 date: "2026-05-23"
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+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/"]
 scraped: "2026-08-10T07:21:42.945Z"
 ---
 

docs/菌群知识库/categories/未分类/16259_中国儿童粪菌移植十年安全性评估：单中心大样本回顾性研究.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "未分类"
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 date: "2026-06-12"
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 scraped: "2026-08-10T07:13:26.632Z"
 ---
 
@@ -17,7 +17,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:13:26.632Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/16259_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16259_2.png)
 
 随着现代医学的不断进步，人类对于肠道微生态的研究正逐渐深入，**粪菌移植**(FMT)作为一种新兴的、生物学意义深远的治疗手段，在临床实践中展现出了革命性潜力。FMT广泛用于**治疗艰难梭菌感染**等复杂疾病，并逐渐延伸至**免疫**功能调节、**代谢紊乱**等领域，尤其是在儿童人群中的应用引发了广泛关注。
 
@@ -25,7 +25,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:13:26.632Z"
 
 近日，一项来自上海儿童医院的**大规模单中心回顾性研究**，揭示了FMT在儿童人群中的长期安全性数据。这项跨越**十年**（**2013-2023年**）、涵盖**813名儿童**患者的研究，不仅是目前**样本量最大**的儿科FMT安全性评估，更是**首次系统性**地呈现了中国儿童接受FMT后的**长期随访结果**。
 
-![](../images/16259_3.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16259_3.jpg)
 
 研究发现，FMT在儿科人群中**总体表现安全**，**短期不良事件**(AE)发生率**仅为5.8%**，且大多为**轻微自限性症状**；在**长达122****个月**的随访期内**未观察到长期不良事件**。
 
@@ -33,23 +33,23 @@ scraped: "2026-08-10T07:13:26.632Z"
 
 本文我们来详细了解一下这项研究。
 
-![](../images/16259_4.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16259_4.jpg)
 
 # 研 究 人 群
 
 该研究回顾性分析了**2013年12月~2023年12月**在上海儿童医院接受 FMT 治疗的儿科患者，例如复发性艰难梭菌感染、抗生素腹泻、乙肝、慢性顽固性腹泻、炎症性、慢性肠假性梗阻、自闭症、多动症、神经性厌食症等，详见下表。
 
-![](../images/16259_5.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16259_5.jpg)
 
 doi.org/10.1186/s12866-025-03858-z
 
 **患者特征详细分析**
 
-![](../images/16259_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16259_6.png)
 
 # 研 究 方 法
 
-![](../images/16259_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16259_7.png)
 
 # 研 究 结 论
 
@@ -66,11 +66,11 @@ doi.org/10.1186/s12866-025-03858-z
 - 烦躁（0.4%）
 - 恶心（0.4%）
 
-![](../images/16259_8.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16259_8.jpg)
 
 doi.org/10.1186/s12866-025-03858-z
 
-![](../images/16259_9.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16259_9.jpg)
 
 **2. 给药途径与不良事件关联**
 
@@ -78,13 +78,13 @@ FMT 的给药途径在短期不良事件的发生中起着重要作用。
 
 给药选择包括**上消化道**(UGI)，例如使用鼻胃管或鼻空肠管、内窥镜检查、胶囊，以及**下消化道途径**(LGI)，如保留灌肠、乙状结肠镜检查或结肠镜检查。
 
-![](../images/16259_10.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16259_10.jpg)
 
 与其他途径相比，**胶囊**的短期不良事件**发生率较低**；**鼻胃管**(16.0%，8/50) 和**鼻空肠管**(14.0%，17/121) 的短期不良事件发生率**更高**。
 
 **FMT不同给药方式下的短期不良事件发生率(%)**
 
-![](../images/16259_11.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16259_11.jpg)
 
 **鼻胃管给药**方式下，**呕吐的发生率最高**(12.0%)，是所有给药方式中单一不良事件最高的发生率。
 
@@ -92,19 +92,19 @@ FMT 的给药途径在短期不良事件的发生中起着重要作用。
 
 严重不良事件(呕血、便血)总体发生率**极低**(0.1%-0.2%)。
 
-![](../images/16259_12.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16259_12.jpg)
 
 胶囊形式**安全**也更易于**标准化生产、储存和运输**，有利于FMT治疗的普及和推广。
 
 **3. 疾病类型与不良事件关联**
 
-![](../images/16259_13.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16259_13.png)
 
 提示在产品开发中需**针对IBD患者**群体设计更安全的给药方案。
 
 **4. 长期随访结果**
 
-![](../images/16259_14.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16259_14.jpg)
 
 研究纳入813名患者，平均随访时间达**32.3个月**，最长随访期达**122个月**，形成了一个极具代表性的儿科FMT安全性数据库。
 

docs/菌群知识库/categories/未分类/16905_多巴胺：从肠道到大脑，掌控你奖赏、成瘾与健康的“超级信使”.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "未分类"
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 date: "2026-09-04"
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 ---
 
@@ -17,7 +17,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:08:06.213Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/16905_2.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16905_2.jpg)
 
 早晨闹钟响起时那瞬间的动力、完成任务后的成就感、写完最后一道题的如释重负、品尝美食时的愉悦…这些日常体验背后都有同一个幕后功臣——**多巴胺**。
 
@@ -29,7 +29,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:08:06.213Z"
 
 关于多巴胺的总结：
 
-![](../images/16905_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16905_3.png)
 
 ***1 *****多巴胺是古老的**
 
@@ -107,13 +107,13 @@ scraped: "2026-08-10T07:08:06.213Z"
 
 **多巴胺功能在脊椎动物内部的家族相似性**
 
-![](../images/16905_4.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16905_4.jpg)
 
 DOI: 10.1016/j.cub.2022.06.060
 
 **多巴胺在不同生物中的类似功能**
 
-![](../images/16905_5.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16905_5.jpg)
 
 这种在不同物种中独立演化出**相似结构和功能**的现象，被称为“**趋同演化**”。
 
@@ -121,7 +121,7 @@ DOI: 10.1016/j.cub.2022.06.060
 
 **多巴胺的演化之路清晰可见**
 
-![](../images/16905_6.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16905_6.jpg)
 
 **多巴胺的化学结构**
 
@@ -206,7 +206,7 @@ DOI: 10.1016/j.cub.2022.06.060
 
 **中脑多巴胺神经元的解剖连接**
 
-![](../images/16905_7.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16905_7.jpg)
 
 **G蛋白偶联受体结构**
 
@@ -245,7 +245,7 @@ DOI: 10.1016/j.cub.2022.06.060
 
 在所有接收多巴胺信号的脑区中，纹状体（一个大型的皮层下区域，是基底神经节回路的核心）的神经支配最**为密集**。纹状体中**高达95%**的神经元是所谓的”**纹状体投射神经元**(SPNs)”，它们根据表达的多巴胺受体类型被清晰地分为两大类：
 
-![](../images/16905_8.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16905_8.jpg)
 
 这种受体表达的差异意味着两类神经元对多巴胺信号的”聆听”方式截然不同，从而为多巴胺实现复杂的调控功能提供了基础。
 
@@ -297,7 +297,7 @@ DOI: 10.1016/j.cub.2022.06.060
 
 多巴胺神经元的活动受到大脑内复杂网络的严密调控。它们接收来自局部及长距离投射的密集神经支配，其兴奋或**抑制**状态主要取决于**两大类输入信号的动态平衡**：
 
-![](../images/16905_9.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16905_9.jpg)
 
 这种多层次、多维度的调控机制确保了多巴胺神经元能够精确响应机体内外环境的复杂变化，维持神经系统的动态平衡。
 
@@ -307,7 +307,7 @@ DOI: 10.1016/j.cub.2022.06.060
 
 多巴胺在运动功能中的作用并非直接控制动作的精确性，而是作为一种**“启动器”和“激励器”，**负责**激发**和**维持****自主行为**。
 
-![](../images/16905_10.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16905_10.jpg)
 
 🚀** 多巴胺是行为启动的关键**
 
@@ -331,7 +331,7 @@ DOI: 10.1016/j.cub.2022.06.060
 
 多巴胺的这种激励作用体现在两个时间尺度上：
 
-![](../images/16905_11.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16905_11.jpg)
 
 **学 习**
 
@@ -431,7 +431,7 @@ DOI: 10.1016/j.cub.2022.06.060
 
 🗺️ **多巴胺的工作岗位分布**
 
-![](../images/16905_12.gif)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16905_12.gif)
 
 **– 腹侧纹状体**
 
@@ -497,13 +497,13 @@ DOI: 10.1016/j.cub.2022.06.060
 
 总结来说，普雷沃氏菌和拟杆菌就像多巴胺系统的两个**调节阀：**
 
-![](../images/16905_13.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16905_13.jpg)
 
 这**两类细菌的平衡**，对于维持我们大脑正常的奖赏、动机和运动功能至关重要。**它们的失衡**，可能与多种神经精神疾病的发生密切相关。
 
 **肠道菌群对多巴胺能突触间隙和多巴胺代谢的影响**
 
-![](../images/16905_14.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16905_14.png)
 
 doi： 10.3390/biomedicines10020436
 
@@ -557,7 +557,7 @@ doi： 10.3390/biomedicines10020436
 
 **肠道菌群对多巴胺代谢副产物的影响**
 
-![](../images/16905_15.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16905_15.png)
 
 doi： 10.3390/biomedicines10020436
 
@@ -685,7 +685,7 @@ doi： 10.3390/biomedicines10020436
 
 **微生物在帕金森病中的作用**
 
-![](../images/16905_16.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16905_16.jpg)
 
 doi: 10.3390/biomedicines10020436
 
@@ -705,7 +705,7 @@ doi: 10.3390/biomedicines10020436
 
 谷禾肠道菌群检测报告中的肠型这个指标：其中有一种肠型就是**普雷沃氏菌**肠型。
 
-![](../images/16905_17.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16905_17.png)
 
 <来源：谷禾肠道菌群检测数据库>
 
@@ -746,7 +746,7 @@ D4 受体主要存在于与 ADHD 病因密切相关的关键脑区，特别是**
 
 **ADHD的发育、遗传和环境因素**
 
-![](../images/16905_18.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16905_18.jpg)
 
 doi: 10.12865/CHSJ.51.01.02
 
@@ -918,7 +918,7 @@ doi: 10.12865/CHSJ.51.01.02
 
 在**谷禾肠道菌群检测报告**中，也有**多巴胺**这个指标，这个指标并非直接检测多巴胺浓度，而是基于谷禾自有的“菌群-代谢-神经递质预测算法”得到的评估。
 
-![](../images/16905_19.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/16905_19.jpg)
 
 <来源：谷禾肠道菌群检测数据库>
 

docs/菌群知识库/categories/未分类/3072_最新研究进展 _ 小儿功能性腹痛症.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "未分类"
 categoryId: ""
 tags: ["204", "202", "207", "33", "206", "189", "208", "205", "203", "167"]
 date: "2026-11-23"
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 scraped: "2026-08-10T07:52:28.123Z"
 ---
 
@@ -27,7 +27,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:52:28.123Z"
 
 近日，英国和美国的研究科学家联合发表在《NATURE REVIEWS | DISEASE PRIMERS》上的一篇综述文章题为：“Paediatric functional abdominal pain disorders”（小儿功能性腹痛症）。
 
-![](../images/3072_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3072_2.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/11/1-9.png)
 
@@ -53,7 +53,7 @@ FAPDs的特征通常内脏痛觉过于敏感以及内脏刺激中枢感知增加
 
 风险因素如下：
 
-![](../images/3072_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3072_4.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/11/2-8-1024x979.png)
 
@@ -63,7 +63,7 @@ FAPDs的特征通常内脏痛觉过于敏感以及内脏刺激中枢感知增加
 
 FAPDs是一种复杂的疾病，似乎是由于一个或多个元素的功能和/或更微妙的结构完整性的破坏造成的菌群-肠-脑轴。这些条件下相互作用的复杂性和多面性被整合到一个生物心理社会模型中。
 
-![](../images/3072_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3072_6.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/11/3-11-1024x364.png)
 
@@ -81,7 +81,7 @@ FAPDs是一种复杂的疾病，似乎是由于一个或多个元素的功能和
 
 从本质上讲，这些触发因素可引起粘膜通透性变化并导致炎症，释放促生因子，包括5-羟色胺，组胺，NGF，蛋白酶和前列腺素，它们能够激活传入伤害感受器（痛觉神经）上的受体，引起急性疼痛以及持久的功能和结构改变，这是维持慢性疼痛的关键。
 
-![](../images/3072_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3072_8.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/11/4-10.png)
 
@@ -147,7 +147,7 @@ IBS患者的粪便微生物群的多样性降低或保持不变。粪便微生
 
 # 诊断、筛查和预防
 
-![](../images/3072_10.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3072_10.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/11/5-3-293x1024.jpg)
 
@@ -165,7 +165,7 @@ IBS患者的粪便微生物群的多样性降低或保持不变。粪便微生
 
 3.  一些有效的治疗方法是行为疗法(饮食疗法和心理疗法)，由于缺乏专职医疗保健专业人员以及缺乏保险，这些方法并不容易。
 
-![](../images/3072_12.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3072_12.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/11/6-7-1024x534.png)
 
@@ -173,7 +173,7 @@ IBS患者的粪便微生物群的多样性降低或保持不变。粪便微生
 
 **   饮 食 调 整   **
 
-![](../images/3072_14.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3072_14.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/11/7-3-234x1024.jpg)
 
@@ -239,11 +239,11 @@ IBS或FAP-NOS（n = 412；6-18岁）儿童的5个随机对照试验，无论是
 
 **药 物 疗 法 **
 
-![](../images/3072_16.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3072_16.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/11/8-1-387x1024.jpg)
 
-![](../images/3072_18.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3072_18.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/11/9-5-361x1024.jpg)
 

docs/菌群知识库/categories/未分类/316_谷禾人体肠道_阴道菌群开放基金.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "未分类"
 categoryId: ""
 tags: ["106"]
 date: "2026-05-10"
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 scraped: "2026-08-10T08:02:02.336Z"
 ---
 

docs/菌群知识库/categories/未分类/3415_微生物群也有记忆 _ 微生物群能被“训练”.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "未分类"
 categoryId: ""
 tags: ["324", "323", "322", "207", "325", "245"]
 date: "2026-02-24"
-images: ["../images/3415_1.jpg", "../images/3415_2.png", "../images/3415_3.png"]
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 scraped: "2026-08-10T07:50:58.144Z"
 ---
 
@@ -31,7 +31,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:50:58.144Z"
 
 **肠道微生物群的训练总览**
 
-![](../images/3415_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3415_2.png)
 
 最初的肠道感染后：
 
@@ -89,7 +89,7 @@ Stacy等人通过宏基因组学检测牛磺酸处理过的小鼠微生物组，
 
 原发感染后牛磺酸代谢菌群的扩张增强了对继发感染的定植抗性
 
-![](../images/3415_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3415_3.png)
 
 在原发感染(左)期间，病原体通过有氧发酵利用代谢底物，如1，2-丙二醇。清除感染后，宿主产生的胆汁酸水平增加，可以通过共生微生物群与牛磺酸解偶联。牛磺酸反过来被代谢成硫化物，抑制有氧呼吸，从而增强对继发感染的定植抗性(右)。
 

docs/菌群知识库/categories/未分类/3741_人类肠道核心菌属——韦荣氏球菌属（Veillonella）.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "未分类"
 categoryId: ""
 tags: ["425", "427", "426", "428", "veillonella"]
 date: "2026-04-03"
-images: ["../images/3741_1.jpg", "../images/3741_2.png", "../images/3741_3.jpg", "../images/3741_4.png", "../images/3741_5.png"]
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 scraped: "2026-08-10T07:49:27.733Z"
 ---
 
@@ -25,7 +25,7 @@ Veillonella该属的成员是**非发酵**的，它们**无法使用碳水化合
 
 在动物和人的自然腔道中大量存在，是分布于口腔、咽部、呼吸道、消化道的常见菌群。其**粘附**于表面或**与其他细菌**并形成生物膜的能力对于肠道和口腔微生物群组成和功能至关重要，尤其是在口咽和肠道中。 在一些严重的感染过程中，如菌血症、骨髓炎和心内膜炎，在各种混合感染中起作用。常从软组织脓肿及血液中检出。**青霉素**已被建议作为韦韦氏菌属病原体感染的治疗选择 。
 
-![](../images/3741_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3741_2.png)
 
 # 02 发展史和分类
 
@@ -47,7 +47,7 @@ Veillonella atenty 从人和其他动物来源分离出。
 
 # 03 临床研究结果
 
-![](../images/3741_3.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3741_3.jpg)
 
 **与口腔疾病**
 
@@ -81,7 +81,7 @@ Prevotella  作为革兰氏阴性菌，产生** LPS **进而诱发**炎症反应
 
 Scheiman及其同事发表在《自然医学》（Nature Medicine）上文章研究了肠道微生物组对精英跑步者运动表现的影响，并确定了属于Veillonella属的一种能**增强性能的微生物**。比赛结束后，马拉松长跑运动员中富集了**非典型的Veillonella atypica菌种。**Veillonella 利用乳酸作为碳源, 分析发现乳酸到丙酸的代谢通路的运动后运动员中富集。
 
-![](../images/3741_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3741_4.png)
 
 图片来源：慧跑
 
@@ -99,7 +99,7 @@ Scheiman及其同事发表在《自然医学》（Nature Medicine）上文章研
 
 最新的发表在CELL和谷禾健康2019年发表在GUT上的队列都表明，未来发展为自闭症谱系障碍的儿童早期肠道内Veillonella菌富集，比对照儿童显著增加。
 
-![](../images/3741_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3741_5.png)
 
 **原发性硬化性胆管炎**
 

docs/菌群知识库/categories/未分类/3748_身体气味与菌群——病因和管理.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "未分类"
 categoryId: ""
 tags: ["433", "436", "430", "435", "431", "432", "353", "434", "185", "429"]
 date: "2026-04-03"
-images: ["../images/3748_1.png", "../images/3748_2.png", "../images/3748_3.png", "../images/3748_4.png", "../images/3748_5.png", "../images/3748_6.png", "../images/3748_7.png", "../images/3748_8.png", "../images/3748_10.png"]
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 scraped: "2026-08-10T07:49:24.859Z"
 ---
 
@@ -21,7 +21,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:49:24.859Z"
 
 慢性体臭可能带来许多不便，焦虑，自尊降低和生活质量下降，社交困难，甚至导致严重的心理问题。
 
-![](../images/3748_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3748_2.png)
 
 #### 人为什么会有体味？
 
@@ -35,11 +35,11 @@ scraped: "2026-08-10T07:49:24.859Z"
 
 化合物的过度积累会产生难闻的气味。与体液中细菌代谢物积聚相关的体臭可能由以下一种或多种原因引起：
 
-![](../images/3748_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3748_3.png)
 
 **主要的细菌气味物质及其散发部位**
 
-![](../images/3748_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3748_4.png)
 
 Mogilnickaet al., Int J Mol Sci, 2020
 
@@ -49,7 +49,7 @@ Mogilnickaet al., Int J Mol Sci, 2020
 
 口臭(口腔之味或呼吸之味)是一种以口腔内或口腔外的口臭为特征的疾病。全世界约有20-50%的成人或青少年患有口臭。[更精确的数字，为31.8%（95%可信区间24.6–39.0%）]
 
-![](../images/3748_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3748_5.png)
 
 在绝大多数(80-90%)持续口臭的患者中，口臭的原因是口腔原因，其中**舌苔和牙周病**最为普遍。
 
@@ -65,13 +65,13 @@ Mogilnickaet al., Int J Mol Sci, 2020
 
 **最常见的细菌气味**
 
-![](../images/3748_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3748_6.png)
 
 Mogilnickaet al., Int J Mol Sci, 2020
 
 **与恶臭相关的疾病**
 
-![](../images/3748_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3748_7.png)
 
 Mogilnickaet al., Int J Mol Sci, 2020
 
@@ -237,7 +237,7 @@ Mogilnickaet al., Int J Mol Sci, 2020
 
 **大汗腺**分泌的汗液类似于小汗腺产生的汗液，但其**分泌速率较高**，尤其出现在**腋窝**部位。这些特征使得大汗腺成为腋窝出汗的重要原因。
 
-![](../images/3748_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3748_8.png)
 
 顶泌汗液是无味的，它只有被皮肤表面的微生物分解后才会变得有气味，如微球菌科Micrococcaceae、好氧类白喉菌aerobic diphtheroids 和丙酸杆菌Propionibacteria。
 
@@ -337,7 +337,7 @@ HMHA(以腐臭、奶酪味为特征)是最丰富的。3-甲基-3-磺酰己-1-醇
 
 下表总结了与细菌气味剂有关体味的治疗选择。根据气味类型进行管理：
 
-![](../images/3748_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/3748_10.png)
 
 Mogilnickaet al., Int J Mol Sci, 2020
 

docs/菌群知识库/categories/未分类/4380_生命早期营养和肠道菌群对幼儿大脑和行为发育的影响.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "未分类"
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 tags: ["669", "667", "672", "668", "203"]
 date: "2026-08-05"
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 scraped: "2026-08-10T07:46:36.669Z"
 ---
 
@@ -17,7 +17,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:46:36.669Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/4380_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4380_2.png)
 
 围产期营养是健康生长和长期发育轨迹的**早期决定因素**。关键发育时期的**营养不良**可以**显著**、**持续**地改变许多身体系统的发育过程，包括神经系统。
 
@@ -109,7 +109,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:46:36.669Z"
 
 这些研究强调了营养不良对肠道微生物群的不同影响，并**将其作为机械研究和治疗干预的潜在目标**。
 
-![](../images/4380_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4380_3.png)
 
 ## 03 菌群在围产期营养不良和神经发育中的新作用
 
@@ -139,7 +139,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:46:36.669Z"
 
 **母体肠道微生物群如何介导营养不良****对早期神经发育影响的概念模型**
 
-![](../images/4380_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4380_4.png)
 
 1：营养过剩和不足，以及宏量或微量营养素比例的变化，都会导致妊娠期母体微生物群的紊乱。这些扰动包括特定分类群的多样性和相对丰度的变化。
 

docs/菌群知识库/categories/未分类/4385_什么是军团菌肺炎.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "未分类"
 categoryId: ""
 tags: ["legionella", "673"]
 date: "2026-08-05"
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 scraped: "2026-08-10T07:46:33.810Z"
 ---
 
@@ -17,13 +17,13 @@ scraped: "2026-08-10T07:46:33.810Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/4385_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4385_2.png)
 
-![](../images/4385_3.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4385_3.jpg)
 
 曾经，央视网也有过类似的报道 ↓↓↓
 
-![](../images/4385_4.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4385_4.jpg)
 
 军团菌到底是什么？
 
@@ -35,7 +35,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:46:33.810Z"
 
 ——“军团病”
 
-![](../images/4385_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4385_5.png)
 
 # 军团病
 
@@ -45,7 +45,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:46:33.810Z"
 
 军团菌是一种小型，水性的，未被包裹的芽孢杆菌，**革兰氏阴性菌**，过氧化氢酶呈阳性，**专性需氧菌**。该菌通过雾化水颗粒传播，不会在干燥的表面上存活。
 
-![](../images/4385_6.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4385_6.jpg)
 
 军团菌科有超过42种，其中*嗜肺军团菌L. pneumophila* 是最常见的，已鉴定出嗜肺军团菌的15个血清群，其中血清组1、4和6被确定为人类疾病的病因。血清组1被认为是造成80%报告病例的原因。
 
@@ -55,7 +55,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:46:33.810Z"
 
 最有可能发生感染的情况，包括**淋浴器、水龙头、浴缸、装饰喷泉、游泳池或通过大型建筑(如酒店、办公楼、医院、游轮)通风系统的水滴**。
 
-![](../images/4385_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4385_7.png)
 
 还有当**喝水时咳嗽或意外呛到**，这时候如果吸入的水含有军团菌，那么也有可能发展为军团病或庞蒂亚克热。
 
@@ -71,7 +71,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:46:33.810Z"
 
 嗜肺军团菌是一种**兼性胞内致病菌**。**细胞免疫**在抵抗嗜肺军团菌感染中起着重要的宿主防御作用。
 
-![](../images/4385_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4385_8.png)
 
 图源：M. S. Swanson & B. K. Hammer
 
@@ -98,7 +98,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:46:33.810Z"
 
 一般来说，无论是细菌还是军团病都**不会直接在人与人之间传播**。虽然大量接触可能导致该病暴发，但通常发生在单个、孤立的病例中。
 
-![](../images/4385_9.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4385_9.png)
 
 cdc.gov / legionella
 

docs/菌群知识库/categories/未分类/4404_2型糖尿病如何做到可防可控？肠道菌群发挥重要作用.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "未分类"
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 date: "2026-08-12"
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 scraped: "2026-08-10T07:46:30.978Z"
 ---
 
@@ -21,7 +21,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:46:30.978Z"
 
 截止到2020年，根据美国糖尿病学会评估标准，糖尿病患病率已达到12.8%。其实在我国成年人中，已经有**将近一半**的人存在**血糖异常**，未来极有可能发展为2型糖尿病。如果不加干预治疗，会引发许多不良后果。
 
-![](../images/4404_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4404_2.png)
 
 很多研究表明，肠道菌群在宿主的代谢和疾病状态中起着重要的作用。特别是2型糖尿病，其病因复杂，包括肥胖、慢性低度炎症，受肠道微生物群和微生物代谢产物的调节。
 
@@ -41,11 +41,11 @@ scraped: "2026-08-10T07:46:30.978Z"
 
 刚开始的时候，**胰腺**会觉得自己使不上力，于是不甘心开始**拼命工作**，产生更多的胰岛素来克服这种抵抗。
 
-![](../images/4404_3.gif)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4404_3.gif)
 
 随着时间的推移，胰腺开始累了，力不从心，**不能产生更多的胰岛素**，这时候就是2型糖尿病开始了。
 
-![](../images/4404_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4404_4.png)
 
 # 02 2型糖尿病患者的微生物群
 
@@ -53,7 +53,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:46:30.978Z"
 
 **2型糖尿病人群中个体微生物群的差异**
 
-![](../images/4404_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4404_5.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2021/08/4-1024x965.png)
 
@@ -110,7 +110,7 @@ Cunningham A L et al., Gut Pathog, 2021
 
 **微生物群对葡萄糖稳态的影响**
 
-![](../images/4404_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4404_7.png)
 
 Cunningham A L et al., Gut Pathog, 2021
 
@@ -120,7 +120,7 @@ Cunningham A L et al., Gut Pathog, 2021
 
 这些代谢物主要由微生物群产生，如*Akkermansia、普雷沃氏菌属Prevotella、瘤胃球菌属Ruminococus、粪杆菌属Faecalibacterium、真细菌属Eubacterium、Roseburia、梭菌属Clostridium、拟杆菌属、乳杆菌属、链球菌属、丙酸杆菌属Propionibacterium、梭杆菌属Fusobacterium*。2型糖尿病病患者体内这些特殊微生物群的大部分已经耗尽。
 
-![](../images/4404_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4404_8.png)
 
 Huda MN, et al., Front Endocrinol (Lausanne). 2021
 
@@ -181,7 +181,7 @@ Huda MN, et al., Front Endocrinol (Lausanne). 2021
 
 除了在肠道消化和吸收中的作用外，胆汁酸还具有发挥**激素作用**的重要代谢作用的能力。
 
-![](../images/4404_9.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4404_9.jpg)
 
 Xie C,et al., Nutrients. 2021
 
@@ -217,7 +217,7 @@ IL-6已被确定为2型糖尿病的独立预测因子。它对IRS-1、GLUT4和
 
 **影响肠道微生物群的因素**
 
-![](../images/4404_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4404_10.png)
 
 Huda MN, et al., Front Endocrinol (Lausanne). 2021
 
@@ -255,7 +255,7 @@ Huda MN, et al., Front Endocrinol (Lausanne). 2021
 
 **二甲双胍治疗下的微生物转移有助于改善血糖控制和不良反应**
 
-![](../images/4404_11.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4404_11.png)
 
 Forslund K, et al., Nature. 2015
 
@@ -377,7 +377,7 @@ Forslund K, et al., Nature. 2015
 
 因为某些食物，如碳水化合物，直接影响你的血糖，所以**饮食是控制糖尿病最重要的因素之一**。
 
-![](../images/4404_12.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4404_12.png)
 
 重要的并不是不吃，而是尽可能均衡饮食。
 
@@ -391,7 +391,7 @@ Forslund K, et al., Nature. 2015
 
 按照上述方式吃完饭，如果你还觉得饿，可以再吃一点不含淀粉的蔬菜。重要的是，**一定要慢慢吃，享受食物**。
 
-![](../images/4404_13.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4404_13.png)
 
 餐盘法可以帮助你增加纤维摄入量。富含纤维的食物可以帮助**减缓**血糖上升的速度。让你有**饱腹感**，潜在地**促进减肥**和**提高胰岛素敏感性**。高纤维食物通常富含维生素和矿物质，也可以**增加营养**。
 
@@ -411,13 +411,13 @@ Forslund K, et al., Nature. 2015
 
 **常见运动活动的生理成分**
 
-![](../images/4404_14.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4404_14.png)
 
 Andrew Williams et al., CLINICAL，2021
 
 **运动方式对2型糖尿病患者健康相关结果的影响**
 
-![](../images/4404_15.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4404_15.png)
 
 Andrew Williams et al., CLINICAL，2021
 

docs/菌群知识库/categories/未分类/4420_肠道菌群与睡眠：双向调节.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "未分类"
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 tags: ["lactobacillus-brevis", "395", "691", "688", "309", "687", "686", "692", "203", "689", "153"]
 date: "2026-08-19"
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 scraped: "2026-08-10T07:46:20.919Z"
 ---
 
@@ -19,11 +19,11 @@ scraped: "2026-08-10T07:46:20.919Z"
 
 人一生中平均有三分之一的时间在睡觉。睡眠对于我们是必不可少的存在，它能够促进我们的幸福感。
 
-![](../images/4420_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4420_2.png)
 
 然而目前，睡眠障碍已经成为了一种流行病。尤其是在新冠肺炎流行之后，进一步加剧了睡眠问题。
 
-![](../images/4420_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4420_3.png)
 
 随着睡眠障碍的患病率越来越高，人们开始深入研究——**是什么因素决定了睡眠的质量**？
 
@@ -31,7 +31,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:46:20.919Z"
 
 **图1 各种因素的相互作用影响睡眠质量和持续时间**
 
-![](../images/4420_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4420_4.png)
 
 Sen P, et al.,Trends Mol Med. 2021
 
@@ -51,7 +51,7 @@ Sen P, et al.,Trends Mol Med. 2021
 
 **表1 探索肠道微生物如何影响睡眠的各种研究**
 
-![](../images/4420_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4420_5.png)
 
 Sen P, et al.,Trends Mol Med. 2021
 
@@ -61,7 +61,7 @@ Sen P, et al.,Trends Mol Med. 2021
 
 **图2 影响睡眠的微生物群-肠道-大脑轴交流模式**
 
-![](../images/4420_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4420_6.png)
 
 Sen P, et al.,Trends Mol Med. 2021
 
@@ -103,7 +103,7 @@ Sen P, et al.,Trends Mol Med. 2021
 
 **昼夜节律、肠道微生物群和新陈代谢**
 
-![](../images/4420_7.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4420_7.jpg)
 
 Parkar SG, et al., Microorganisms. 2019
 
@@ -191,7 +191,7 @@ Parkar SG, et al., Microorganisms. 2019
 
 总之，这表明肠道微生物群的变化是某些精神疾病症状的基础。然而，需要进一步的研究来了解这些疾病中肠道微生物群和大脑之间的通讯途径。
 
-![](../images/4420_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/4420_8.png)
 
 肠易激综合征与肠道微生物群
 

docs/菌群知识库/categories/未分类/4746_通知.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "未分类"
 categoryId: ""
 tags: []
 date: "2026-11-01"
-images: []
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/"]
 scraped: "2026-08-10T07:44:25.182Z"
 ---
 

docs/菌群知识库/categories/未分类/5287_慢性肾脏病中的人类微生物组：一把双刃剑.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "未分类"
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 tags: ["tmao", "435", "930", "929", "203", "931"]
 date: "2026-01-21"
-images: ["../images/5287_1.png", "../images/5287_2.png", "../images/5287_3.png", "../images/5287_4.png", "../images/5287_5.png", "../images/5287_6.png"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5287_1.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5287_2.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5287_3.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5287_4.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5287_5.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5287_6.png"]
 scraped: "2026-08-10T07:41:59.119Z"
 ---
 
@@ -17,7 +17,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:41:59.119Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/5287_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5287_2.png)
 
 慢性肾病 (CKD) 影响着全球约 13.4% 的人口，是一个日益严重的全球健康负担。**成人**中，**高血压和糖尿病**是慢性肾病的主要原因，而**先天性肾脏和泌尿生殖道异常**占**儿童**慢性肾病病因的大部分。慢性肾病与心血管疾病、神经系统并发症、不良妊娠结局和高钾血症等严重健康状况的发展有关。在儿童中，慢性肾病会影响神经认知能力、学校表现、成长、生活质量等。
 
@@ -51,7 +51,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:41:59.119Z"
 
 肾脏的存在好处多多。肾可以帮助调控血液稳态，维持电解质平衡，调控全身水平衡，甚至可以产生激素。
 
-![](../images/5287_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5287_3.png)
 
 慢性肾病是一个泛指，包含多种肾功能轻微下降的症状，且肾功能下降和微结构改变持续时间**超过3个月**，而小于3个月的肾功能恶化则是急性肾损伤。
 
@@ -63,7 +63,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:41:59.119Z"
 
 但是呢，由于GFR的测量麻烦、经济与时间成本较高，临床实践中相对较少使用。于是就出现了eGFR（Estimated Glomerular filtering Rate，即估算的肾小球滤过率），临床上一般用这个指标来衡量肾脏的工作情况。可以对慢性肾病患者的疾病严重程度进行分级，分级越高，滤过率越低，病情越严重。
 
-![](../images/5287_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5287_4.png)
 
 慢性肾病的**潜在病因**因**年龄、合并症、急性肾损伤反复发生和蛋白尿水平**而异。
 
@@ -119,7 +119,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:41:59.119Z"
 
 **肠道微生物组与慢性肾脏病之间的关系是双向的**
 
-![](../images/5287_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5287_5.png)
 
 Al Khodor D,* et al., Frontiers in Medicine*,2022
 
@@ -147,7 +147,7 @@ Al Khodor D,* et al., Frontiers in Medicine*,2022
 
 **菌群代谢产物和慢性肾病的关系**
 
-![](../images/5287_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5287_6.png)
 
 Al Khodor D,* et al., Frontiers in Medicine*,2022
 

docs/菌群知识库/categories/未分类/5327_利用酶作为调节肠道微生物群的有力工具.md

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@@ -17,7 +17,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:41:38.682Z"
 
 谷禾健康
 
-![](../images/5327_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5327_2.png)
 
 口服酶可以对肠道微生物群的组成产生深远的影响，并且可以作为一种有吸引力的替代调节剂。
 
@@ -45,7 +45,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:41:38.682Z"
 
 溶菌酶、类溶菌酶糖苷水解酶和细菌噬菌体溶菌酶**直接降解**细菌细胞壁的主要成分**肽聚糖**。
 
-![](../images/5327_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5327_3.png)
 
 Su X, Yao B. *Trends Microbiol. *2022
 
@@ -59,7 +59,7 @@ Su X, Yao B. *Trends Microbiol. *2022
 
 在人类中，食物中约一半的**木聚糖**被肠道微生物木聚糖酶**降解为低聚木糖**，低聚木糖**支持**某些肠道微生物（如拟杆菌、双歧杆菌和乳酸杆菌属）的**生长**。
 
-![](../images/5327_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5327_4.png)
 
 Su X, Yao B. *Trends Microbiol. *2022
 
@@ -75,7 +75,7 @@ Su X, Yao B. *Trends Microbiol. *2022
 
 **群体感应**（QS）是微生物群形成网络的一种方式。通过**感应信号分子**，微生物同步**生成生物膜**并**排出**有毒分子。
 
-![](../images/5327_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5327_5.png)
 
 Su X, Yao B. *Trends Microbiol. *2022
 

docs/菌群知识库/categories/未分类/5560_肠-肝轴：宿主-微生物群相互作用影响肝癌发生.md

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@@ -49,7 +49,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:40:24.086Z"
 
 **图1 微生物与宿主的相互作用调节体内平衡和疾病**
 
-![](../images/5560_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5560_2.png)
 
 关于微生物群在致癌中的作用的研究，最初集中在上皮屏障界面的肿瘤上，如胃癌和结肠癌，但胰腺导管腺癌 (PDAC) 为口腔和肠道微生物群以及癌症相关微生物群的作用提供了很多证据。
 
@@ -139,7 +139,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:40:24.086Z"
 
 **图2 肠肝轴的双向关系调节体内平衡**
 
-![](../images/5560_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5560_3.png)
 
 （A） 粘液从物理上将微生物群与上皮衬里分离，而抗菌肽使内部粘液几乎无菌。（B） 因此，微生物群与宿主之间的相互作用主要是间接的，并由代谢产物介导，这些代谢产物可能穿过粘液和上皮屏障，到达固有层中的免疫细胞和基质细胞，或通过淋巴和血管系统到达肝脏和体循环。（C） 免疫细胞通过产生生长因子和细胞因子来巡逻上皮细胞，并加强上皮和粘液屏障。这些产物对微生物产生选择性压力。（D） 树突状细胞感知环境并诱导T细胞和B细胞反应，从而产生IgA抗体，这些抗体转移到管腔，并通过调节微生物组成和多样性来促进粘膜免疫保护。代谢产物通过（E）肠血管屏障通过门静脉流入肝脏。（F） 在肝窦中，免疫细胞扫描异物。（G） 反过来，肝脏通过释放胆汁酸和其他生物活性介质进入胆道与小肠沟通；这些代谢物可被回肠和大肠末端丰富的微生物群生物转化，部分通过门静脉再循环到肝脏，从而可能影响局部和全身功能。
 
@@ -309,7 +309,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:40:24.086Z"
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2022/04/3-1-1024x917.png)
 
-![](../images/5560_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/5560_5.png)
 
 (A)一些细菌可能会穿透粘液屏障或参与其降解，在某些情况下导致上皮屏障的破坏或破坏，从而允许(B)微生物和微生物代谢物和免疫细胞之间的直接接触，诱导促炎细胞因子的产生和全身传播。粘液/上皮屏障的破坏也可能促进(C)细菌转移到肝脏(D)，这为癌细胞的播散创造了一个有利的生态位。因此，先前划分的细菌和微生物产物的涌入影响了局部肝细胞的基因表达。例如：(E)肝细胞可能表达CXCR1并诱导CRCX2+多形核髓系衍生抑制细胞(PMN-MDSCs)的积累，创造免疫抑制环境促进胆管癌(CCA);(F)激活的肝星状细胞在肝细胞癌(HCC)和癌症转移中发挥多种功能，可能通过CXCL12-CXCR4相互作用破坏肝脏中自然杀伤细胞(NK)的功能，改变NK细胞介导的免疫，促进乳腺向肝脏转移;而(G)其他的肝脏免疫细胞可能通过脂多糖(LPS) – toll样受体4 (TLR4)或脱氧胆酸(DCA) -TLR2调节而被激活，并诱导促进肝细胞癌发生的炎症反应。相比之下，(H)被肠道菌群修饰后的肝脏产生的胆汁酸可能会激活肝脏自然杀伤T细胞(NKTs)在肝脏中的趋化因子依赖性积累，从而控制肿瘤的生长。
 

docs/菌群知识库/categories/未分类/7321_花青素-肠道微生物群-健康轴.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "未分类"
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 **植物性食物中主要花青素的结构**
 
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 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2023/06/1-952x1024.jpeg)
 
@@ -85,9 +85,9 @@ Liang A,et al.*Crit Rev Food Sci Nutr*.2023
 
 **常见水果中的花青素**
 
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@@ -131,7 +131,7 @@ Liang A,et al.*Crit Rev Food Sci Nutr*.2023
 
 **花青素及其衍生物**在人体内的消化吸收发生在**胃、小肠和大肠**中。
 
-![](../images/7321_7.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7321_7.jpg)
 
 Liang A,et al.*Crit Rev Food Sci Nutr*.2023
 
@@ -223,7 +223,7 @@ Caco-2细胞模型还估计，达到**系统循环**的花青素比例约为**
 
 **六种主要花青素及其结肠代谢物**
 
-![](../images/7321_8.jpg)
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@@ -295,9 +295,9 @@ Liang A,et al.*Crit Rev Food Sci Nutr*.2023
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2023/06/6-2-899x1024.jpg)
 
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-![](../images/7321_12.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7321_12.jpg)
 
 Liang A,et al.*Crit Rev Food Sci Nutr*.2023
 
@@ -329,7 +329,7 @@ Liang A,et al.*Crit Rev Food Sci Nutr*.2023
 
 **花青素、其代谢物和肠道微生物群间的相互作用**
 
-![](../images/7321_13.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7321_13.jpg)
 
 Liang A,et al.*Crit Rev Food Sci Nutr*.2023
 

docs/菌群知识库/categories/未分类/7561_抑郁症与肠道微生物群有何关联.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "未分类"
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 date: "2026-07-28"
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 scraped: "2026-08-10T07:30:04.991Z"
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@@ -17,7 +17,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:30:04.991Z"
 
 **谷禾健康**
 
-![](../images/7561_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7561_2.png)
 
 **抑郁症·肠道菌群**
 
@@ -29,7 +29,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:30:04.991Z"
 
 虽然我们目前仍然不完全了解导致抑郁症的原因，一个新的研究领域涉及**微生物群-肠-脑轴，**证明可以控制认知功能。微生物组通过**内分泌、免疫和神经活性**途径影响肠脑通讯。后者包括**微生物源性神经递质**（例如，γ-氨基丁酸、血清素）和代谢物（短链脂肪酸和胆汁酸），以及脑源性神经营养因子。
 
-![](../images/7561_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7561_3.png)
 
 本文我们主要来了解一下关于**抑郁症**与**肠道菌群**之间的关系，它们之间的相互**作用机制**可能涉及肠脑轴、免疫调节、代谢途径、肠漏、神经炎症、HPA轴等多种途径，同时也列举了较多关于抑郁症的**干预措施**，希望为抑郁症的治疗和预防**提供新的视角和方法**。
 
@@ -176,7 +176,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:30:04.991Z"
 
 据报道，另一项全面的 GWAS 研究确定了许多与**血清素功能、昼夜节律和其他神经递质相关的基因**可能是抑郁症的遗传风险因素，如下表：
 
-![](../images/7561_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7561_5.png)
 
 doi.org/10.1016/j.neuron.2014.01.027
 
@@ -226,7 +226,7 @@ doi.org/10.1016/j.neuron.2014.01.027
 
 抑郁症个体与健康对照组相比，微生物群变化的总结如下：
 
-![](../images/7561_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7561_6.png)
 
 Basiji K, *et al., Metab Brain Dis.* 2023
 
@@ -276,7 +276,7 @@ Basiji K, *et al., Metab Brain Dis.* 2023
 
 **微生物群-肠-脑异常导致抑郁症**
 
-![](../images/7561_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7561_7.png)
 
 DOI: 10.1007/978-981-19-7376-5_10
 
@@ -475,7 +475,7 @@ LPS 与 TLR4 结合**激活**免疫细胞，激活NF-κB（一种细胞内信号
 
 **肠道微生物群对多巴胺代谢副产物的影响**
 
-![](../images/7561_8.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7561_8.jpg)
 
 doi: 10.3390/biomedicines10020436
 
@@ -514,7 +514,7 @@ doi: 10.3390/biomedicines10020436
 
 **色氨酸代谢途径的犬尿氨酸**
 
-![](../images/7561_9.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7561_9.png)
 
 DOI: 10.1038/sj.mp.4001600
 
@@ -536,7 +536,7 @@ DOI: 10.1038/sj.mp.4001600
 
 早期生活压力可能使人以后对压力更加敏感。
 
-![](../images/7561_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7561_10.png)
 
 doi.org/10.3389/fneur.2022.1015175
 
@@ -564,7 +564,7 @@ doi.org/10.3389/fneur.2022.1015175
 
 **迷走神经传入将信号从肠道菌群传递到中枢神经系统**
 
-![](../images/7561_11.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7561_11.png)
 
 doi.org/10.3389/fneur.2022.1015175
 
@@ -867,9 +867,9 @@ HPA轴功能障碍已在抑郁症的病因中得到观察。抑郁症患者的**
 
 在另一项研究中，热灭菌的**短双歧杆菌**可以调节肠道菌群成分，从而预防慢性社交失败压力引起的抑郁症状。这种具有功能性食物成分的菌株可以用作新的疗法。
 
-![](../images/7561_12.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7561_12.png)
 
-![](../images/7561_13.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7561_13.png)
 
 编辑​
 
@@ -879,7 +879,7 @@ doi: 10.7759/cureus.40293
 
 每天 5 克的**低聚半乳糖**和 1 克或以下的**二十碳五烯酸**可以有效缓解抑郁症状。虽然 EGCG 具有潜在的抗抑郁特性，但可能需要 3 克/天的较高剂量才能产生显着效果。
 
-![](../images/7561_14.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/7561_14.png)
 
 doi.org/10.3389/fnut.2023.1206468
 

docs/菌群知识库/categories/科普/1015_视频 _ 肠道菌群科普小课堂.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "科普"
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 **No. 8**
 
-![](../images/1015_10.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1015_10.jpg)
 
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docs/菌群知识库/categories/科普/1040_研究速递_微生物群衍生的肽模拟物可导致致命的炎性心肌病.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "科普"
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docs/菌群知识库/categories/科普/1050_肠道微生物群在神经系统疾病中的作用.md

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 scraped: "2026-08-10T08:00:26.756Z"
 ---
 
@@ -14,7 +14,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:00:26.756Z"
 ## 肠道微生物群在神经系统疾病中的作用
 
 						
-![](../images/1050_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1050_2.png)
 
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@@ -36,7 +36,7 @@ APC 长期致力于微生物组的转化应用研究，在多个领域的产业
 
 越来越多的临床和临床前证据表明，**微生物群可能是神经系统疾病**（包括阿尔茨海默病、自闭症谱系障碍、多发性硬化症、帕金森病和中风）**的一个关键易感因素。**横向临床研究正在支持改变微生物组成的概念，这有助于此类疾病的病理生理学。
 
-![](../images/1050_4.jpeg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1050_4.jpeg)
 
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@@ -52,7 +52,7 @@ APC 长期致力于微生物组的转化应用研究，在多个领域的产业
 
 ### 利用人类微生物群的潜在途径
 
-![](../images/1050_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1050_6.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/2潜在途径-1024x824.png)
 
@@ -72,7 +72,7 @@ APC 长期致力于微生物组的转化应用研究，在多个领域的产业
 
 ### 微生物群与大脑之间的通讯途径
 
-![](../images/1050_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1050_8.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/3菌群与大脑通讯-913x1024.png)
 
@@ -92,7 +92,7 @@ APC 长期致力于微生物组的转化应用研究，在多个领域的产业
 
 ### 动物模型中的微生物群、神经发育和神经免疫功能
 
-![](../images/1050_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1050_10.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/4动物模型-1024x849.png)
 
@@ -118,7 +118,7 @@ APC 长期致力于微生物组的转化应用研究，在多个领域的产业
 
 值得注意的是，饮食的多样性与肠道微生物的多样性相关，人们吃加工食品，平淡的食物(通常是在养老院)减少了微生物的多样性，而饮食中富含水果和蔬菜的人肠道微生物群的多样性更多。因此，**肠道微生物群的多样性是健康老龄化的潜在标志**。
 
-![](../images/1050_12.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1050_12.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/5衰老-1024x480.jpg)
 
@@ -138,17 +138,17 @@ APC 长期致力于微生物组的转化应用研究，在多个领域的产业
 
 鉴于肠道微生物对免疫系统的发育和成熟至关重要，那么要说这些微生物群与多发性硬化（一种免疫介导的神经系统疾病）的发病机制有关也并不奇怪。
 
-![](../images/1050_14.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1050_14.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/6多发性硬化.png)
 
 横向研究主要显示，与无自身免疫疾病的健康儿童相比，在患有多发性硬化的儿童中，在2年内多发性硬化的儿童与年龄为18岁的健康儿童相比，在2年内多发性硬化的儿童中观察到细微的、离散的分类变化，而不是多尺度差异（描述不同样本之间的变异性的统计）。
 
-![](../images/1050_16.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1050_16.png)
 
-![](../images/1050_17.png)
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-![](../images/1050_18.png)
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 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/7多发性硬化表1-878x1024.png)
 
@@ -174,9 +174,9 @@ APC 长期致力于微生物组的转化应用研究，在多个领域的产业
 
 许多横向研究显示自闭症谱系障碍患者的微生物群组成发生了改变。然而，这些研究大多相对较小且不均匀，并不总是考虑饮食，也不能监测疾病进展的变化。动物研究有助于提供一个机械的理解微生物群如何可能在自闭症谱系障碍中发挥作用。
 
-![](../images/1050_22.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1050_22.png)
 
-![](../images/1050_23.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1050_23.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/10自闭症表1-719x1024.png)
 
@@ -188,7 +188,7 @@ APC 长期致力于微生物组的转化应用研究，在多个领域的产业
 
 此外，一些肠道微生物群落易受万古霉素的影响，而万古霉素能促进炎症状态，这与自闭症谱系障碍有关。
 
-![](../images/1050_26.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1050_26.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/12自闭症.png)
 
@@ -200,7 +200,7 @@ APC 长期致力于微生物组的转化应用研究，在多个领域的产业
 
 α突触核蛋白，是大脑帕金森氏病病理学的标志性蛋白质聚集体，也已在帕金森综合症患者的粘膜和粘膜下神经纤维和神经节中被发现，一些临床前证据甚至表明α-突触核蛋白可以通过迷走神经将肠道中的蛋白转运到大脑。淀粉样蛋白可由菌群产生，并已被证明可增加老年大鼠的α-突触核蛋白病理学。
 
-![](../images/1050_28.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1050_28.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/13帕金森.jpg)
 
@@ -208,11 +208,11 @@ APC 长期致力于微生物组的转化应用研究，在多个领域的产业
 
 越来越多的研究显示帕金森病患者的微生物群组成发生了变化。然而还需谨慎，因为这些数据主要来自于小群体，不能提供纵向视角。
 
-![](../images/1050_30.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1050_30.png)
 
-![](../images/1050_31.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1050_31.png)
 
-![](../images/1050_32.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1050_32.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/14帕金森表1-729x1024.png)
 
@@ -228,7 +228,7 @@ APC 长期致力于微生物组的转化应用研究，在多个领域的产业
 
 然而，要证明阿尔茨海默病患者的神经炎症和神经变性有感染的原因，这在逻辑上和道德上都是很有挑战性的。
 
-![](../images/1050_36.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1050_36.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/17阿尔茨海默.jpg)
 
@@ -236,9 +236,9 @@ APC 长期致力于微生物组的转化应用研究，在多个领域的产业
 
 横向研究表明，阿尔茨海默病患者粪便样本中**与炎症介导有关的大肠杆菌和志贺氏菌类群**与健康人相比有所增加。此外，阿尔茨海默病患者的微生物群变化与未刺激和未离心血液中的**促炎细胞因子浓度**有关。
 
-![](../images/1050_38.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1050_38.png)
 
-![](../images/1050_39.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1050_39.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/18阿尔茨海默表1-938x1024.png)
 
@@ -246,7 +246,7 @@ APC 长期致力于微生物组的转化应用研究，在多个领域的产业
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/20轻度认知障碍表直接跟阿尔茨海默后面-1024x693.png)
 
-![](../images/1050_43.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1050_43.png)
 
 促炎性大肠杆菌和志贺氏菌数量增加，抗炎性大肠杆菌数量减少可能与认知障碍和脑淀粉样变性患者的外周炎症状态有关，提示**微生物群失调与全身炎症**之间存在联系，后者可能引发或加剧阿尔茨海默病患者大脑中的神经变性。
 
@@ -260,7 +260,7 @@ APC 长期致力于微生物组的转化应用研究，在多个领域的产业
 
 横向研究报告了与健康、无症状对照个体相比，中风患者的微生物组成失调。**肠道菌群代谢产物三甲胺N-氧化物与主要不良心血管事件、妊娠糖尿病、和阿尔茨海默病的风险增加相关**，表明通过肠道微生物群的调节治疗疾病治疗的可能性。
 
-![](../images/1050_44.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1050_44.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/21中风与脑损伤表-1024x436.png)
 
@@ -268,7 +268,7 @@ APC 长期致力于微生物组的转化应用研究，在多个领域的产业
 
 此外，将中风模型的粪便微生物菌群移植到无菌小鼠中，或将中风患者移植到经过抗生素处理的小鼠中，均加重了缺血性脑病引起的脑损伤体积和功能性缺损。
 
-![](../images/1050_46.png)
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 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/22-1-1024x528.png)
 
@@ -284,7 +284,7 @@ APC 长期致力于微生物组的转化应用研究，在多个领域的产业
 
 与其他疾病相比，与癫痫、肌萎缩性侧索硬化和亨廷顿病相关的微生物群证据要少得多。不过这些领域的研究人员和临床医生也开始关注微生物群在这些疾病中调节生理和行为的**潜力**。
 
-![](../images/1050_48.jpg)
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 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/23癫痫-1024x777.jpg)
 
@@ -296,7 +296,7 @@ APC 长期致力于微生物组的转化应用研究，在多个领域的产业
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/24癫痫表-1024x774.png)
 
-![](../images/1050_51.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1050_51.png)
 
 肌萎缩侧索硬化：
 
@@ -306,7 +306,7 @@ APC 长期致力于微生物组的转化应用研究，在多个领域的产业
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/25肌萎缩-1024x450.png)
 
-![](../images/1050_53.png)
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 亨廷顿病：
 
@@ -348,7 +348,7 @@ Claesson M J, Jeffery I B, Conde S, et al. Gut microbiota composition correlates
 
 Burokas A, Arboleya S, Moloney R D, et al. Targeting the microbiota-gut-brain axis: prebiotics have anxiolytic and antidepressant-like effects and reverse the impact of chronic stress in mice[J]. Biological psychiatry, 2017, 82(7): 472-487.
 
-![](../images/1050_54.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1050_54.jpg)
 
 **谷禾健康 **是谷禾面向健康领域的品牌，通过无创采集微量粪便样品，常温快递运输至谷禾检测中心，经全自动化样品处理和提取后大规模高通量测序获取菌群基因数据并进行分析解读，凭借全球领先的样本积累和业界独有的人工智能算法实现了基于肠道菌群的疾病预测和系统健康风险评估, 以及肠道菌群，病原物感染，重金属污染以及营养物质和激素代谢水平等在内的综合健康风险提示，并提供精准个性化的健康管理方案。公司成立于2012年，总部位于杭州，拥有优秀的研发团队和独立实验室，经过多年的积累，已完成近6万例临床肠道菌群样本检测，并构建了超过20万各类人群样本数据库。
 

docs/菌群知识库/categories/科普/1052_一文涵盖：宝宝大脑发育差异背后肠道菌群的故事.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "科普"
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 tags: ["77"]
 date: "2026-12-02"
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 ---
 
@@ -43,7 +43,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:00:06.828Z"
 
 假设来自微生物群的信号对于某些功能是必需的，就像预期的输入来校准微生物-肠-脑轴。因此，在特定发育窗期内，微生物群的缺失或破坏将对特定功能产生不相称的影响，这些功能与破坏的时间窗相关，并可能对整个系统的调节产生不相称的影响。
 
-![](../images/1052_2.png)
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@@ -51,7 +51,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:00:06.828Z"
 
 此外，外部线索，如饮食变化和暴露于环境微生物，可被视为发展中的微生物群的预期输入（见上图）。多个敏感期可能发生在整个微生物-肠-脑轴的发展过程中，正如神经发育每个领域内有多个敏感期（见下图）。
 
-![](../images/1052_4.png)
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@@ -109,7 +109,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:00:06.828Z"
 
 之前的文章有详细介绍肠道微生物群调控社会行为的生物学途径。
 
-![](../images/1052_6.png)
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@@ -167,7 +167,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:00:06.828Z"
 
 目前，微生物-肠道-脑轴内存在许多已知的通信途径，包括迷走神经、HPA轴、脊髓、免疫系统和代谢产物的外周传输等。这些已在其他地方详细阐述。在这里就提供一个简短的和简单的概述，其中一些路径与一个具体的发展重点(见下图)。
 
-![](../images/1052_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1052_8.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/4-8-1024x765.png)
 
@@ -175,7 +175,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:00:06.828Z"
 
 之前的文章有详细介绍微生物群与大脑之间的通讯途径。
 
-![](../images/1052_10.png)
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 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/5-14-913x1024.png)
 
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 之前的文章有详细介绍血脑屏障如何连接菌群和大脑。
 
-![](../images/1052_12.png)
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 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/6-9-1024x688.png)
 
@@ -313,7 +313,7 @@ scraped: "2026-08-10T08:00:06.828Z"
 
 Caitlin S. M. Cowan,Timothy G. Dinan,John F. Cryan. “Annual Research Review: Critical windows – the microbiota-gut-brain axis in neurocognitive development”.*The Journal of Child Psychology and Psychiatry,*2019
 
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 **谷禾健康**是谷禾面向健康领域的品牌，通过无创采集微量粪便样品，常温快递运输至谷禾检测中心，经全自动化样品处理和提取后大规模高通量测序获取菌群基因数据并进行分析解读，凭借全球领先的样本积累和业界独有的人工智能算法实现了基于肠道菌群的疾病预测和系统健康风险评估, 以及肠道菌群，病原物感染，重金属污染以及营养物质和激素代谢水平等在内的综合健康风险提示，并提供精准个性化的健康管理方案。公司成立于2012年，总部位于杭州，拥有优秀的研发团队和独立实验室，经过多年的积累，已完成近6万例临床肠道菌群样本检测，并构建了超过20万各类人群样本数据库。
 

docs/菌群知识库/categories/科普/1062_肠道尿路病原体丰富度是细菌尿和尿路感染发生的危险因素.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "科普"
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 tags: ["76"]
 date: "2026-12-10"
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 scraped: "2026-08-10T08:00:01.028Z"
 ---
 
@@ -50,7 +50,7 @@ rRNA基因深度测序，以评估肠道微生物区系与未来细菌尿和UTI
 
 1. 评估了与菌尿相关的五个最丰富的肠道菌属相对丰度和各自菌尿组的时间动态。菌尿组中的肠道中大肠杆菌和肠球菌相对丰度显著高于无菌尿组中的。
 
-![](../images/1062_2.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1062_2.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2019/12/x1-1024x665.png)
 
@@ -58,7 +58,7 @@ rRNA基因深度测序，以评估肠道微生物区系与未来细菌尿和UTI
 
 2. 1%大肠杆菌肠道中相对丰度与大肠杆菌菌尿的未来发展相关(HR2.8，P=0.002)。1%肠球菌肠道中相对丰度与肠球菌菌尿的未来发展相关(HR：2.4，P=0.01)。
 
-![](../images/1062_4.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1062_4.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2019/12/x2.png)
 
@@ -67,7 +67,7 @@ rRNA基因深度测序，以评估肠道微生物区系与未来细菌尿和UTI
 3.
 菌种分析中发现大肠杆菌、粪肠球菌、屎肠球菌这三种菌株，在部分同一受试者的粪便样本和菌尿样本中密切相关。在对大肠杆菌相关的尿路感染致病基因和抗生素耐药基因的评估中发现在配对的尿液和粪便标本中都存在这些基因。这支持来自相同受试者的尿液和肠道大肠杆菌菌株的相似性。
 
-![](../images/1062_6.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1062_6.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2019/12/x3-1024x764.png)
 

docs/菌群知识库/categories/科普/1070_细菌和病毒从母亲到婴儿的不一致传播.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "科普"
 categoryId: "7"
 tags: ["75"]
 date: "2026-12-13"
-images: ["../images/1070_2.jpg", "../images/1070_4.png", "../images/1070_6.png", "../images/1070_8.png", "../images/1070_10.png", "../images/1070_12.png"]
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 scraped: "2026-08-10T07:59:59.668Z"
 ---
 
@@ -19,7 +19,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:59.668Z"
 
 [在婴儿出生的最初几天，婴儿肠道微生物群的一部分可以追溯到多种母体来源，包括阴道、皮肤、口腔和肠道微生物群。然而，在这些来源中，在母亲肠道中发现的细菌定植是长期坚持的主要驱动力。](https://www.jianshu.com/writer)[事实上，](https://www.jianshu.com/writer)[通过垂直传播的细菌（如双歧杆菌、瘤胃球菌、粪球菌）在婴儿肠道中进行接种会导致转录活性定植。](https://www.jianshu.com/writer)婴儿肠道所经历的这[种](https://www.jianshu.com/writer)一生一次的生态转变对于塑造婴儿的生长、抵抗感染力量、校准炎症和调节免疫功能产生持久和重要的影响。但是对于婴儿肠道早期病毒定植以及垂直传播是否起作用，人们知之甚少。
 
-![](../images/1070_2.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1070_2.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2019/12/Snipaste_2019-12-13_15-20-28-1024x541.jpg)
 
@@ -39,7 +39,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:59.668Z"
 
 **1  婴儿双胞胎及其母亲的肠道细菌微生物组**
 
-![](../images/1070_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1070_4.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/2-8.png)
 
@@ -63,7 +63,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:59.668Z"
 
 **表明：**双胞胎之间的距离与接合性没有差异（附加文件  [1](https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-019-0766-7#MOESM2)：图S1F），表明年龄和环境暴露是细菌群落的更重要决定因素。
 
-![](../images/1070_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1070_6.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/3-8.png)
 
@@ -83,7 +83,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:59.668Z"
 
 **2 婴儿双胞胎及其母亲的肠道病毒**
 
-![](../images/1070_8.png)
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 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/4-7.png)
 
@@ -105,7 +105,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:59.668Z"
 
 **这些数据表明**，年龄相关的病毒学差异很大（即标本来自成人还是婴儿），这可能会使相关母婴对之间家族关系的评估混淆。
 
-![](../images/1070_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1070_10.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/5-12.png)
 
@@ -125,7 +125,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:59.668Z"
 
 **三 分娩途径影响细菌与噬菌体之间的跨异界相互作用**
 
-![](../images/1070_12.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1070_12.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/6-8-1024x464.png)
 

docs/菌群知识库/categories/科普/1074_微生物，或许是下一个癌中之王（胰腺癌）诊断和干预治疗的新出路.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "科普"
 categoryId: "7"
 tags: ["74"]
 date: "2026-12-23"
-images: ["../images/1074_1.png", "../images/1074_3.png", "../images/1074_4.gif", "../images/1074_6.png", "../images/1074_8.png", "../images/1074_10.png", "../images/1074_12.png", "../images/1074_13.png", "../images/1074_16.png", "../images/1074_19.png", "../images/1074_21.png", "../images/1074_24.jpg", "../images/1074_26.png", "../images/1074_28.png", "../images/1074_30.jpg", "../images/1074_32.png", "../images/1074_34.jpg"]
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 scraped: "2026-08-10T07:59:57.178Z"
 ---
 
@@ -16,7 +16,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:57.178Z"
 						
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/1-3-582x1024.png)
 
-![](../images/1074_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1074_3.png)
 
 这样令人惋惜的事在医院悄然发生着…
 
@@ -32,7 +32,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:57.178Z"
 
 随着现代医学的不断发展，对胰腺癌的研究也有了许多新的方向。近年来的研究表明，胰腺癌的发展可能与微生物群密切相连。
 
-![](../images/1074_4.gif)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1074_4.gif)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/2-2.gif)
 
@@ -48,7 +48,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:57.178Z"
 
 Thomas R M, Jobin C., Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology, 2019
 
-![](../images/1074_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1074_6.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/3-7-557x1024.png)
 
@@ -60,7 +60,7 @@ Thomas R M, Jobin C., Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology, 2019
 
 **图1 胰腺细菌移位和宿主稳态反应的模型**
 
-![](../images/1074_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1074_8.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/4-6-1024x742.png)
 
@@ -92,7 +92,7 @@ AMPs是否调节胰腺微生物群尚不清楚，但最终可能通过AMP产生
 
 慢性胰腺炎是一种长期或反复的炎症过程，同时伴有急性发作的后遗症。
 
-![](../images/1074_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1074_10.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/5-11.png)
 
@@ -118,9 +118,9 @@ AMPs是否调节胰腺微生物群尚不清楚，但最终可能通过AMP产生
 
 **表2 微生物群在胰腺癌中作用的人体研究**
 
-![](../images/1074_12.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1074_12.png)
 
-![](../images/1074_13.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1074_13.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/6-7-644x1024.png)
 
@@ -132,7 +132,7 @@ Wang Y, et al.,Molecular Cancer, 2019
 
 **图2 微生物在胰腺癌的发展和治疗中起重要作用**
 
-![](../images/1074_16.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1074_16.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/7-8-1024x619.png)
 
@@ -154,7 +154,7 @@ Wang Y, et al.,Molecular Cancer, 2019
 
 **图3 菌群与胰腺癌发生的关系**
 
-![](../images/1074_19.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1074_19.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/8-9-870x1024.png)
 
@@ -168,7 +168,7 @@ Thomas R M, Jobin C., Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology, 2019
 
 **图4 微生物与胰腺癌的发生有关**
 
-![](../images/1074_21.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1074_21.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/9-5.png)
 
@@ -186,7 +186,7 @@ Wang Y, et al.,Molecular Cancer, 2019
 
 肥胖通过改变脂肪细胞因子、脂联素、脱氧胆酸和许多其他分子之间的相互作用而影响胰腺肿瘤的进展。此外，肠道微生物群也被认为在连接肥胖和胰腺癌方面发挥着重要作用。
 
-![](../images/1074_24.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1074_24.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/10-1.jpg)
 
@@ -200,7 +200,7 @@ Ren等人证明，胰腺癌患者具有比健康对照更多的LPS产生菌，
 
 **图5 肠道微生物群与1型糖尿病发病的相互作用**
 
-![](../images/1074_26.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1074_26.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/11-3-912x1024.png)
 
@@ -224,7 +224,7 @@ TLR4途径通过连接蛋白MYD88和TRIF，被认为是一种抑制T1DM发生的
 
 **图6 调节微生物群对胰腺疾病影响的临床研究领域**
 
-![](../images/1074_28.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1074_28.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/12-4-798x1024.png)
 
@@ -234,7 +234,7 @@ Thomas R M, Jobin C., Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology, 2019
 
 微生物群在胰腺癌中的应用提供了潜在的治疗选择，例如产生生物标记物或微生物特征来预测对新辅助治疗和辅助治疗的反应。
 
-![](../images/1074_30.jpg)
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 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/13-1-1024x576.jpg)
 
@@ -256,7 +256,7 @@ Thomas R M, Jobin C., Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology, 2019
 
 通过对菌群 16S rDNA 的测序，Geller等人证明，与胰腺肿瘤相关的大多数菌群是γ-变形菌，包括肠杆菌和假单胞菌种。这些微生物可能会产生胞核嘧啶核苷脱氨酶，导致吉西他滨的降解和耐药。此外，通过间接增强这些药物的脱氨作用，由支原体产生的嘧啶核苷磷酸化酶（PyNP）也对化疗药物的治疗功效产生不利影响。用PyNP去除天然嘧啶核苷尿苷、2′-脱氧尿苷和胸腺嘧啶核苷，抑制吉西他滨脱氨反应。
 
-![](../images/1074_32.png)
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 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/14-4-1024x623.png)
 
@@ -278,7 +278,7 @@ Thomas R M, Jobin C., Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology, 2019
 
 总之，这些研究表明不同的微生物可以在胰腺癌肿瘤微环境中发挥不同的作用。今后的研究应集中于特定类别的微生物，以提供联合抗生素与PD-1治疗的理论基础。
 
-![](../images/1074_34.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1074_34.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/15-2-1024x683.jpg)
 

docs/菌群知识库/categories/科普/1077_肠道微生物群调节树突状细胞抗原递呈及放射治疗诱导的抗肿瘤免疫反应.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "科普"
 categoryId: "7"
 tags: ["73"]
 date: "2026-12-23"
-images: ["../images/1077_2.jpg", "../images/1077_4.jpg", "../images/1077_6.jpg", "../images/1077_8.jpg", "../images/1077_9.jpg", "../images/1077_11.jpg", "../images/1077_13.jpg"]
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 scraped: "2026-08-10T07:59:43.555Z"
 ---
 
@@ -19,7 +19,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:43.555Z"
 
 由于肠道菌群会影响T细胞和其他免疫细胞亚群的功能，无论是在肠道相关的淋巴样组织（GALT）内还是在肠道菌群之外，微生物群衍生的信号已被证明在多种疾病的调节及其调控中具有广泛的作用。近日，来自《The Journal of Clinical Investigation》一篇研究结果：“[Gut microbiota modulate dendritic cell antigen presentation and radiotherapy-induced antitumor immune response](https://link.zhihu.com/?target=https%3A//doi.org/10.1172/JCI124332)”（肠道微生物群调节树突状细胞抗原递呈及放射治疗诱导的抗肿瘤免疫反应）指出肠道微生物群可以被调节用于改善放疗介导的抗肿瘤反应。并提示了一种新的机制，即消除产生短链脂肪酸的细菌有助于提高万古霉素和放疗介导的抗肿瘤疗效，这同时伴随肿瘤微环境的重塑以及肿瘤中抗原提呈和细胞毒性T细胞浸润的增加。
 
-![](../images/1077_2.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1077_2.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/1-2.png)
 
@@ -61,7 +61,7 @@ TC-1细胞在37°C的5%二氧化碳中增殖；B16-OVA细胞在添加了10%胎
 
 **1. **口服万古霉素治疗可以增强临床前的黑色素瘤和肺/宫颈肿瘤模型中低分割放疗的抗肿瘤作用。
 
-![](../images/1077_4.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1077_4.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/2-7.png)
 
@@ -75,7 +75,7 @@ E)和F)分别来自B16-OVA黑色素瘤模型的受辐射原发肿瘤和未受辐
 
 **2.**万古霉素治疗增加了因放疗产生的肿瘤细胞溶解CD8+T细胞的数量。在CD8耗尽的小鼠中，万古霉素的作用被消除。万古霉素通过一种需要细胞溶解CD8+T细胞群的机制来增强放疗介导的全身抗肿瘤效应。
 
-![](../images/1077_6.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1077_6.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/3-6.png)
 
@@ -87,7 +87,7 @@ C).CD8耗尽小鼠的肿瘤生长率。在联合治疗前耗尽小鼠内的CD8+
 
 **3.**联合治疗的抗肿瘤作用是依赖于IFN-γ水平的。万古霉素重塑了肿瘤微环境，增加了肿瘤浸润的OVA特异性CD8+T细胞的功能，而IFN-γ是增强放疗诱导的抗肿瘤免疫效应所必需的组分。
 
-![](../images/1077_8.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1077_8.jpg)
 
 A).放疗后5天B16-OVA黑色素瘤模型中原发肿瘤的Ifng mRNA表达水平。与单独放疗组或单独万古霉素治疗组相比，联合治疗组的Ifng mRNA表达水平显著增加（P=0.0131、 P=0.0293）。
 
@@ -99,7 +99,7 @@ D).联合治疗对Ifng基因敲除小鼠（Ifng-KO）的抗肿瘤作用消失。
 
 **4. **万古霉素治疗增加了肿瘤局部TAA（肿瘤相关抗原）交叉呈递，促进了抗原特异性T细胞对肿瘤的识别
 
-![](../images/1077_9.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1077_9.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/5-10.png)
 
@@ -117,7 +117,7 @@ F). 将单独放疗或联合治疗的B16-OVA模型下的小鼠肿瘤分离并与
 
 **5. **肠道细菌产生的短链脂肪酸在体外削弱了抗原提呈细胞活性，干扰了交叉启动的活性，在体内消除在放疗中万古霉素增强的抗肿瘤作用。
 
-![](../images/1077_11.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1077_11.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/6-6.png)
 
@@ -135,7 +135,7 @@ F).肿瘤内抗原特异性T细胞的百分比。经C4处理的联合治疗组
 
 **6. **万古霉素处理改变了短链脂肪酸浓度和细菌群落组成。万古霉素治疗优先针对革兰氏阳性细菌群体，包括丁酸盐产生菌，并降低粪便和组织样本中的短链脂肪酸浓度。
 
-![](../images/1077_13.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1077_13.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/7-7.png)
 

docs/菌群知识库/categories/科普/1079_富含梭菌的微生物群促进腹泻型肠易激综合征胆汁酸排泄.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "科普"
 categoryId: "7"
 tags: ["72"]
 date: "2026-12-23"
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 scraped: "2026-08-10T07:59:40.554Z"
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docs/菌群知识库/categories/科普/1081_如何有针对性的进食或者补充膳食纤维.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "科普"
 categoryId: "7"
 tags: ["67"]
 date: "2026-12-24"
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 scraped: "2026-08-10T07:59:38.040Z"
 ---
 
@@ -49,11 +49,11 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:38.040Z"
 
 短链脂肪酸在生理上影响结肠粘膜的血流、液体和电解质的吸收、自主神经系统和肠道激素的分泌等。
 
-![](../images/1081_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1081_2.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/1-1-850x1024.png)
 
-![](../images/1081_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1081_4.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/2-4-1024x781.png)
 
@@ -61,7 +61,7 @@ Rivière A, *et al*. *Frontiers in microbiology*, 2016
 
 既然膳食纤维能通过肠道菌群的代谢产生短链脂肪酸，而短链脂肪酸对人体健康又有如此重要的作用。看到这里，你是不是想立刻补充一点膳食纤维？先别急，我们再来看一组数据。
 
-![](../images/1081_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1081_6.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/3-4.png)
 
@@ -77,7 +77,7 @@ Lily在没有做过检测的时候认为，自己平常有留意到人体需要
 
 以上，我们不难发现，在了解需要补充膳食纤维的基础上，如果你能更深入了解一些关于膳食纤维如何通过菌群产生短链脂肪酸，这些短链脂肪酸到底是如何产生作用等等知识，你就会更加科学合理地补充你需要的营养。
 
-![](../images/1081_8.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1081_8.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/4-1024x683.jpg)
 
@@ -87,7 +87,7 @@ Lily在没有做过检测的时候认为，自己平常有留意到人体需要
 
 不同的膳食纤维经人体肠道菌群代谢后会产生不同量的短链脂肪酸，其中乙酸：丙酸：丁酸的比例和所需时间也有所不同。详见下表：
 
-![](../images/1081_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1081_10.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/5-6-632x1024.png)
 
@@ -97,7 +97,7 @@ Lily在没有做过检测的时候认为，自己平常有留意到人体需要
 
 我们找了相关数据，下表是已报道过的成人粪便中单个SCFAs（乙酸、丙酸、丁酸）的浓度。
 
-![](../images/1081_12.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1081_12.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/6-2-597x1024.png)
 
@@ -105,7 +105,7 @@ Ohira H,*et al.*, *Journal of atherosclerosis and thrombosis*, 2017
 
 下表是一些病人的SCFA浓度及比例的相关数据。
 
-![](../images/1081_14.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1081_14.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/7-4-1024x852.png)
 
@@ -115,7 +115,7 @@ Ohira H,*et al.*, *Journal of atherosclerosis and thrombosis*, 2017
 
 **短链脂肪酸评估表**
 
-![](../images/1081_16.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1081_16.png)
 
 可以看到这位检测者（还是Lily的检测报告）的丙酸是缺乏的，那么就需要相应的选择促进丙酸代谢的菌。如：芒果、高粱、小米、黑麦、荞麦、姜黄等食物就可以促进丙酸代谢菌的生长。
 
@@ -127,7 +127,7 @@ Ohira H,*et al.*, *Journal of atherosclerosis and thrombosis*, 2017
 
 **碳水化合物发酵和细菌交叉喂养合成SCFA途径**
 
-![](../images/1081_17.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1081_17.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/9-3-1024x671.png)
 
@@ -137,7 +137,7 @@ Rowland I *et al. European journal of nutrition*, 2018
 
 接下来，我们通过下表来看看哪些菌群通过什么途径会产生短链脂肪酸（乙酸、丙酸）。
 
-![](../images/1081_19.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1081_19.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/10-2-1024x817.png)
 
@@ -157,7 +157,7 @@ Ohira H, *et al*, *Journal of atherosclerosis and thrombosis*, 2017
 
 丁酸的产生会降低pH值，可防止肠道中诸如肠球菌和大肠杆菌等病原性微生物的生长。
 
-![](../images/1081_21.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1081_21.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/11-2.png)
 
@@ -167,7 +167,7 @@ Ohira H, *et al*, *Journal of atherosclerosis and thrombosis*, 2017
 
 **四种丁酸产生途径的示意图**
 
-![](../images/1081_23.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1081_23.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/12-3-1024x827.png)
 
@@ -187,7 +187,7 @@ Anand S, *et al*. *Frontiers in microbiology*, 2016
 
 多元分析结果如下：
 
-![](../images/1081_25.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1081_25.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/13-3-1024x403.png)
 
@@ -197,7 +197,7 @@ Anand S, *et al*. *Frontiers in microbiology*, 2016
 
 研究人员对所有已测序的细菌基因组（如前所述）进行了四种不同丁酸生产途径的基因组挖掘。在将健康和患病数据集中显示不同丰度的属映射到每个基因组中丁酸产生途径时，观察到不同的分布。
 
-![](../images/1081_27.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1081_27.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/14-2-1024x536.png)
 
@@ -217,7 +217,7 @@ Anand S, *et al*. *Frontiers in microbiology*, 2016
 
 因此，本研究表明，**病原体保留了导致有害氨释放的丁酸途径，这可能会对肠道完整性造成损害，从而导致病原体入侵的可能性更高**。
 
-![](../images/1081_29.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1081_29.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/15-1-1024x554.png)
 
@@ -233,7 +233,7 @@ Anand S, *et al*. *Frontiers in microbiology*, 2016
 
 丁酸对人体这么重要，你可能会想知道怎样获取。**目前的策略通常是补充益生菌和益生元**。
 
-![](../images/1081_31.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1081_31.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/16-1024x373.jpg)
 
@@ -301,7 +301,7 @@ Anand S, *et al*. *Frontiers in microbiology*, 2016
 
 我们的检测报告中也有相应的食物和益生元的推荐。
 
-![](../images/1081_33.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1081_33.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/18-1-1024x946.png)
 
@@ -315,7 +315,7 @@ Anand S, *et al*. *Frontiers in microbiology*, 2016
 
 一些益生元比如说：菊粉，在许多蔬果中（洋葱、天冬、菊芋、大蒜、小麦、香蕉等）都有不同含量的存在。如果需要补充，可以选择所需膳食成分相应含量高的食物。
 
-![](../images/1081_35.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1081_35.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/19-2-1024x187.png)
 
@@ -331,7 +331,7 @@ Anand S, *et al*. *Frontiers in microbiology*, 2016
 
 每个人的菌群结构，营养状况等各方面都不尽相同，只有在选择对自己真正有益的食物或者益生菌补充剂的基础上，精准干预，才能更有针对性，有效地改善健康状况。
 
-![](../images/1081_37.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1081_37.png)
 
 **谷禾健康 **是谷禾面向健康领域的品牌，通过无创采集微量粪便样品，常温快递运输至谷禾检测中心，经全自动化样品处理和提取后大规模高通量测序获取菌群基因数据并进行分析解读，凭借全球领先的样本积累和业界独有的人工智能算法实现了基于肠道菌群的疾病预测和系统健康风险评估, 以及肠道菌群，病原物感染，重金属污染以及营养物质和激素代谢水平等在内的综合健康风险提示，并提供精准个性化的健康管理方案。公司成立于2012年，总部位于杭州，拥有优秀的研发团队和独立实验室，经过多年的积累，已完成近6万例临床肠道菌群样本检测，并构建了超过20万各类人群样本数据库。
 

docs/菌群知识库/categories/科普/1086_饮食习惯与疾病风险.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "科普"
 categoryId: "7"
 tags: ["64"]
 date: "2026-12-31"
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 scraped: "2026-08-10T07:59:29.359Z"
 ---
 
@@ -25,7 +25,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:29.359Z"
 
 饮食是多种癌症的一个公认的危险因素。
 
-![](../images/1086_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1086_2.png)
 
 对个别营养素或植物化学物质的研究可以揭示某些饮食因素与癌症风险之间的联系。
 
@@ -53,7 +53,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:29.359Z"
 
 **表1 关于各种先验饮食模式和指标及其相应组成部分**
 
-![](../images/1086_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1086_3.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/1-877x1024.png)
 
@@ -61,15 +61,15 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:29.359Z"
 
 一般认为，先验饮食模式比后验饮食模式更容易在不同研究和人群之间进行比较，因为成分是预先确定的，而不是从研究人群分布中得出的。然而，先验方法在膳食成分的数量、FFQ中包含的与成分相关的食品和饮料的数量以及用于描述依从性的阈值（临界点）的研究之间可能有很大的不同。例如，MDS中使用的临界点基于特定人群的中位数摄入量，因此，尽管MDS被认为是一个先验指标，因为组成部分是预先确定的，但得分取决于所研究的人群；然而，其他具有固定切点的得分可能允许在人群之间进行更稳健的比较。
 
-![](../images/1086_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1086_6.png)
 
-![](../images/1086_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1086_7.png)
 
-![](../images/1086_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1086_8.png)
 
-![](../images/1086_9.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1086_9.png)
 
-![](../images/1086_10.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1086_10.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/3-2-695x1024.png)
 
@@ -81,7 +81,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:29.359Z"
 
 **名 词 预 习**
 
-![](../images/1086_15.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1086_15.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/8-2-1024x629.png)
 
@@ -91,7 +91,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:29.359Z"
 
 **后验饮食模式与癌症风险**
 
-![](../images/1086_17.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1086_17.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/9-1-839x1024.png)
 
@@ -105,7 +105,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:29.359Z"
 
 **主成分分析雷达图**
 
-![](../images/1086_19.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1086_19.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/10-1024x896.png)
 
@@ -123,7 +123,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:29.359Z"
 
 许多病例-对照研究和队列研究以及这些研究的系统审查和 Meta 分析研究了各种后验饮食模式与癌症风险之间的相关性。一项关于后验饮食模式（分组为“健康”或“不健康”）和癌症风险的93项研究的全面系统审查和 Meta 分析报告如下：
 
-![](../images/1086_21.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1086_21.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/11-1024x396.png)
 
@@ -141,7 +141,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:29.359Z"
 
 **先验饮食模式与癌症风险**
 
-![](../images/1086_23.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1086_23.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/12-1-1024x906.png)
 
@@ -169,7 +169,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:29.359Z"
 
 世卫组织健康饮食指标是一个基于国际慢性病预防指南的七分制评分。在欧洲对癌症和营养的前瞻性调查(EPIC-nl)研究中，它与英国人乳腺癌风险无关，它与总体癌症风险或与吸烟或酒精相关的癌症风险无关。
 
-![](../images/1086_25.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1086_25.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/13.jpg)
 
@@ -199,7 +199,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:29.359Z"
 
 **地中海替代饮食评分**系统则将水果和坚果分开，去除乳制品，只包括全谷物 (而不是所有谷类) 以及红色和加工肉类 (而不是所有肉类) (见表1)。
 
-![](../images/1086_27.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1086_27.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/14-1024x640.jpg)
 
@@ -219,7 +219,7 @@ WCRF/AICR推荐以植物为基础的饮食，重点是全谷类、蔬菜、水
 
 在一项系统审查中，与非素食者相比，素食主义者(RR0.92，95%CI 0.87-0.98)和素食者(RR 0.85，95% CI 0.75-0.95) 患癌症的风险降低，而与乳腺癌发病率无关(RR 0.94，95%CI 0.84-1.06)。
 
-![](../images/1086_29.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1086_29.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/15-1-1024x671.jpg)
 
@@ -245,7 +245,7 @@ WCRF/AICR推荐以植物为基础的饮食，重点是全谷类、蔬菜、水
 
 **基于生物过程的饮食模式与癌症风险的关系**
 
-![](../images/1086_31.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1086_31.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/16-1-1024x892.png)
 
@@ -269,7 +269,7 @@ OBS与乳腺癌和结直肠癌的风险降低相关，而与前列腺癌的相
 
 **胰岛素和胰岛素样生长因子调节碳水化合物和能量代谢，与癌症风险有关**。新出现的证据将生酮饮食(碳水化合物含量低，脂肪含量高)与癌症预防联系起来。生酮饮食将每日碳水化合物的摄取量限制在20-50克/天，这导致胰岛素分泌减少，并通过脂肪酸转化为酮体来转化为脂肪氧化燃料。
 
-![](../images/1086_33.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1086_33.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/17-1.png)
 
@@ -289,9 +289,9 @@ RRR通常使用一个中间标记，首先根据其解释标记变化的能力
 
 **a. 下图说明了在绝经后妇女的前瞻性队列研究中，用于建立与雌激素代谢物相关的饮食模式的降秩回归过程。**
 
-![](../images/1086_35.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1086_35.png)
 
-![](../images/1086_36.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1086_36.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/18-1024x417.png)
 
@@ -319,7 +319,7 @@ RRR通常使用一个中间标记，首先根据其解释标记变化的能力
 
 **饮食与癌症关系的潜在机制**
 
-![](../images/1086_39.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1086_39.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/20-1-1024x405.png)
 

docs/菌群知识库/categories/科普/1099_拟杆菌预防肺炎克雷伯菌定殖和传播.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "科普"
 categoryId: "7"
 tags: ["62"]
 date: "2026-03-10"
-images: ["../images/1099_1.png", "../images/1099_2.png", "../images/1099_3.jpg", "../images/1099_4.png", "../images/1099_5.png", "../images/1099_6.png", "../images/1099_7.png", "../images/1099_9.png", "../images/1099_11.png", "../images/1099_13.png", "../images/1099_14.png", "../images/1099_15.png", "../images/1099_16.png", "../images/1099_17.png", "../images/1099_21.png", "../images/1099_23.png", "../images/1099_24.png", "../images/1099_27.png", "../images/1099_28.png", "../images/1099_30.png", "../images/1099_32.png", "../images/1099_33.png", "../images/1099_34.png", "../images/1099_35.png", "../images/1099_37.png", "../images/1099_39.png", "../images/1099_40.png", "../images/1099_42.png"]
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 scraped: "2026-08-10T07:59:12.806Z"
 ---
 
@@ -17,7 +17,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:12.806Z"
 
 [谷禾健康](https://www.guhejk.com/) 原创
 
-![](../images/1099_2.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1099_2.png)
 
 微生物群是免疫防御的原动力，但是防止感染的特定共生微生物的特性尚不清楚。相对的，病原体如何与其他微生物群落竞争以建立其宿主生态位也鲜为人知。
 
@@ -47,7 +47,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:12.806Z"
 
 其中肺炎克雷伯氏菌丰度占比**超过1%的人群有3765例，占比28.2%。**
 
-![](../images/1099_3.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1099_3.jpg)
 
 **预 告**
 
@@ -67,11 +67,11 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:12.806Z"
 
 **图1：成年微生物菌群可抵抗抗生素抗性肺炎克雷伯菌在肠中的定植，但不能防止上呼吸道定植。**
 
-![](../images/1099_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1099_4.png)
 
-![](../images/1099_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1099_5.png)
 
-![](../images/1099_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1099_6.png)
 
 上呼吸道定植数据显示为红色，肠道定植数据显示为蓝色。所有统计比较均使用Mann-Whitney（双尾）进行；水平线表示中值；ND，未检出（肺炎克雷伯菌的检出限在粪便中= 10 3  cfu g -1）。
 
@@ -101,7 +101,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:12.806Z"
 
 **图 非抗生素处理、抗生素处理和共生联合体接种小鼠粪便中的细菌负荷和组成**
 
-![](../images/1099_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1099_7.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/3-3-1024x425.png)
 
@@ -109,17 +109,17 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:12.806Z"
 
 **图2：肠内的拟杆菌属可以预防肺炎克雷伯菌的定殖。**
 
-![](../images/1099_9.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1099_9.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/4-1-1-1024x212.png)
 
-![](../images/1099_11.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1099_11.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/4-2-1-1024x312.png)
 
-![](../images/1099_13.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1099_13.png)
 
-![](../images/1099_14.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1099_14.png)
 
 所有的统计比较都是用Kruskal-Wallis检验和Dunn对多重比较的修正进行的。水平线表示中值。
 
@@ -137,11 +137,11 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:12.806Z"
 
 **图3 拟杆菌通过IL-36信号和巨噬细胞保护肺炎克雷伯菌在肠道的定植。**
 
-![](../images/1099_15.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1099_15.png)
 
-![](../images/1099_16.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1099_16.png)
 
-![](../images/1099_17.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1099_17.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/5-1-3-1024x425.png)
 
@@ -157,7 +157,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:12.806Z"
 
 **图 变形菌在定植过程中恢复了上气道的稳态IL-17A生成和肺炎克雷伯菌诱导的上气道TNF生成**
 
-![](../images/1099_21.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1099_21.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/6-1-1024x275.png)
 
@@ -169,15 +169,15 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:12.806Z"
 
 **图4 拟杆菌需要它们的ccf来防止肺炎克雷伯菌在肠内的定植。**
 
-![](../images/1099_23.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1099_23.png)
 
-![](../images/1099_24.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1099_24.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/7-1-1-1024x288.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/7-2-1-1024x281.png)
 
-![](../images/1099_27.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1099_27.png)
 
 研究人员测试了假单胞菌抑制肺炎克雷伯菌定植所需的CCF的假设。与此一致，具有完整的CCF系统的拟杆菌属或单个拟杆菌属物种可以预防肺炎克雷伯菌的细菌定植和主要肠道IL-36γ的产生，但是在没有CCF的情况下会消失，并且可以通过CCF的互补来重新建立（图4a–g）。
 
@@ -197,19 +197,19 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:12.806Z"
 
 **图5 变形菌通过IL-17A启动上呼吸道防御，但包封可以使肺炎克雷伯菌克服这些防御。**
 
-![](../images/1099_28.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1099_28.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/8-1-1-1024x438.png)
 
-![](../images/1099_30.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1099_30.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/8-2-1-1024x543.png)
 
-![](../images/1099_32.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1099_32.png)
 
-![](../images/1099_33.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1099_33.png)
 
-![](../images/1099_34.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1099_34.png)
 
 下一步，研究人员确定包封是否允许肺炎克雷伯菌抵抗上呼吸道内的直接微生物竞争，或通过免疫系统间接影响微生物群。为了解决这一问题，他们将微生物群转移回经地塞米松或载体控制治疗的微生物群衰竭的动物，然后再经鼻腔给药肺炎克雷伯菌。
 
@@ -217,7 +217,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:12.806Z"
 
 **图 微生物群启动上呼吸道免疫，但封装使肺炎克雷伯菌克服这些防御**
 
-![](../images/1099_35.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1099_35.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/9-2-1024x315.png)
 
@@ -249,11 +249,11 @@ IL-17A的破坏，而不是IFN-γ或IL-36R信号的破坏，抑制了微生物
 
 **图 接触小鼠肺炎克雷伯菌的耐药谱与对照小鼠肺炎克雷伯菌的耐药谱一致**
 
-![](../images/1099_37.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1099_37.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/10-1-1024x375.png)
 
-![](../images/1099_39.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1099_39.png)
 
 其次，在共寄居之前，将保护性拟杆菌属共接种到肺炎克雷伯菌定殖的新生指数小鼠和幼稚的新生接触小鼠中。这足以阻止宿主之间的肺炎克雷伯菌传播。为了检查传播是否需要与动物直接接触，将成年接触者关在先前装有肠道定殖的索引小鼠的笼子中。尽管在饲养前已从笼子中取出所有的索引小鼠和粪便材料，但所有接触的小鼠都被肺炎克雷伯菌定殖，这表明**传播不需要动物之间或同食性的直接接触。**
 
@@ -279,7 +279,7 @@ IL-17A的破坏，而不是IFN-γ或IL-36R信号的破坏，抑制了微生物
 
 **肺炎克雷伯氏菌肠道感染人群菌群构成**
 
-![](../images/1099_40.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1099_40.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/11-1.png)
 
@@ -289,7 +289,7 @@ IL-17A的破坏，而不是IFN-γ或IL-36R信号的破坏，抑制了微生物
 
 进一步使用MaAslin2进行检验肺炎克雷伯氏菌与其他菌属，结果如下：
 
-![](../images/1099_42.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1099_42.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/12-2-885x1024.png)
 

docs/菌群知识库/categories/科普/1102_欧洲拟南芥群落根系微生物群的组装与适应性分化.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "科普"
 categoryId: "7"
 tags: ["63"]
 date: "2026-03-10"
-images: ["../images/1102_2.gif", "../images/1102_4.jpg", "../images/1102_6.jpg", "../images/1102_8.jpg", "../images/1102_11.png", "../images/1102_12.jpg", "../images/1102_14.jpg", "../images/1102_16.jpg"]
+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1102_2.gif","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1102_4.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1102_6.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1102_8.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1102_11.png","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1102_12.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1102_14.jpg","https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1102_16.jpg"]
 scraped: "2026-08-10T07:59:04.101Z"
 ---
 
@@ -21,7 +21,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:04.101Z"
 
 近日，一篇发表于《Nature Ecology & Evolution》来自德国科隆马克斯普朗克植物育种研究所关于拟南芥最新研究成果：Root microbiota assembly and adaptive differentiation among European Arabidopsis populations（欧洲拟南芥群落根系微生物群的组装与适应性分化），探索了这一问题。该研究表明土壤和气候条件对根系微生物群落中的细菌和真菌的分化有不同的控制作用，气候是土壤中真菌位点变异和地理分布的关键驱动因素，而土壤细菌的地理分布主要受土壤因素的控制。气候的差异比土壤和本地微生物群的差异更重要。
 
-![](../images/1102_2.gif)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1102_2.gif)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/1-2.gif)
 
@@ -49,7 +49,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:04.101Z"
 
 1. **17个欧洲拟南芥种群中的微生物群落结构。表明根环境促使欧洲各地的细菌群落组成趋同。**
 
-![](../images/1102_4.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1102_4.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/2.jpeg)
 
@@ -63,7 +63,7 @@ d). 基于从17个地点、4个采样部位和连续三年(2015年、2016年和2
 
 2.**大陆尺度中，少数地理上广泛分布的细菌丰富地定殖在拟南芥的根部，推动了细菌群落组成的趋同。**
 
-![](../images/1102_6.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1102_6.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/3.jpeg)
 
@@ -77,13 +77,13 @@ d).在拟南芥根部检测到的分布广泛的细菌和真菌的OTUs的比例
 
 3. **少量地理上分布广泛的细菌可以有效地在远亲植物的根系微生物群落中定殖，并随着进化时间的推移与植物根系微生物群落建立稳定的联系。**拟南芥和禾本植物之间的群落组成差异较小。
 
-![](../images/1102_8.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1102_8.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/4-1.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/5-9-984x1024.png)
 
-![](../images/1102_11.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1102_11.png)
 
 a).基于Bray-Curtis距离的禾本植物和拟南芥的细菌、真菌、卵菌群落的种分类水平的PCoA图。观察到拟南芥和共生牧草在微生物群落组成上的差异较小。
 
@@ -93,11 +93,11 @@ c).共生牧草根系中广泛存在的拟南芥根系OTUs在细菌群落中占
 
 4.**大陆尺度中影响拟南芥根系微生物群落的因素。**不同地点间环境条件的变化比时间变化对根系相关微生物群落的影响更大
 
-![](../images/1102_12.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1102_12.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/6-1.jpg)
 
-![](../images/1102_14.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1102_14.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/7.jpg)
 
@@ -109,7 +109,7 @@ c). 在每个位置测量的环境变量或共线变量组对细菌、真菌和
 
 5. **土壤、气候和基因型的差异驱动了拟南芥种群间根系微生物群落的分化；与细菌相比，气候条件等特定位置因素对根相关真菌群落分化的影响更大。**土壤条件的差异对拟南芥种群间的适应性分化贡献较小
 
-![](../images/1102_16.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1102_16.jpg)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/8-8-1024x467.png)
 

docs/菌群知识库/categories/科普/1104_炎症性肠病中宿主与微生物群的相互作用.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "科普"
 categoryId: "7"
 tags: ["61"]
 date: "2026-03-10"
-images: ["../images/1104_2.jpg", "../images/1104_3.png", "../images/1104_5.png", "../images/1104_7.png", "../images/1104_9.png", "../images/1104_11.png", "../images/1104_13.png", "../images/1104_15.png", "../images/1104_17.png", "../images/1104_19.png", "../images/1104_21.png"]
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 scraped: "2026-08-10T07:59:01.695Z"
 ---
 
@@ -17,7 +17,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:01.695Z"
 
 炎症性肠病（IBD）是一种慢性且易复发的肠道炎症性疾病。全球500多万人受其困扰。
 
-![](../images/1104_2.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1104_2.jpg)
 
 这种疾病是由多种遗传和环境因素共同作用引起的，这些因素改变了肠道的稳态，从而引发了基因易感个体的免疫介导炎症反应。
 
@@ -27,7 +27,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:01.695Z"
 
 虽然克罗恩病和溃疡性结肠炎的发病机制都涉及肠道炎症，但这两种疾病在几个方面有所不同，包括与特定易感位点的关系、与疾病相关的免疫反应和病理类型。
 
-![](../images/1104_3.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1104_3.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/2-5-1024x515.png)
 
@@ -37,7 +37,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:59:01.695Z"
 
 IBD的一个关键特征是肠道微生物群失调，然而，失调在疾病中的确切作用仍然鲜为人知。
 
-![](../images/1104_5.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1104_5.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/3-5-1024x576.png)
 
@@ -65,7 +65,7 @@ IBD的一个关键特征是肠道微生物群失调，然而，失调在疾病
 
 在**大肠**中，有两个明显不同的粘液层：
 
-![](../images/1104_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1104_7.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/4-1-2-1024x377.png)
 
@@ -93,7 +93,7 @@ IBD的一个关键特征是肠道微生物群失调，然而，失调在疾病
 
  **图1 粘膜防火墙**
 
-![](../images/1104_9.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1104_9.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/5-8-1024x733.png)
 
@@ -203,7 +203,7 @@ Toll样受体（TLR）：
 
 **图2  炎症性肠病粘膜防火墙的破裂**
 
-![](../images/1104_11.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1104_11.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/6-5-1024x777.png)
 
@@ -287,7 +287,7 @@ NOD2将克罗恩病相关蛋白ATG16L1募集到细菌进入部位的质膜上，
 
 **图3 共生体的有益作用。**
 
-![](../images/1104_13.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1104_13.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/7-6-1024x665.png)
 
@@ -323,7 +323,7 @@ Treg细胞起源于两种不同的个体遗传谱系：
 
 **图4 调节性T细胞支持肠道稳态**
 
-![](../images/1104_15.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1104_15.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/8-7-1024x746.png)
 
@@ -413,7 +413,7 @@ IBD患者肠道病毒组的宏基因组测序显示，与对照组相比，Caudo
 
 图5 炎症性肠病中的生态失调
 
-![](../images/1104_17.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1104_17.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/9-4-1024x892.png)
 
@@ -449,7 +449,7 @@ IBD患者常检测到T细胞和抗体对微量双抗原的反应增强，进一
 
 **图6 微生物治疗在炎症性肠病中的作用**
 
-![](../images/1104_19.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1104_19.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/10-3-1024x635.png)
 
@@ -509,7 +509,7 @@ Rossen等人的一项双盲，随机，安慰剂对照研究未观察到FMT对
 
 在未来，一旦确认了引起IBD的微生物代谢途径，就有可能用新一代抗生素专门针对它们。
 
-![](../images/1104_21.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1104_21.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/13-4-1024x576.png)
 

docs/菌群知识库/categories/科普/1106_细菌的天敌抗生素，如何利用这把救命的双刃剑？.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "科普"
 categoryId: "7"
 tags: ["60"]
 date: "2026-03-10"
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 scraped: "2026-08-10T07:58:55.260Z"
 ---
 
@@ -17,7 +17,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:58:55.260Z"
 
 本文原创：[谷禾健康](http://www.guhejk.com/)
 
-![](../images/1106_2.gif)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1106_2.gif)
 
 头痛，喉咙痛，咳嗽，流涕…不管什么症状，先吃上阿莫西林再说。感冒还没正式开始，抗生素却已经吃上了。
 
@@ -77,7 +77,7 @@ scraped: "2026-08-10T07:58:55.260Z"
 
 以上这段话为了便于理解，我们还是要从微生物说起。相信微生物这个概念对于熟悉我们公众号的你，并不陌生。
 
-![](../images/1106_3.gif)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1106_3.gif)
 
 我们经常强调，它们的无处不在，存在于环境，也存在于人们体内。这些细菌并不是闲着，每天会干很多事，诸如帮助消化，合成维生素，促进营养吸收等。
 
@@ -101,17 +101,17 @@ scraped: "2026-08-10T07:58:55.260Z"
 
 早在现代医学出现之前，抗生素已经使用了很长一段时间。自古埃及以来，人们就知道面包对治疗伤口和烧伤有效果，而面包上生长着丝状真菌。
 
-![](../images/1106_4.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1106_4.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/3-1-1024x767.png)
 
 往后几十年是抗生素发现的黄金时代，发现了多种抗生素，具体每种抗生素的发现时间及来源详见下表。
 
-![](../images/1106_6.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1106_6.png)
 
-![](../images/1106_7.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1106_7.png)
 
-![](../images/1106_8.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1106_8.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/4-1-784x1024.png)
 
@@ -133,13 +133,13 @@ Durand G A,*et al*, 2019
 
 根据**抗菌谱**可分为**窄谱 **和**广谱 **两大类，如下：
 
-![](../images/1106_12.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1106_12.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/7-1-1024x380.png)
 
 根据**化学分子结构**，可大致分为以下类别，列出的是该类别具有代表性的抗生素。
 
-![](../images/1106_14.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1106_14.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/8-1-1024x666.png)
 
@@ -147,7 +147,7 @@ Durand G A,*et al*, 2019
 
 总的来说，抗生素的作用原理有以下三种。
 
-![](../images/1106_16.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1106_16.png)
 
 一：它们**进攻的是细菌制造细胞壁所需要的部件**。一旦细胞壁受损，细菌细胞就会死亡。比如**青霉素**就巧妙地利用了这个特点。
 
@@ -205,7 +205,7 @@ Durand G A,*et al*, 2019
 
 # 抗生素耐药性
 
-![](../images/1106_17.gif)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1106_17.gif)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/10.gif)
 
@@ -223,7 +223,7 @@ Durand G A,*et al*, 2019
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/11.gif)
 
-![](../images/1106_20.gif)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1106_20.gif)
 
 超级细菌的抗性机制可以通过**获得基因来介导，使他们能够在抗生素或基因突变的作用下存活下来**，作为自然选择过程的一部分进化而来。
 
@@ -237,7 +237,7 @@ Durand G A,*et al*, 2019
 
 一种细菌对一种特定抗生素的固有抗性是由于其**固有的结构或功能特性**而产生的对该抗生素作用的抵抗能力。
 
-![](../images/1106_21.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1106_21.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/12-1024x591.png)
 
@@ -289,7 +289,7 @@ Muloi及其同事的一项Meta分析表明，**动物和人类之间的抗药性
 
 案例一：5岁儿童，服用抗生素半年，他的肠道菌群检测报告显示：
 
-![](../images/1106_23.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1106_23.png)
 
 可以看到，这位5岁的小朋友已经出现抗生素耐药性高风险（红色为高风险状态）。
 
@@ -297,11 +297,11 @@ Muloi及其同事的一项Meta分析表明，**动物和人类之间的抗药性
 
 肠道菌群总体状况也提示**菌群多样性减少，菌种数量减少**。
 
-![](../images/1106_24.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1106_24.png)
 
 尤其是**有益菌**数量的下降。
 
-![](../images/1106_25.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1106_25.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/15-1024x853.png)
 
@@ -321,7 +321,7 @@ Muloi及其同事的一项Meta分析表明，**动物和人类之间的抗药性
 
 **抗生素引起的肠道菌群失调及其在疾病中的作用**
 
-![](../images/1106_27.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1106_27.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/16-1024x602.png)
 
@@ -331,23 +331,23 @@ Muloi及其同事的一项Meta分析表明，**动物和人类之间的抗药性
 
 这是该患者的健康总分：29分。属于不健康状态。（注：总分100分制，一般健康人或亚健康普遍能在60分以上）
 
-![](../images/1106_29.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1106_29.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/17.png)
 
 我们来看他的抗生素风险评估部分：
 
-![](../images/1106_31.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1106_31.png)
 
 报告显示他的氯霉素类耐药风险高。再看肠道菌群的总体状况如下：
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/19.png)
 
-![](../images/1106_33.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1106_33.png)
 
 提示**菌群多样性缺乏，有益菌数量明显下降**。说明其菌群紊乱。而疾病风险评估这部分则显示了多种疾病**高风险**状态。尤其是代谢系统方面的疾病。
 
-![](../images/1106_34.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1106_34.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/20.png)
 
@@ -363,7 +363,7 @@ Muloi及其同事的一项Meta分析表明，**动物和人类之间的抗药性
 
 肠道微生物群在生命的最初几年发展，**影响免疫系统的成熟**。儿童期和成年期的抗生素治疗可能导致某些个体**长期破坏生态系统**，减少细菌多样性，导致群落不稳定，并对宿主生理产生负面影响。
 
-![](../images/1106_36.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1106_36.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/21.png)
 
@@ -417,7 +417,7 @@ Thiemann S,*et al*, 2016
 
 一项关于在英国成人中根除幽门螺杆菌的研究包括以下根除方案：柠檬酸雷尼替丁铋400毫克和克拉霉素500毫克，每日两次，为期两周。这项研究显示，**治疗后体重显著增加**。阿莫西林对体重增加的影响有两项研究。
 
-![](../images/1106_38.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1106_38.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/25-1024x264.png)
 
@@ -565,7 +565,7 @@ IBD患者肠道宏基因组包含的基因比健康的肠道少**25%**，蛋白
 
 阿莫西林在治疗简单的尿路感染时也表现出抗粪肠球菌的活性，但考虑到大肠杆菌和肠杆菌科菌株的高耐药率，阿莫西林并未广泛用于这些病原体。
 
-![](../images/1106_40.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1106_40.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/26-1024x366.png)
 
@@ -585,7 +585,7 @@ IBD患者肠道宏基因组包含的基因比健康的肠道少**25%**，蛋白
 
 链霉素是一种蛋白质合成抑制剂和杀菌抗生素。它与细菌核糖体30s亚基的小16Sr RNA结合，导致密码子误读和抑制蛋白质合成。
 
-![](../images/1106_42.png)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1106_42.png)
 
 ![](http://www.guhejk.com/wordpress/wp-content/uploads/2020/03/27.png)
 
@@ -607,7 +607,7 @@ IBD患者肠道宏基因组包含的基因比健康的肠道少**25%**，蛋白
 
 与前一代相比，头孢菌素的渐进世代在革兰氏阴性抗菌特性方面表现出渐进性的改善，通常对革兰氏阳性生物体的活性降低。
 
-![](../images/1106_44.jpg)
+![](https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1106_44.jpg)
 
 **第一代头孢菌素**
 

docs/菌群知识库/categories/科普/1109_怀孕期间母体肠道微生物分子保护后代免受代谢性疾病的影响.md

@@ -6,7 +6,7 @@ category: "科普"
 categoryId: "7"
 tags: ["59"]
 date: "2026-03-12"
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+images: ["https://cfc.s3.cn-north-1.jdcloud-oss.com/kb-images/1109_1.jpg"]
 scraped: "2026-08-10T07:58:31.184Z"
 ---